Электрофорез капиллярный на чипе

Система капиллярного электрофореза Qsep — это автоматическая платформа для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов, делаются в одном приборе в одну стадию.
Qsep1 — компактная 1-капиллярная система для лабораторий с небольшим потоком образцов.

Принцип работы: электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer.

• Автоматическая подача образцов (от 4 до 8);
• несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
• время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
• разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
• чувствительность — от 100 пг/мкл;
• объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
• визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО.

Технические характеристики системы Qsep1:

• связь с ПК — USB и Wi-Fi;
• источник возбуждения флуоресценции: светодиодный, 525 нм (зелёный);
• детекция флуоресценции: 590 нм;
• количество капилляров в картридже — 1;
• ток разделения — 1-8 кВ;
• габариты, Г × В × Ш, см, — 24 х 21 х 30.

Области применения Qsep:

• скрининг ПЦР-продуктов;
• генотипирование;
• количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
• анализ фрагментированности геномной ДНК;
• анализ внеклеточной ДНК;
• анализ продуктов рестриктазного расщепления;
• анализ олигонуклеотидов;
• оценка целостности РНК (RNA Quality Number);
• электрофорез белков (необходимо мечение Chromeo-P503).

Комплект поставки: прибор для капиллярного фореза Qsep1: ПО Q-Analyzer Basic, воздушный насос Qairbox, набор 1-канальных картриджей S1 и S2, выравнивающий маркер 20-1000, выравнивающий маркер 20-5000, маркер длин 15-622, маркер длин 50-3000.

Картриджи для системы капиллярного электрофореза Qsep1:

Электрофорез в Qsep происходит в картриджах разных типов, предназначенных для разделения ДНК, РНК и белков. Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов, зависит от типа прибора). В комплект поставки входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.

	Standard (S2)	High Resolution (S1)	Kilobase (S3)	Fast (F3)	High Sensitivity (N1)	RNA (R1)
Тип анализируемой молекулы	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	РНК
Диапазон длин разделяемых фрагментов	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	10-50000 п.н.	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	-
Чувствительность	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	5 пг/мкл	5 пг/мкл
Макс. разрешение	4-10 п.н.	1-4 п.н.	10-50 п.н.	≥ 50 п.н.	≥ 10 п.н.	-
Время анализа одного образца	2-3 мин	3-5 мин	5-21 мин	1-2 мин	2-3 мин	5-10 мин
Количество образцов (на 1 картридж)	200	200	200	300	100	100
Область применения
Скрининг продуктов ПЦР	+	+		+
RFLP	+	+		+
SNP		+
Плазмидный анализ			+
Анализ библиотек для секвенирования	+	+
Анализ геномной ДНК	+		+
Анализ внеклеточной ДНК					+
Анализ РНК						+
Анализ и контроль CRISPR	+	+				+

Система капиллярного электрофореза Qsep — это автоматическая платформа для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов, делаются в одном приборе в одну стадию..

Принцип работы: электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer.


Особенности системы Qsep100:

• автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
• несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
• время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
• разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
• чувствительность — от 100 пг/мкл;
• объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
• визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО.

Технические характеристики системы Qsep100:

• связь с ПК — USB;
• источник возбуждения флуоресценции — светодиодный, 525 нм (зелёный);
• детекция флуоресценции, нм — 590;
• количество капилляров в картридже: 1;
• ток разделения, кВ — 1-15;
• габариты, Г × В × Ш, см — 38 х 40 х 30.

Области применения Qsep:

• скрининг ПЦР-продуктов;
• генотипирование;
• количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
• анализ фрагментированности геномной ДНК;
• анализ внеклеточной ДНК;
• анализ продуктов рестриктазного расщепления;
• анализ олигонуклеотидов;
• оценка целостности РНК (RNA Quality Number);
• электрофорез белков (необходимо мечение Chromeo-P503).

Комплект поставки: Qsep100: ПО Q-Analyzer Basic, воздушный насос Qairbox, набор 1-канальных картриджей S1 и S2, выравнивающий маркер 20-1000, выравнивающий маркер 20-5000, маркер длин 15-622, маркер длин 50-3000.

Картриджи для системы капиллярного электрофореза Qsep 100: электрофорез в Qsep происходит в картриджах разных типов для разделения ДНК, РНК и белков. Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов). В комплект поставки входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.

	Standard (S2)	High Resolution (S1)	Kilobase (S3)	Fast (F3)	High Sensitivity (N1)	RNA (R1)
Тип анализируемой молекулы	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	РНК
Диапазон длин разделяемых фрагментов	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	10-50000 п.н.	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	-
Чувствительность	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	5 пг/мкл	5 пг/мкл
Макс. разрешение	4-10 п.н.	1-4 п.н.	10-50 п.н.	≥ 50 п.н.	≥ 10 п.н.	-
Время анализа одного образца	2-3 мин	3-5 мин	5-21 мин	1-2 мин	2-3 мин	5-10 мин
Количество образцов (на 1 картридж)	200	200	200	300	100	100
Область применения
Скрининг продуктов ПЦР	+	+		+
RFLP	+	+		+
SNP		+
Плазмидный анализ			+
Анализ библиотек для секвенирования	+	+
Анализ геномной ДНК	+		+
Анализ внеклеточной ДНК					+
Анализ РНК						+
Анализ и контроль CRISPR	+	+				+

Cистема капиллярного электрофореза Qsep — это автоматическая платформа для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов, делаются в одном приборе в одну стадию.

Особенности системы Qsep100 Advanced:

• автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
• несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
• время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
• разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
• чувствительность — от 100 пг/мкл;
• объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
• визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО.

Технические характеристики системы Qsep100:

• связь с ПК — USB;
• источник возбуждения флуоресценции — светодиодный, 525 нм (зелёный);
• детекция флуоресценции, нм — 590;
• количество капилляров в картридже — 1;
• ток разделения — 1-15 кВ;
• габариты, Г × В × Ш, см — 38 х 40 х 30.

Области применения Qsep:

• скрининг ПЦР-продуктов;
• генотипирование;
• количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
• анализ фрагментированности геномной ДНК;
• анализ внеклеточной ДНК;
• анализ олигонуклеотидов;
• анализ продуктов рестриктазного расщепления;
• оценка целостности РНК (RNA Quality Number),
• электрофорез белков (необходимо мечение FITC или Alexa 488).

Принцип работы: электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer.


Комплект поставки: Qsep100; ПО Q-Analyzer Basic; воздушный насос Qairbox; набор 1-канальных картриджей S1 и S2; выравнивающий маркер 20-1000; выравнивающий маркер 20-5000; маркер длин 15-622; маркер длин 50-3000.

Картриджи для капиллярного электрофореза Qsep:

Электрофорез в Qsep происходит в картриджах разных типов для разделения ДНК, РНК и белков. Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов). В комплект поставки входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.

	Standard (S2)	High Resolution (S1)	Kilobase (S3)	Fast (F3)	High Sensitivity (N1)	RNA (R1)
Тип анализируемой молекулы	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	РНК
Диапазон длин разделяемых фрагментов	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	10-50000 п.н.	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	-
Чувствительность	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	5 пг/мкл	5 пг/мкл
Макс. разрешение	4-10 п.н.	1-4 п.н.	10-50 п.н.	≥ 50 п.н.	≥ 10 п.н.	-
Время анализа одного образца	2-3 мин	3-5 мин	5-21 мин	1-2 мин	2-3 мин	5-10 мин
Количество образцов (на 1 картридж)	200	200	200	300	100	100
Область применения
Скрининг продуктов ПЦР	+	+		+
RFLP	+	+		+
SNP		+
Плазмидный анализ			+
Анализ библиотек для секвенирования	+	+
Анализ геномной ДНК	+		+
Анализ внеклеточной ДНК					+
Анализ РНК						+
Анализ и контроль CRISPR	+	+				+

Система капиллярного электрофореза Qsep — это автоматическая платформа для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов, делаются в одном приборе в одну стадию.
Qsep400 — 4-капиллярная система для высокопроизводительного электрофореза, позволяющая одновременно анализировать до 4 образцов ДНК, РНК или белков.

Принцип работы: электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer.


Особенности системы Qsep400:

• автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
• несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 400-1200 образцов;
• время анализа 4 образцов — от 2 до 7 минут;
• разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
• чувствительность — от 100 пг/мкл;
• объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
• визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО.

Технические характеристики системы Qsep400:

• габариты, Г × В × Ш, см: 54 х 40 х 36;
• питание: от сети 220 В через адаптер постоянного тока 24 В;
• связь с ПК: USB;
• источник возбуждения флуоресценции: светодиодный, 525 нм (зелёный);
• детекция флуоресценции: 590 нм;
• количество капилляров в картридже: 4;
• ток разделения: 1-15 кВ.

Области применения Qsep:

• скрининг ПЦР-продуктов;
• генотипирование;
• количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
• анализ фрагментированности геномной ДНК;
• анализ внеклеточной ДНК;
• анализ продуктов рестриктазного расщепления;
• анализ олигонуклеотидов;
• оценка целостности РНК (RNA Quality Number);
• электрофорез белков (необходимо мечение Chromeo-P503).

Комплект поставки: Qsep400: ПО Q-Analyzer Basic, воздушный насос Qairbox, набор 4-канальных картриджей S1 и S2, выравнивающий маркер 20-1000, выравнивающий маркер 20-5000, маркер длин 15-622, маркер длин 50-3000.

Картриджи для системы капиллярного электрофореза Qsep400: электрофорез в Qsep происходит в картриджах разных типов для разделения ДНК, РНК и белков. Картридж рассчитан на анализ 400-1200 образцов. В комплект поставки входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.

	Standard (S2)	High Resolution (S1)	Kilobase (S3)	Fast (F3)	High Sensitivity (N1)	RNA (R1)
Тип анализируемой молекулы	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	ДНК	РНК
Диапазон длин разделяемых фрагментов	10-15000 п.н.	10-15000 п.н.	10-23000 п.н.	10-5000 п.н.	10-5000 п.н.	-
Чувствительность	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	0,1 нг/мкл	5 пг/мкл	5 пг/мкл
Макс. разрешение	4-10 п.н.	1-4 п.н.	10-50 п.н.	≥ 50 п.н.	≥ 10 п.н.	-
Время анализа одного образца	2-3 мин	3-5 мин	5-9 мин	1-2 мин	3-5 мин	5-10 мин
Количество образцов (на 1 картридж)	200	200	200	300	100	100
Область применения
Скрининг продуктов ПЦР	+	+		+
RFLP	+	+		+
SNP		+
Плазмидный анализ			+
Анализ библиотек для секвенирования	+	+
Анализ геномной ДНК	+		+
Анализ внеклеточной ДНК					+
Анализ РНК						+
Анализ и контроль CRISPR	+	+				+

Система Bioanalyzer 2100 использует микрофлюидную технологию LabChip, обеспечивает высокую точность результатов при минимальных объемах исследуемого образца. В системе используется два принципа анализа: электрофореза и проточной цитометрии.

• Источник света — светодиодный лазер;
• длина волны эмиссии, нм — 635;
• фотоэмиссионный детектор;
• длина волны детекции, нм — 685;
• фильтры эмиссии, нм — 488, 638 нм;
• формат — 16-луночные чипы;
• подключение к ПК — USB 2.0;
• габариты, ШхГхВ, мм — 162 × 412 × 290;
• вес, кг — 10.

Принцип работы: в системе применяют готовые чипы, заполненные агарозным гелем. Движение фрагментов ДНК в капилляре, как и в "классической" методике, происходит под действием тока. Для определения размеров НК, белков используют маркеры, окрашенные интеркалирующими и флуоресцентными красителями.

В случае применения цитометрического модуля: клеточная суспензия, предварительно меченная флюоресцирующими моноклональными антителами или флуоресцентными красителями, попадает в поток жидкости, проходящий через проточную ячейку. Условия подобраны таким образом, что клетки выстраиваются друг за другом за счет т. н. гидродинамического фокусирования струи в струе. В модуле возможно изучение зелёной и красной флуоресценции. Все результаты обрабатываются с помощью ПО 2100 Expert.

Области применения:

• приготовление библиотек при проведении NGS на секвенаторах ДНК HiScan SQ, HiSeq 2000, MiSeq (Illumina); 5500 xl W, 5500w, Ion Torrent IonProton, Ion Torrent PGM (Life Technologies); GS FLX+, GS Junior (Roche);
• подготовка образцов для парноконцевого секвенирования, ChIP-секвенирования;
• выделение белков и НК;
• контроль качества синтезированной in vitro матричной РНК, контроль чистоты выделенной РНК (RIN - RNA Integrity Number);
• определение уровня апоптоза;
• оценка жизнеспособности и пролиферации клеток;
• оценка экспрессии белков в результате связывания с антителами;
• оценка экспрессии белков с помощью зелёного флуоресцентного белка (green fluorescent protein, GFP);
• оценка эффективности трансфекции миРНК (siRNA).

Преимущества:

• система позволяет анализировать ДНК, РНК, белки, клетки с использованием одного прибора;
• чувствительность, пг/мкл — 5 (для ДНК), 50 (для РНК), 1 (для белков);
• максимальная загрузка чипа — до 12 образцов на один чип;
• объем исходного образца, мкл — 1 (для ДНК и РНК), 4 (для белков), 10 мкл (для клеток);
• время анализа, мин — 25-45, в зависимости от используемого чипа.

Комплект поставки: станция подготовки чипов Chip priming station; вортекс IKA; ПО 2100 Expert, набор для электрофореза (приобретается дополнительно), набор для проточной цитометрии (приобретается дополнительно), ПК или ноутбук (приобретается дополнительно).

Характеристики чипов:

Образцы	High Sensitivity DNA	DNA 1000	DNA 7500	DNA 12000
Диапазон размеров, п.н.	50-7000	25-1000	100-7500	100-12000
Диапазон концентраций	5-500 пкг/мкл	0,5-50 нг/мкл	0,5-50 нг/мкл	0,5-50 нг/мкл
Время анализа, мин	45	35	30	30
Число образцов	11	12	12	12

Образцы	Protein 80	Protein 230	High Sensitivity Protein 250
Диапазон размеров, кДа	5-80	14-230	10-250
Диапазон концентраций	60-2000 нг/мкл	15-2000 нг/мкл	0,3-3000 нг/мкл
Время анализа, мин	30	25	30
Число образцов	10	10	10

Образцы	Клетки
Красный канал	возбуждение – 620-645 нм; эмиссия – 674-696 нм.
Синий канал	возбуждение – 458-482 нм; эмиссия – 510-540 нм.
Минимальная клеточная пропускная способность	2,5 клетки / секунды
Минимальная плотность, кл/мл	2,0 x 10⁶
Время анализа, мин	30
Количество образцов	6
Объём образца, мкл	10 (клеток 2 x 10⁴ в мл)

Высокопроизводительная система электрофоретического разделения нуклеиновых кислот с использованием микрочиповой технологии. Система позволяет заменить рутинные методы классического гель-электрофореза.

• Минимальный объем образца, мкл — 5 (в режиме смешивания реагентов на микрочипе) или — 6 (при предварительном смешивании с реагентами);
• диапазон измеряемых концентраций ДНК, нг/мкл:
• 0,5 — 50;
• диапазон измеряемых концентраций РНК, нг/мкл:
• 25 — 500 (общая РНК);
• 25 — 250 (матричная РНК);
• предел обнаружения ДНК, нг/мкл — 0,2;
• предел обнаружения РНК, нг/мкл — 5;
• источник света — светодиод, 470 нм;
• кварцевый микрочип, электрофоретической канал длиной 23 мм;
• интегрированные платиновые электроды;
• напряжение — до 1,5 кВ, ток — 250 мкА;
• размеры, Ш x Г x В, мм — 415 × 545 × 508;
• вес, кг — 43.

Области применения:

• генетический анализ нокаутных животных, методами генной инженерии;
• контроль качества библиотек NGS;
• детекция аллергенов в пищевой индустрии;
• генотипирование.

Преимущества:

• одновременный автоматизированный анализ до 108 образцов;
• высокая скорость анализа — до 5 мин;
• высокая чувствительность, благодаря флуориметрическому детектору;
• высокая воспроизводимость результатов;
• отсутствие использования бромистого этидия;
• автоматический ввод образца в микрочип и заполнение электрофоретического канала буферным раствором;
• автоматическая промывка микрочипа до и после измерения;
• специальное покрытие капилляров обеспечивает возможность многократного использования одного и того же микрочипа — до 3600 анализов.

Принцип работы: в системе применяют готовые чипы, заполненные буферным раствором. Движение фрагментов ДНК в капилляре, как и в "классической" методике, происходит под действием тока. Для определения размеров НК, белков используют маркеры. Для анализа необходимо выбрать подходящий, по диапазону длин фрагментов НК, реагентный кит. Затем весь процесс, начиная с ввода образца, заканчивая промывкой микрочипа, производится автоматически. Все результаты обрабатываются с помощью ПО.

Характеристики чипов:

	DNA-500	DNA-1000	DNA-2500	RNA
Объекты исследования	ДНК	ДНК	ДНК	РНК
Диапазон размеров НК	25-500 п.о.	100-1000 п.о.	100-2500 п.о.	до 28S рРНК (~5,0 Кнт)
Разрешение, %	5	5	10	20
Точность определения размера НК	± 5%	± 15%	± 15%	n/a

Электрофоретическая система MultiNA для анализа ДНК и РНК, Shimadzu, видеообзор.