Возможно, вы сменили регион при заполнении корзины.
Часть товаров из корзины будет перемещена в статус отложенных
и не сможет быть оформлена для заказа, если вы продолжите работу в данном регионе
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие
Росздравнадзора
По запросу
По запросу
Настольный интегрированный инструмент для NGS, включающий в одном приборе блоки для подготовки образцов (образования кластеров), секвенирования и обработки данных и интерфейс для управления. Принцип секвенирования основан на технологии Solexa, включающей обогащение методом bridge-ПЦР на проточном чипе, секвенирование методом синтеза (SBS) с использованием флуоресцентно-меченных нуклеотидов и детекцию света флуоресценции от кластеров ДНК.
Основные применения:
ресеквенирование ампликоновых библиотек;
проверка результатов клонирования и генной модификации;
мультиплексное высокопроизводительное секвенирование малых геномов (например, микроорганизмов);
таргетное высокопроизводительное секвенирование геномов для анализа генетически-ассоциированных болезней;
поиск мутаций;
HLA-типирование;
секвенирование малых РНК;
эпигенетические исследования, анализ профиля метилирования;
целевое ресеквенирование и секвенирование de novo и т. д.
Настольный высокопроизводительный NGS-секвенатор для различных применений. Имеет возможность проведения генерации кластеров ДНК и секвенирования в одном приборе, без выполнения ручных операций. Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений
Основные применения высокопроизводительного NGS-секвенатора GenoLab M
Настольный NGS-секвенатор средней производительности для различных применений. Рекомендуется для секвенирования небольших геномов и таргетного секвенирования ампликонов и панелей генов. Имеет возможность проведения генерации кластеров ДНК и секвенирования в одном приборе, без выполнения ручных операций. FASTASeq 300 является одним из самых быстрых секвенаторов, минимальное время секвенирования и обработки данных составляет 4,5 часа. Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.
количество независимых дорожек в ячейке для секвенирования, шт. — 4;
возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана — наличие;
количество типов нуклеотидов, одновременно подаваемых в реакционный модуль в каждом цикле секвенирования — 4 нуклеотида;
максимальное количество прочтений на одну ячейку, млн — 250;
максимальная производительность за один полный запуск прибора, Гб — 75;
поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений — наличие;
максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов — 150;
максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
максимальное время, необходимое для полного цикла работы прибора (включая генерацию кластеров, секвенирование ДНК и первичный анализ данных), ч — 24;
поддержка библиотек TruSeq и Nextera — наличие;
средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q30) — 80% оснований с точностью прочтения 99,9%;
требования к сети — 220 В; 50/60 Гц;
габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 684×644×615;
вес, кг — 145.
Комплектация секвенатора FASTASeq 300
Секвенатор;
стартовый набор для инсталляции и обучения;
источник бесперебойного питания;
управляющий ПК (Операционная система — Windows 10 Pro, CPU:Xeon SR 4216, Память: 16 GB DDR4 * 6; Hard Disk 1:512 GB SSD; Hard Disk 2:10 TB HD * 4);
монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).
NGS-секвенаторы (секвенаторы 2 поколения, секвенаторы нового поколения) — современные высокопроизводительные автоматические устройства, предназначенные для быстрого и качественного определения первичной последовательности нуклеиновых кислот методами NGS-секвенирования (next generation sequencing). Дальнейшее развитие технологий секвенирования реализуется в нанопоровых секвенаторах 3 поколения.
Технологии секвенирования 2 поколения
Определение последовательности нуклеиновых кислот методами высокопроизводительного секвенирования представляет собой одновременное (параллельное) прочтение последовательности нескольких миллионов разных (относительно коротких) фрагментов исходной ДНК.
Достоинства NGS: высокая производительность, низкая стоимость на один нуклеотид, возможность таргетного, экзомного или полногеномного исследования, возможность секвенирования без каких-либо априорных знаний о последовательности ДНК.
Недостатки NGS: высокая стоимость некоторых реагентов, большая длительность прогона (некоторые модели), ошибки в GC-богатых участках (решается ресеквенированием методом Сэнгера), сложная обработка полученных данных, ограниченные возможности выявления крупных делеций, инсерций, транслокаций (решается методом сравнительной геномной гибридизации).
Основные современные технологии NGS
Существует несколько методов NGS различных по принципам секвенирования, но так или иначе любой способ начинается с приготовления библиотеки ДНК (определяет 90% успеха секвенирования). Наиболее популярные сейчас технологии NGS не позволяют читать непосредственно геномную или кДНК и предполагают амплификацию исходных молекул. Образец ДНК, определенным образом фрагментированный и амплифицированный, называется библиотекой случайных фрагментов ДНК для NGS.
Подготовка библиотеки обычно включает следующие этапы: выделение и очистка ДНК/РНК — количественная оценка (с использованием флуориметра, наноспектрофотометра либо ПЦР в реальном времени, цифровой ПЦР) — фрагментирование (нарезка на фрагменты определенной длины путем расщепления ультразвуком или ферментами) - оценка качества фрагментированной ДНК (оценка длин фрагментированной ДНК обычно проводится с использованием систем капиллярного электрофореза на чипе, кроме оценки степени разрушения исходной ДНК это же оборудование можно использовать для выявления димеров, праймеров и не сработавших адаптеров, а также определения размеров полученной библиотеки) — предварительная амплификация библиотеки (не более 13-15 циклов, требуется в том случае, если количество исходной ДНК гораздо ниже рекомендуемого) — отбор фрагментов нужной длины (необходим для повышения качества секвенирования, наилучшим решением на этом этапе является использование специальных систем препаративного электрофореза) — лигирование адаптеров — клональная амплификация (мостиковая или эмульсионная ПЦР). Приготовление библиотек возможно вручную либо автоматизированно.
Секвенирование синтезом (технология «Solexa») — секвенирование осуществляется с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы), что не позволяет включать ДНК-полимеразе в синтезируемую цепь более одного основания за цикл. Процесс секвенирования идет циклически, параллельно, на множестве чипов. Каждый цикл состоит из следующих этапов:
внесение всех типов нуклеотидов в проточный чип с ПЦР-продуктами (после мостиковой ПЦР);
включение ДНК-полимеразой одного меченого нуклеотида и вымывание остальных;
детекция флуоресценции от каждого ПЦР-продукта;
снятие 3′-блока вместе с флуорофором (промывка).
Полупроводниковое секвенирование (технология Ion Torrent) - секвенирование начинается с отжига праймера, комплементарного адаптеру на одном из концов библиотеки ДНК. Затем к синтезируемой цепи ДНК по очереди добавляют обычные трифосфаты (dNTP). Если добавленный нуклеотид оказывается комплементарен матрице, ДНК-полимераза встраивает его в цепь, при этом выделяется протон (H+), вызывающий изменение pH раствора, которое детектируется. Если нуклеотид не подходит, сигнал отсутствует. После каждого добавленного в реакцию нуклеотида прибор выполняет промывку системы для очистки от остатков, не включившихся dNTP данного типа. В настоящее время в Ion Torrent устранены трудности с детекцией гомополимерных участков (ослабление дискретности сигнала в случае протяженного мононуклеотида, например TTTTTTT, в связи с чем становится сложно определить, сколько именно нуклеотидов (5, 6 или 7) присутствует в последовательности). Важным отличием полупроводникового секвенирования от других популярных методов является отсутствие оптического детектора сигнала, что значительно упрощает и удешевляет конструкцию прибора.
Пиросеквенирование — регистрация акта присоединения нуклеотида по образующемуся пирофосфату. Метод основан на синтезе новой ДНК-цепи на иммобилизированной анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера при последовательном добавлении каждого из dNTP. При встраивании нуклеотида стехиометрически высвобождается пирофосфат (PPi). Он активирует каскад химических реакций, в результате возникает световой сигнал, интенсивность которого прямо пропорциональна числу включенных в цепь нуклеотидов (если подряд идут несколько одинаковых нуклеотидов, сигнал будет ярче). Свет регистрируется камерой и далее анализируется компьютерной программой. Невстроенные нуклеотиды подвергаются деградации ферментом апиразой, и реакция начинается с новым нуклеотидом. Серьезной проблемой метода являются трудности с детекцией гомополимерных участков.
Другие технологии NGS (в настоящее время мало распространены)
454 Life Sciences (один из вариантов пиросеквенирования);
секвенирование лигированием (технология SOLID).
Области применения NGS-секвенирования
Области применения NGS-секвенирования: секвенирование геномов de novo; идентификация бактерий и патогенных грибов; выявление и подтверждение мутаций; выявление и подтверждение гетерозиготности; выявление и подтверждение SNPs; сравнительное секвенирование; HLA-типирование; генотипирование ВИЧ для идентификации мутаций устойчивости к лекарственным препаратам; онкогенетика, популяционная и географическая генетика (миграции генов в популяциях), идентификация личности по SNP-маркерам; молекулярная филогенетика (систематика живых организмов) и др.
Критерии выбора NGS-секвенатора
Максимальная производительность (от 1 гигабазы у небольших приборов до 100-120 гигабаз у самых высокопроизводительных);
постоянная или переменная производительность (возможность использования чипов разной производительности на одном приборе);
способ подготовки библиотек - ручной или автоматизированный (незаменим при большом потоке образцов);
время, необходимое на 1 запуск (от нескольких часов до двух суток);
длина прочтений: более короткие чтения (до 200 п.н.) позволяют работать с деградированной ДНК, но сборка генома из них сложнее чем из более длинных прочтений (400-600 п.н.);
количество прочтений за запуск (от нескольких миллионов до сотен миллионов);
точность прочтений.
Наличие Регистрационного удостоверения РосЗдравНадзора уточняйте у специалистов Диаэм.
Регистрация на сайте компании Диаэм доступна только для юридических лиц, для физических лиц сделать заказ и узнать его статус можно без регистрации или обратившись в компанию по телефону +7 495-745-0508 или электронной почте info@dia-m.ru
Для повышения удобства работы с сайтом на нем используются файлы cookie.
В cookie содержатся данные о Ваших прошлых посещениях сайта. Если Вы не хотите, чтобы эти данные
обрабатывались, отключите cookie в настройках браузера.