Реагенты для секвенирования по Сэнгеру

Пятикратный (5Х) буфер для оптимизации реакции циклического секвенирования по Сенгеру, предназначен для использования с наборами для циклического секвенирования по Сенгеру AMGene Dye v3.1, BigDye Terminator v1.1 и v3.1.

Формамид предназначен для поддержания фрагментов ДНК в денатурированном состоянии при проведении электрофореза на капиллярных генетических анализаторах различных моделей. Формамид высокодеионизованный, что обеспечивает оптимальный забор анализируемого образца ДНК в капилляр во время электрокинетической инжекции. Объем 25 мл.

Условия хранения и транспортировки: -15 - 25°С.

Гарантийный срок годности: 12 месяцев с момента производства.

• Доступная подготовка образцов для секвенирования по Сэнгеру за счет снижения стоимости каждой реакции;
  
• рабочий процесс оптимизирован для генетических анализаторов SeqStudio и анализаторов серий 3500 и 3730.

• Одношаговый протокол в одной пробирке 30 минут — внесение непосредственно в продукт ПЦР;
• технология на основе ферментативной реакции — ферменты необратимо инактивируются всего за 1 минуту при 80° C;
• сохранность образцов ПЦР — 100% очистка и отсутствие потерь продуктов ПЦР, независимо от длины ампликона;
• не используются спин-колонки или магнитные частицы — значительное сокращение времени очистки и снижение потерь НК;
• обрабатываемые объемы от 5 мкл до 5 л;
• формат – пробирки.

• Одношаговый протокол в одной пробирке 5 минут — внесение непосредственно в продукт ПЦР;
• технология на основе ферментативной реакции — ферменты необратимо инактивируются всего за 1 минуту при 80° C;
• сохранность образцов ПЦР — 100% очистка и отсутствие потерь продуктов ПЦР, независимо от длины ампликона;
• не используются спин-колонки или магнитные частицы — значительное сокращение времени очистки и снижение потерь НК;
• обрабатываемые объемы от 5 мкл до 5 л;
• формат — пробирки, 8-лун. стрипы, 96-лун. планшеты.

NovaDye Terminator Cycle Sequencing Kit v3.1 (аналог BigDye)— готовый набор реагентов предназначенный для циклического секвенирования по методу Сэнгера с использованием флуоресцентно-меченых терминирующих трифосфатов. Реакция секвенирования проводится путем циклической элонгации ДНК с нуклеотид-специфическим терминированием флуоресцентными аналогами нуклеотидов. Набор представляет собой более экономичную и качественную альтернативу реагентам BigDye Terminator v3.1, Thermo Fisher.

Основные характеристики набора

• Аналог BigDye;
• реакционную смесь 2.5X NovaDye Terminator Mix рекомендуется разбавлять буфером 5Х Dilution NovaDye Sequencing Buffer в 2-8 раз (в зависимости от параметров матрицы) для достижения максимальной эффективности реакции;
• для получения более воспроизводимых результатов секвенирования рекомендуется готовить реакцию в объеме 20 мкл, однако допустимо сокращение реакционного объема до 10 мкл;
• работа с набором не требует оптимизации протоколов, используемых для работы с реагентами BigDye Terminator v3.1, настройки генетического анализатора сохраняются, дополнительная калибровка не нужна. Флуоресцентные красители NovaDye Terminator Mix полностью совместимы с набором спектральных стандартов секвенирования BigDye Terminator v3.1 (4404312 Thermo Fisher);
• средняя длина прочтений с качеством не ниже QV20 не менее 800 п.н.;
• набор совместим с различными генетическими анализаторами 3130, 3500, 3730, SeqStudio, G и A16 (ГТЗ), Нанофор-05, Honor-1616.

Состав набора и условия хранения

Хранение компонентов набора: от - 15 до - 25 °С в течении 12 месяцев.

Транспортирование: при температуре от - 15 до - 25 °С.

AMGene Dye v3.1 — готовый набор реагентов, предназначенный для циклического секвенирования по методу Сенгера с использованием флуоресцентно-меченых терминирующих трифосфатов. Реакция секвенирования проводится путем циклической элонгации ДНК с нуклеотид-специфическим терминированием флуоресцентными аналогами нуклеотидов. Набор представляет собой более экономичную и качественную альтернативу реагентам BigDye Terminator v3.1, Thermo Fisher.

Основные характеристики набора AMGene Dye v3.1

• 2.5X реакционную смесь набора рекомендуется разбавлять 5Х реакционным буфером в 2–8 раз (в зависимости от параметров матрицы) для достижения максимальной эффективности реакции и в целях экономии реагентов;
• для получения более воспроизводимых результатов секвенирования рекомендуется готовить реакцию в объеме 20 мкл, однако допустимо сокращение реакционного объема до 10 мкл;
• анализ флуоресцентно меченых продуктов, полученных с использованием набора AMGene Dye v3.1, следует проводить на генетических анализаторах, которые успешно прошли спектральную калибровку для набора красителей Z (BigDye v3.1 Applied Biosystems). Для проведения первоначальной спектральной калибровки прибора (или новой капиллярной сборки в случае с ABI 3500) следует использовать или матричный стандарт (BigDye v3.1 matrix standard) или стандарт для секвенирования (BigDye v3.1 sequencing standard). Дальнейшая работа с набором не требует оптимизации протоколов, используемых для работы с реагентами BigDye Terminator v3.1, настройки генетического анализатора сохраняются, дополнительные калибровки при наличии уже существующей не требуются;
• набор совместим с различными генетическими анализаторами 3130, 3500, 3730, SeqStudio, G и A16 (ГТЗ), Нанофор-05, Honor-1616.

Состав набора и условия хранения

Хранение компонентов набора: от -18 до -25 °С в защищенном от света месте.

Транспортирование: при температуре не выше -10 °С.

Гарантийный срок годности набора: в течении 12 месяцев с даты изготовления.

Набор для очистки BigDye XTerminator – это быстрый и простой метод очистки продуктов реакции секвенирования ДНК, который удаляет невстроенные терминаторы и соли. Очистка выполняется менее чем за 40 минут и требует менее 10 минут ручной работы.

Традиционные методы очистки, такие как осаждение этанолом, требуют добавления нескольких реагентов наряду с этапами разделения фаз и центрифугирования.

Набор для очистки BigDye XTerminator требует добавления только двух реагентов, которые можно добавлять последовательно или предварительно смешивать:

• Раствор XTerminator — удаляет не включенные терминаторы красителя и свободные соли из реакции после секвенирования;
• раствор SAM — повышает эффективность раствора XTerminator и стабилизирует реакции доочистки.

Реагент «Магноферр» это высокоэффективные магнитные частицы для очистки и селекции нуклеиновых кислот. Используя простой протокол с использованием магнитного штатива, реагент удаляет непрореагировавшие нуклеотиды, праймеры и соли при очистке библиотек для высокопроизводительного секвенирования и продуктов реакции Сэнгеровского секвенирования. Реагент может применяться с наборами для секвенирования AMGene Dye v3.1 и BigDye Terminator v3.1. Выпускается в фасовках на 500 реакций (5 мл) и 5 000 реакций (50 мл).

Условия хранения: от 2 до 8 °С.

Условия транспортирования: от 2 до 8 °С.

Срок годности: 12 месяцев с даты производства.