Вернуться назад

Набор для прямого секвенирования кДНК, Direct cDNA Sequencing Kit, Oxford Nanopore Technologies

Артикул Цена, вал. Наличие на складе Количество
SQK-DCS109
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу По запросу Под заказ

Описание
Оплата и доставка
Direct cDNA Sequencing Kit — набор для прямого секвенирования кДНК. Набор предназначен для секвенирования РНК через стадию синтеза кДНК без стадии ПЦР. С помощью набора Direct DNA Sequencing Kit можно:

  • идентифицировать полноразмерные транскрипты и анализировать их количество;
  • исследовать дифференциальную экспрессию генов;
  • характеризовать транскрипционные изоформы, варианты с альтернативным спласингом и фьюжн-транскрипты;
  • секвенировать полноразмерные кДНК без артефактов, вносимых на стадии ПЦР.
В состав набора входит Pro Flow Cell Priming Kit для загрузки библиотек в ячейку, совместимый с ячейками для PromethION

Особенности набора:

время пробоподготовки

от 270 минут

требуемое количество ДНК

100 нг полиА + РНК


необходимость обратной транскрипции

да

необходимость ПЦР

нет

длина рида

равна длине полных транскриптов

производительность

до 2 гигабаз за 6 часов, до 8 гигабаз и более за 48 часов


число ридов

5-10 миллионов полноразмерных кДНК

мультиплексирование

до 12 образцов, с Native Barcoding Expansion Pack 1-12 или 13-24

совместимые протоколы

Direct cDNA sequencing

количество библиотек

6

совместимость с проточными ячейками

FLO-MIN106D; FLO-PRO002 (PromethION)


Набор рассчитан на работу с поли-А+ РНК, но возможно также использование РНК со специфическими 3’-концевыми последовательностями (например, вирусной РНК). Для этого необходимы олигонуклеотиды, комплементарные этим последовательностям. Пробоподготовка заключается в синтезе комплементарной цепи кДНК с помощью обратной транскрипции. Обогащение библиотеки полноразмерными копиями происходит за счёт переключения цепей при обратной транскрипции (strand-switching). Затем цепь РНК расщепляется, и достраивается вторая цепь кДНК. Сиквенсные адаптеры лигируются на двухцепочечную кДНК (в нанопоры может проходить любая из цепей кДНК).

При работе с Direct cDNA Sequencing Kit предусмотрена возможность мультиплексирования с помощью наборов Native Barcoding Expansion 1-12 (EXP-NBD104) или Native Barcoding Expansion 13-24 (EXP-NBD105). В одну библиотеку может быть загружено до 12 образцов кДНК.

Дополнительные расходные материалы и реактивы:

  • магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
  • набор для достройки концов ДНК NEBNext End repair / dA-tailing Module (New England Biolabs E7546);
  • набор для лигирования NEB Blunt/TA Ligase Master Mix (New England Biolabs M0367);
  • 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 0030108051);
  • 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Axygen PCR-02-C);
  • вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher Scientific R0581);
  • свежеприготовленный 70 % этанол;
  • 10 мМ раствор dNTP (Thermo Fisher Scientific R0191);
  • обратная транскриптаза Maxima H Minus (Thermo Fisher Scientific EP0751);
  • ингибитор РНКаз RNAseOUT (Thermo Fisher Scientific 10777019);
  • смесь РНКаз RNAse Cocktail Enzyme Mix (Thermo Fisher Scientific AM2286).

Дополнительное оборудование:

  • настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
  • вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
  • магнитный штатив (Диаэм 3336);
  • ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
  • амплификатор (например, Thermo Fisher Scientific A37834);
  • набор автоматических пипеток переменного объёма - от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
  • наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
  • термоконтейнер со льдом;
  • таймер (например, TR118OS);
  • охлаждающий штатив для пробирок на 0,2 мл (например, Eppendorf 3881000031).

Опционально:

  • флуориметр Qubit 4.0 (Thermo Q33227);
  • система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
  • наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).

Доставка

Доставка осуществляется по всей России и странам СНГ. Возможен самовывоз со склада по адресу Московская область, г. Мытищи, 7-й Ленинский переулок, д.13. Доставка по Москве и Московской области осуществляется бесплатно.

Цена товара указана со склада в Москве и не включает расходы на доставку в другие города.

Вы можете выбрать способ доставки в личном кабинете, чтобы он автоматически указывался при оформлении всех последующих заказов. При выборе варианта «Транспортная компания по выбору клиента» укажите в комментариях транспортную компанию, с которой вы предпочитаете работать.

Точная стоимость доставки рассчитывается менеджером при подтверждении заказа в зависимости от весообъемных характеристик и дальности. Товары, требующие особого температурного режима, доставляются с соблюдением требуемых условий. Если в заказе есть прекурсоры, необходимо оформить официальное письмо об отпуске прекурсоров. (образец письма об отпуске прекурсоров)


Оплата

Компания Диаэм работает с юридическими и физическими лицами. После оформления заказа продавец-консультант сформирует счет и направит его вам по электронной почте и на страницу заказа в Личном кабинете на сайте. Вы также можете сами сформировать счет из Корзины, авторизовавшись на сайте. Счет оплачивается через банк. Вы можете оплатить товар в кассе Диаэм или любом отделении банка.

Для получения товара необходимо предоставление доверенности организации, а для получения товара при оплате физическим лицом необходим паспорт.

  • Набор для прямого секвенирования кДНК, Direct cDNA Sequencing Kit, Oxford Nanopore Technologies
Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!