Секвенаторы ДНК по Сэнгеру

Современный капиллярный секвенатор (капиллярный генетический анализатор, секвенатор 1 поколения, классический секвенатор) — автоматический прибор, позволяющий проводить секвенирование и фрагментный анализ нуклеиновых кислот по методу Сэнгера (см. ниже). Разделение фрагментов ДНК сейчас в автоматических капиллярных секвенаторах проводится путем капиллярного электрофореза, ранее это делалось в ручную в плоских гелях с использованием радиоактивной метки.
Каталоги, статьи, видео
Каталоги
Пока нет данных. Перейти в каталог
Сортировать по:
Цена в валюте производителя / в рублях
A35645_компл
По запросу
По запросу
4-капиллярный анализатор SeqStudio для секвенирования по Сэнгеру и фрагментного анализа.

  • Количество капилляров в блоке — 4;
  • длина капилляров, см — 28;
  • формат — 96-луночные планшеты или 8-луночные стрипы;
  • количество детектируемых мишеней — 6;
  • два типа картриджей: 125 инъекций (500 образцов) и 250 инъекций (1000 образцов);
  • универсальный полимер (POP-1) для секвенирования и фрагментного анализа;
  • не требует спектральной калибровки при использовании наборов Applied Biosystems;
  • встроенное ПО для управления SeqStudio Data Collection;
  • подключение к ПК – не обязательно;
  • мощность (без компьютера), Вт — 271;
  • габариты, Ш × Г ×В, мм — 495 × 648 × 442;
  • вес, кг — 45,4.

Особенности:

Универсальный — единый формат расходных материалов (универсальный картридж) и для секвенирования, и фрагментного анализа.
Широкий спектр задач — весь спектр приложений капиллярного электрофореза в ваших руках.
Компактный — секвенатор размером с амплификатор.
Комплексный — компьютер и ПО встроены в прибор. Первичный анализ данных осуществляется в режиме реального времени.
Надежный — проверенные временем технологии. Научные, медицинские, криминалистические лаборатории всего мира доверяют данным этих генетических анализаторов.
Простой— запуск прибора занимает всего несколько минут. Все необходимое для работы прибора в одном картридже, который хранится непосредственно в приборе.

Программное обеспечение:

  • Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
  • SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
  • Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
  • GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
  • Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
  • MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).

Комплект поставки: генетический анализатор SeqStudio (с основным ПО), расширенная гарантия (2 года), обучение запуску, ноутбук с установленной программой управления и сбора данных и анализа, стартовый набор для запуска прибора (4-х капиллярный картридж, протектор, катодный буфер, необходимые расходные материалы).

Дополнительно: однодневное обучение генетическому анализу.

Первые впечатления пользователей нового капиллярного секвенатора SeqStudio (видео), англ. яз.
Больше об устройстве нового картриджа для секвенатора SeqStudio (видео), англ. яз.

Генетический анализатор SeqStudio, листовка, англ., 2 стр, 2017.
Генетический анализатор SeqStudio, спецификация, англ., 2 стр, 2017.
Руководство по применению генетического анализатора SeqStudio, англ., 12 стр, 2017.
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
365-17
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
8 000 200,=
8 000 200,= RUB
  • Количество капилляров, шт. – 8;
  • формат проб – микропланшетный, 96 х 0,2 мл;
  • детектор – флуориметрический;
  • тип лазера – твердотельный;
  • длина волны лазера, нм – 488;
  • мощность лазера, мВт – 20;
  • диапазон длин волн детектора, нм. – от 520 до 710;
  • детекция сигнала флуоресценции в пяти каналах, нм - 520, 550, 580, 610 и 650;
  • общее количество каналов детектора, шт. – 7;
  • материал капилляров – кварц;
  • диаметр капилляров, наружный / внутренний, мкм – 200 / 75;
  • термостатирование капилляров в диапазоне температур, °С – от 30 до 60 ± 0,2 °С;
  • разрешение одноцепочечных фрагментов ДНК с шагом в 1 нуклеотид с достоверностью > 98% для фрагментов длиной до, нуклеотидов – 700;
  • автоматическое перезаполнение геля под давлением, атм – до 70;
  • автоматическое разделения фрагментов ДНК по заданной программе с контролем процесса и параметров эксперимента в реальном времени;
  • совместимость с наборами для капиллярного электрофореза LifeTechnologies (Thermo), Promega, Qiagen;
  • среднее время анализа, ч – 1,5;
  • значение напряжения источника, кВ – до 20;
  • потребляемая мощность, кВт – 0,3;
  • габариты, Ш х Г х В, мм – 850 х 750 х 680;
  • вес, кг – 75.

Комплект поставки:
  • держатель планшетов с фиксатором;
  • емкости для буфера и воды;
  • капилляры длиной, см – 35 и 50;
  • набор для секвенирования с терминаторами;
  • набор для секвенирования с FRET-праймерами (M13, T7);
  • набор для идентификации личности Гордиз;
  • набор маркеров молекулярного веса;
  • набор спектральных калибраторов;
  • набор флуоресцентно-меченых праймеров;
  • универсальный полимер для секвенирования и фрагментного анализа ПДМА-6;
  • буфер для электрофореза.

Примеры анализа и внешний вид ПО для обработки результатов:

Пример анализа последовательности ДНК с использованием программы «ДНК АЛ»:
днк ал.jpg


Пример разделения и анализа размерного стандарта S-450 с использованием программы «ДНК ФА»:
днк фа.jpg


Пример разделения и анализа аллельной лестницы из набора реагентов для мультиплексного анализа 19 STR-маркеров и локуса амелогенина человека «COrDIS Plus»:
COrDIS Plus.jpg


Результат анализа образца ДНК человека, полученный с помощью набора «COrDIS Plus»:
COrDIS Plus2.jpg
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
A28976_компл
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу
По запросу
  • Количество капилляров в блоке — 8;
  • лазерный источник света;
  • длина волны, нм — 505;
  • количество детектируемых мишеней — 6;
  • формат планшет — 96 или 384 лунки;
  • производительность за запуск, п.н. – 3,2 - 8,0 × 10³;
  • система контроля и оптимизации расхода полимера;
  • кассеты с РОР полимером 3х типов (POP-4, POP-6, POP-7):
    • на 96 образцов (12 инъекций);
    • на 384 образца (60 инъекций);
    • на 960 образов (120 инъекций);
  • обязательное подключение к ПК;
  • расходные материалы — контейнеры с анодным и катодным буферами, пакет с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, пакет с POP-полимером;
  • индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
  • мощность (без компьютера), Вт — 271;
  • габариты, Ш × Г × В, мм — 610 × 610 × 720;
  • вес, кг — 82.

Комплект поставки:генетический анализатор 3500 (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), расширенная гарантия (2 года), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.


Программное обеспечение:

  • Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
  • SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
  • Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
  • GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
  • Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
  • MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
A28978_компл
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие Росздравнадзора
По запросу
По запросу
  • Количество капилляров в блоке — 24;
  • лазерный источник света;
  • длина волны, нм — 505;
  • количество детектируемых мишеней — 6;
  • формат планшет — 96 или 384 лунки;
  • производительность за запуск, п.н. — 9,6 - 24,0 × 10³;
  • система контроля и оптимизации расхода полимера;
  • пакеты с РОР-полимером 3х типов (POP-4, POP-6, POP-7):
    • на 96 образцов (5 инъекций);
    • на 384 образца (20 инъекций);
    • на 960 образов (50 инъекций);
  • обязательное подключение к ПК;
  • расходные материалы — контейнеры с анодным и катодным буферами, пакет с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, пакет с POP-полимером;
  • индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
  • мощность (без компьютера), Вт — 271;
  • габариты, Ш × Г × В, мм — 610 × 610 × 720;
  • вес, кг — 82.


Комплект поставки:генетический анализатор 3500 (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), расширенная гарантия (2 года), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.


Программное обеспечение:

  • Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
  • SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
  • Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
  • GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
  • Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
  • MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
A41046_компл
По запросу
По запросу

Высокопроизводительная система капиллярного электрофореза.

  • Количество капилляров в блоке — 48 или 96;
  • улучшенный лазер с охлаждением;
  • блок детекции — утонченная с обратной стороны ССD-камера, обеспечивает низкий шум и полный сбор данных от всех капилляров одновременно;
  • количество детектируемых мишеней — 6;
  • формат планшет — 96 или 384 лунки;
  • производительность за запуск, п.н. — 38,4 - 96,0 × 10³;
  • система контроля и оптимизации расхода полимера;
  • совместимые типы полимера — POP-7, POP CAP;
  • автоматическая замена геля;
  • автоматическая работа 48 часов без оператора;
  • автозагрузчик планшет;
  • встроенный считыватель штрих-кодов;
  • обязательное подключение к ПК;
  • индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
  • габариты, Ш × Г × В, мм — 1000 × 650 × 930;
  • вес, кг — 130.


Комплект поставки: генетический анализатор 3730xl (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), гарантия (2 года), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), капиллярный блок на 96 капилляров, кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.


Программное обеспечение:

  • Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
  • SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
  • Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
  • GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
  • Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
  • MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).
  • Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
Современный капиллярный секвенатор (капиллярный генетический анализатор, секвенатор 1 поколения, классический секвенатор) — автоматический прибор, позволяющий проводить секвенирование и фрагментный анализ нуклеиновых кислот по методу Сэнгера (см. ниже). Разделение фрагментов ДНК сейчас в автоматических капиллярных секвенаторах проводится путем капиллярного электрофореза, ранее это делалось в ручную в плоских гелях с использованием радиоактивной метки.

В капиллярном секвенаторе для анализа используется гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины). Обычно до начала секвенирования производят амплификацию участков ДНК, последовательность которых требуется определить. В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.

В отличие от капиллярных секвенаторов в NGS–секвенаторах возможно секвенирование негомогенных проб ("библиотека" молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников).

Секвенаторы ДНК по Сэнгеру

Устройство капиллярного секвенатора

Секвенирование ДНК по Сэнгеру — «золотой стандарт» секвенирования, это самый точный метод определения последовательности ДНК на сегодняшний день, который использует относительно дешевые расходные материалы при небольшом потоке образцов. Принцип метода — встраивание терминирующих нуклеотидов (модифицированные трифосфаты, обладающие в 3'-положении водородом вместо гидроксильной группы, поэтому при их включении в ДНК происходит прекращение синтеза цепи) в синтезируемую цепь ДНК. В реакционной смеси находятся ДНК-матрица, праймер, ДНК-полимераза и смесь дезоксинуклеотидтрифосфатов и их модифицированных аналогов — дидезоксинуклеотидтрифосфатов. В современной версии секвенирования ДНК по Сэнгеру каждый терминирующий трифосфат (ddATP, ddGTP, ddTTP и ddCTP) помечен соответствующим флуоресцентным красителем. Поэтому фрагменты ДНК светятся разным цветом — в зависимости от того, какой терминирующий трифосфат встроился в цепь.

Реакцию проводят циклически (аналогично ПЦР), многократно повторяя синтез новых одноцепочечных фрагментов. Так как ddNTP составляют около 5% от dNTP, в конце такой (линейной) амплификации после 40-50 циклов получается набор одиночных цепей ДНК, отличающихся по длине на 1 нуклеотид и всегда заканчивающихся меченым нуклеотидом.

Разделение фрагментов по длине происходит с помощью капиллярного электрофореза, визуализация результата представляет собой электрофореграмму с цветными пиками. В настоящее время длина секвенируемых таким способом фрагментов достигает 1000 пар нуклеотидов.

Области применения капиллярных секвенаторов: секвенирование геномов de novo, SNP-типирование (онкология, сельскохозяйственная геномика) подтверждение данных NGS-секвенирования, секвенирование микроорганизмов, секвенирование митохондриальной ДНК (анализ родства).

Фрагментный анализ ДНК — разделение флуоресцентно меченых фрагментов ДНК с целью определения их «относительного» размера — широко применяемый метод исследования ДНК. Метод основан на электрофоретическом разделении фрагментов ДНК, но при этом определяется «относительная» длина каждого фрагмента в парах нуклеотидов. Это достигается тем, что один из праймеров, участвующих в ПЦР перед стадией электрофореза несет на себе флуоресцентную метку, которой метятся фрагменты определенной длины. Затем проводят электрофорез в присутствии фрагментов ДНК известной длины (размерный стандарт) и устанавливают длины исследуемых фрагментов ДНК. Фрагментный анализ возможно проводить и с помощью других методов электрофореза (горизонтальный электрофорез с последующей трансиллюминацией, электрофорез капиллярный на чипе), однако использование для фрагментного анализа капиллярных секвенаторов позволяет определять длины фрагментов с точностью до 0,5 нуклеотида*, что весьма важно для STR- и SNP-генотипирования.

*Измерение длины фрагментов, разгоняемых по полимеру, относительное, производится на основании калибровочной прямой в ходе разгона размерного стандарта и, соответственно, относительные длины вычисляются вплоть до сотых долей нуклеотида Чем выше разрешающая способность, тем легче и точнее различаются между собой фрагменты с разницей в 1 нуклеотид. Кроме того, при амплификации (например, в результате неполного аденилирования) возникает множество артефактов с длиной как раз отличающейся на 1 нуклеотид от истинного аллеля, но с низкой RFU, и повышение разрешающей способности становится важным. На горизонтальном электрофорезе такие фрагменты различить сложно и это часто приводило к ошибкам раньше.

Области применения фрагментного анализа: анализ STR маркеров человека (идентификация личности, анализ родства, наследственные заболевания, идентификация клеточных линий и многое другое), генотипирование животных (паспортизация и идентификация), генотипирование растений (виноград, картофель, свекла и другие культуры), SNP генотипирование.
Секвенаторы ДНК по Сэнгеру

Принцип секвенирования по Сэнгеру


Главный критерий выбора капиллярного секвенатораколичество капилляров (от 4 до 96) и в зависимости от этого производительность по количеству исследованных образцов в день.

Для лаборатории с невысокой производительностью оптимально подойдет секвенатор с 4 капиллярами (до 128 образцов в день) SeqStudio, который к тому же имеет картридж со встроенной помпой и реагентами, что позволяет свести обслуживание прибора к минимуму.

Для большинства лабораторий стандартной производительности оптимальным решением будет 8-капиллярный (до 256 образцов в день) секвенатор. В случае высокой производительности лаборатории необходим в секвенатор с 24, 48 или даже 96 капиллярами.

Наличие Регистрационного удостоверения РосЗдравНадзора уточняйте у специалистов Диаэм.
Секвенаторы ДНК по Сэнгеру
Типичная электрофореграмма фрагментного анализа


Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!