Oxford Nanopore Technologies — это нанопоровые секвенаторы третьего поколения MinION, GridION и PromethION. Технология секвенирования Oxford Nanopore Technologies позволяет делать прямое прочтение цепей ДНК или РНК в режиме онлайн, длина рида ограничена только длиной фрагмента, а портативность оборудования и быстрая подготовка библиотек дает возможность секвенировать даже в полевых условиях с минимальными требованиями к генетической лаборатории. С Oxford Nanopore Technologies секвенировать теперь может каждый, даже тот, кто ранее и не задумывался о секвенировании — это просто и доступно.
MinION – портативное устройство для прямого секвенирования ДНК и РНК в реальном времени.
В основе прибора ячейка с 512 нанопоровыми каналами (максимальная ёмкость), каждый из которых предназначен для анализа отдельной молекулы нуклеиновой кислоты. В сумме прибор позволяет получить до 20 Гб информации о последовательности ДНК. Длина прочтения, фактически, ограничена только длиной фрагмента нуклеиновой кислоты и составляет сотни тысяч нуклеотидов.
MinION подключается к USB-порту 3.0 ПК или ноутбука для вывода и анализа информации, полученной в процессе секвенирования. Никакое дополнительное компьютерное или лабораторное оборудование не требуется. Пробоподготовка с помощью Rapid Sequencing Kit крайне проста, занимает не более 10 минут и заключается в расщеплении молекулы ДНК транспозазой и пришивке адаптеров к фрагментам ДНК.
Комплект поставки: секвенатор MinION, USB кабель, контрольная ячейка, проточные ячейки (2 шт.), набор для подготовки библиотек cDNA-PCR Sequencing Kit (1 шт.), набор для промывания ячейки (1 шт.), доступ в Nanopore Community. Требуется ПК.
MinION – портативное устройство для прямого секвенирования ДНК и РНК в реальном времени.
В основе прибора ячейка с 512 нанопоровыми каналами (максимальная ёмкость), каждый из которых предназначен для анализа отдельной молекулы нуклеиновой кислоты. В сумме прибор позволяет получить до 20 Гб информации о последовательности ДНК. Длина прочтения, фактически, ограничена только длиной фрагмента нуклеиновой кислоты и составляет сотни тысяч нуклеотидов.
MinION подключается к USB-порту 3.0 ПК или ноутбука для вывода и анализа информации, полученной в процессе секвенирования. Никакое дополнительное компьютерное или лабораторное оборудование не требуется. Пробоподготовка с помощью Rapid Sequencing Kit крайне проста, занимает не более 10 минут и заключается в расщеплении молекулы ДНК транспозазой и пришивке адаптеров к фрагментам ДНК.
Комплект поставки: секвенатор MinION, USB кабель, контрольная ячейка, проточные ячейки (2 шт.), набор для подготовки библиотек Direct cDNA Sequencing Kit (1 шт.), набор для промывания ячейки (1 шт.), доступ в Nanopore Community. Требуется ПК.
MinION – портативное устройство для прямого секвенирования ДНК и РНК в реальном времени.
В основе прибора ячейка с 512 нанопоровыми каналами (максимальная ёмкость), каждый из которых предназначен для анализа отдельной молекулы нуклеиновой кислоты. В сумме прибор позволяет получить до 20 Гб информации о последовательности ДНК. Длина прочтения, фактически, ограничена только длиной фрагмента нуклеиновой кислоты и составляет сотни тысяч нуклеотидов.
MinION подключается к USB-порту 3.0 ПК или ноутбука для вывода и анализа информации, полученной в процессе секвенирования. Никакое дополнительное компьютерное или лабораторное оборудование не требуется. Пробоподготовка с помощью Rapid Sequencing Kit крайне проста, занимает не более 10 минут и заключается в расщеплении молекулы ДНК транспозазой и пришивке адаптеров к фрагментам ДНК.
Комплект поставки: секвенатор MinION, USB кабель, контрольная ячейка, проточные ячейки (2 шт.), набор для подготовки библиотек Direct RNA Sequencing Kit (1 шт.), набор для промывания ячейки (1 шт.), доступ в Nanopore Community. Требуется ПК.
MinION – портативное устройство для прямого секвенирования ДНК и РНК в реальном времени.
В основе прибора ячейка с 512 нанопоровыми каналами (максимальная ёмкость), каждый из которых предназначен для анализа отдельной молекулы нуклеиновой кислоты. В сумме прибор позволяет получить до 20 Гб информации о последовательности ДНК. Длина прочтения, фактически, ограничена только длиной фрагмента нуклеиновой кислоты и составляет сотни тысяч нуклеотидов.
MinION подключается к USB-порту 3.0 ПК или ноутбука для вывода и анализа информации, полученной в процессе секвенирования. Никакое дополнительное компьютерное или лабораторное оборудование не требуется. Пробоподготовка с помощью Rapid Sequencing Kit крайне проста, занимает не более 10 минут и заключается в расщеплении молекулы ДНК транспозазой и пришивке адаптеров к фрагментам ДНК.
Комплект поставки: секвенатор MinION, USB кабель, контрольная ячейка, проточные ячейки (2 шт.), набор для подготовки библиотек Ligation Sequencing kit (1 шт.), набор для промывания ячейки (1 шт.), доступ в Nanopore Community. Требуется ПК.
MinION – портативное устройство для прямого секвенирования ДНК и РНК в реальном времени.
В основе прибора ячейка с 512 нанопоровыми каналами (максимальная ёмкость), каждый из которых предназначен для анализа отдельной молекулы нуклеиновой кислоты. В сумме прибор позволяет получить до 20 Гб информации о последовательности ДНК. Длина прочтения, фактически, ограничена только длиной фрагмента нуклеиновой кислоты и составляет сотни тысяч нуклеотидов.
MinION подключается к USB-порту 3.0 ПК или ноутбука для вывода и анализа информации, полученной в процессе секвенирования. Никакое дополнительное компьютерное или лабораторное оборудование не требуется. Пробоподготовка с помощью Rapid Sequencing Kit крайне проста, занимает не более 10 минут и заключается в расщеплении молекулы ДНК транспозазой и пришивке адаптеров к фрагментам ДНК.
Комплект поставки: секвенатор MinION, USB кабель, контрольная ячейка, проточные ячейки (2 шт.), набор для подготовки библиотек Rapid Sequencing kit (1 шт.), набор для промывания ячейки (1 шт.), доступ в Nanopore Community. Требуется ПК.
MinION – портативное устройство для прямого секвенирования ДНК и РНК в реальном времени.
В основе прибора ячейка с 512 нанопоровыми каналами (максимальная ёмкость), каждый из которых предназначен для анализа отдельной молекулы нуклеиновой кислоты. В сумме прибор позволяет получить до 20 Гб информации о последовательности ДНК. Длина прочтения, фактически, ограничена только длиной фрагмента нуклеиновой кислоты и составляет сотни тысяч нуклеотидов.
MinION подключается к USB-порту 3.0 ПК или ноутбука для вывода и анализа информации, полученной в процессе секвенирования. Никакое дополнительное компьютерное или лабораторное оборудование не требуется. Пробоподготовка с помощью Rapid Sequencing Kit крайне проста, занимает не более 10 минут и заключается в расщеплении молекулы ДНК транспозазой и пришивке адаптеров к фрагментам ДНК.
Комплект поставки: секвенатор Mk1C со встроенным ПК, контрольная ячейка, проточные ячейки (8 шт.), набор для подготовки библиотек на выбор (2 шт.), доступ в Nanopore Community, лицензия на пользование ПО на 3 года.
GridION, в отличие от MinION, состоит из пяти проточных ячеек с нанопоровыми каналами и обладает теми же достоинствами, что и MinION – простая пробоподготовка и быстрое секвенирование молекул нуклеиновых кислот любой длины.
Пять ячеек позволяют проводить пять параллельных независимых экспериментов, что удобно для лабораторий с большим объёмом исследований. Общий объём информации о последовательности ДНК, полученный с помощью GridION, может быть до 100 Гб (объём встроенного SSD-диска – 4 Тб). Эта информация анализируется в реальном времени за счёт встроенного компьютерного модуля под управлением ОС Linux.
Комплект поставки: секвенатор GridION со встроенным ПК, проточные ячейки (48 шт.), набор для подготовки библиотек на выбор (8 шт.), набор для промывания ячейки (4 шт.), доступ в Nanopore Community, лицензия на пользование ПО на 3 года.
PromethION — прибор для высокопроизводительного секвенирования, включающий 24 независимые ячейки с 3000 каналов каждая. Пользователь может задействовать любое количество этих ячеек, в каждой из которых будет проводиться отдельный эксперимент. Анализ результатов происходит с помощью встроенного процессора.
Комплект поставки: секвенатор PromethION на 24 ячейки со встроенным ПК, проточные ячейки (60 шт.), набор для подготовки библиотек на выбор (14 шт.), набор Lambda control (1 шт.), доступ в Nanopore Community, лицензия на пользование ПО на 3 года.
PromethION — прибор для высокопроизводительного секвенирования, включающий 48 независимых ячеек с 3000 каналов каждая. Пользователь может задействовать любое количество этих ячеек, в каждой из которых будет проводиться отдельный эксперимент. Анализ результатов происходит с помощью встроенного процессора.
Комплект поставки: секвенатор PromethION на 48 ячейки со встроенным ПК, проточные ячейки (120 шт.), набор для подготовки библиотек на выбор (24 шт.), набор Lambda control (1 шт.), доступ в Nanopore Community, лицензия на пользование ПО на 3 года.
Технология секвенирования Oxford Nanopore Technologies позволяет делать прямое прочтение цепей ДНК или РНК в режиме онлайн, длина рида ограничена только длиной фрагмента, а портативность оборудования и быстрая подготовка библиотек дает возможность секвенировать даже в полевых условиях с минимальными требованиями к генетической лаборатории. С Oxford Nanopore Technologies
секвенировать теперь может каждый, даже тот, кто ранее и не задумывался о секвенировании — это просто и доступно.
Применения нанопорового секвенирования:
полногеномное секвенирование;
заполнение пробелов недостающих при секвенировании коротких фрагментов;
быстрая онлайн идентификация патогенов и профилирование антибиотикоустойчивости;
Нанопоровое секвенирование (секвенирование третьего поколения) не заменяет и не отменяет применение капиллярных секвенаторов по Сэнгеру или платформ NGS второго поколения. Наоборот, сочетание трех поколений генетического анализа открывает новые возможности получения ранее неизвестных данных.
MinION — карманный секвенатор, одна проточная ячейка, до 20 Гб данных. GridION — настольный секвенатор, 5 проточных ячеек — 2560 каналов с нанопорами. PromethION — самый высокопроизводительный секвенатор, существующий на сегодняшний день, 48 проточных ячеек — 144 000 каналов с нанопорами. MinIT (доступен с 2019 г.) — карманный компьютер для работы с секвенатором MinION. VolTRAX — портативный прибор для автоматической подготовки библиотек. Flongle — адаптер для MinION и GridION, для работы с одноразовыми ячейками. SmidgION — секвенатор для смартфона (находится в разработке).
Специалисты Диаэм
прошли обучение в Oxford Nanopore Technologies, осуществляют профессиональное консультирование и техническую поддержку, помогут спланировать эксперимент и подобрать необходимые наборы реагентов для решения конкретной задачи. Вы также можете заказать нанопоровое секвенирование в лаборатории Диаэм, связавшись с Кристиной Яковлевой ky@dia-m.ru, (495) 745 05 08 доб.109.
Oxford Nanopore Technologies — это нанопоровые секвенаторы третьего поколения MinION, GridION и PromethION. Технология секвенирования Oxford Nanopore Technologies позволяет делать прямое прочтение цепей ДНК или РНК в режиме онлайн, длина рида ограничена только длиной фрагмента, а портативность оборудования и быстрая подготовка библиотек дает возможность секвенировать даже в полевых условиях с минимальными требованиями к генетической лаборатории. С Oxford Nanopore Technologies секвенировать теперь может каждый, даже тот, кто ранее и не задумывался о секвенировании — это просто и доступно. 
