Электрофорез препаративный

Электрофорез — это метод разделения макромолекул (белков и нуклеиновых кислот, а также их фрагментов) под действием электрического поля за счёт их отличий по заряду, молекулярной массе и конфигурации.
Каталоги, статьи, видео
Пока нет данных. Перейти в каталог
Сортировать по:
Цена в валюте производителя / в рублях
PIP0001
1 121 043,=
15 280,= USD

Система препаративного электрофореза для разделения и выделения только фрагментов ДНК размером от 50 до 8000 п.о.; детекция фракций осуществляется без использования УФ, что гарантирует отсутствие повреждения фрагментов.


Технические характеристики:

  • напряжение при электрофорезе, В - 100 или 150;
  • ток (на каждую дорожку), мА - 2 или 3;
  • длина волны возбуждения, нм – 535;
  • длина детекции, нм – 640;
  • максимальное количество ДНК:
    - 10 мкг фрагментированной геномной ДНК;
    - 4 мкг ДНК определённого размера;
  • точность и воспроизводимость выделения, % - 5-10, в зависимости от геля;
  • выход образца, % - 50-80;
  • габариты, ШхГхВ, см - 18x28x53;
  • вес, кг - 7.





Принцип работы:

В системе используются готовые кассеты на пять изолированных капилляров, заполненных агарозным гелем. В конце каждого капилляра есть Y-образное разветвление. Оба выходящих капилляра имеют независимое подключение к катодам. Движение фрагментов ДНК в капилляре как и в «классической» методике происходит под действием тока, но при приближении фрагментов ДНК требуемого размера к месту разветвления, происходит переключение катодов, и искомый фрагмент попадает в боковое ответвление капилляра и собирается в канале для сборки.


Преимущества метода:

  • за один сеанс система может работать параллельно с 4 образцами + 1 внешний стандарт или с 5 образцами при использовании внутреннего стандарта; время подготовки - 3 минуты, время проведения самой процедуры – 50-100 мин в зависимости от размеров фрагментов;
  • благодаря готовым гелевым чипам достигается максимальная воспроизводимость экстракции и, как следствие, более точный результат секвенирования;
  • каналы, в которых идёт разгонка, полностью изолированы друг от друга, что снижает риск перекрёстной контаминации;
  • отбор осуществляется, автоматически в соответствии с заданным через ПО диапазоном длин фрагментов, что может использоваться для секвенирования спаренных концов.

Области применения:

  • приготовление библиотек при проведении NGS;
  • подготовка образцов для парноконцевого секвенирования, ChIP-секвенирования;
  • улучшение библиотек при проведении эмульсионной ПЦР;
  • выделение белков и НК.

Характеристики картриджей:

0,75% агарозные картриджи BluePippin 0,75% агарозные картриджи PippinPrep 1,5% агарозные картриджи 2% агарозные картриджи 3% агарозные картриджи
Количество образцов 4 4 4 4 4
Диапазон размеров НК 1000-50000 п.о. 2000-8000 п.о. 180-1500 п.о. 100 – 600 п.о. 50 – 200 п.о.
Точность детекции, %

± 5 (с интеркалирующим красителем)

± 10 (без красителя)

± 5 (с интеркалирующим красителем)

± 10 (без красителя)

± 5 (с интеркалирующим красителем)

± 10 (без красителя)

± 5 (с интеркалирующим красителем)

± 10 (без красителя)
± 5
  • Электрофорез препаративный
BLU0001
1 751 630,=
23 875,= USD
BluePippin — система препаративного электрофореза и пульс-электрофореза, позволяет разделять и выделять фрагменты НК, размером 90-50000 п.н., а так же белки массой 18-200 кДа.

  • Максимальная нагрузка ДНК на дорожку:
    • 10 мкг фрагментированной геномной ДНК;
    • 2 мкг ДНК определённого размера;
  • минимальная нагрузка ДНК:
    • от нескольких нг фрагментированной геномной ДНК;
    • 50 нг ДНК определённого размера;
  • максимальная нагрузка белка — 3,5 мкг;
  • максимально возможное количество получаемого образца на выходе — 40 мкл;
  • длина волны возбуждения, нм — 470;
  • длина детекции, нм — 525;
  • источник света — светодиоды LED;
  • напряжение при электрофорезе, В — 25, 100 и 150 (постоянный ток), или 100 в режиме пульс-электрофореза;
  • ток (на каждую дорожку), мА — 2 или 3;
  • точность и воспроизводимость выделения, % — 5-10, в зависимости от геля;
  • точность (режим постоянного тока), % - >93;
  • воспроизводимость (режим постоянного тока), % - >92;
  • минимальное распределение по размерам, % - 8;
  • выход образца, % — 50-80;
  • габариты, ШхГхВ, см — 28х53х18;
  • вес, кг — 7.

Области применения:

Принцип работы: в системе используются готовые картриджи на пять изолированных капилляров, заполненных агарозным гелем разной процентной концентрации, которая выбирается пользователем в зависимости от величины фрагмента образца. В конце каждого капилляра имеется Y-образное разветвление. Оба выходящих капилляра имеют независимое подключение к катодам. Движение фрагментов ДНК в капилляре как и в «классической» методике происходит под действием тока, но при приближении фрагментов ДНК требуемого размера к месту разветвления, происходит переключение катодов, и искомый фрагмент попадает в боковое ответвление капилляра и собирается в канале для сборки. Для проведения электрофореза нуклеиновых кислот используется Tris-TAPS (или Трис-ТАПС) буфер, для белков — SDS-буфер. Программное обеспечение определяет время элюирования на основе миграции ДНК-маркера.

4 режима программирования:

  1. Tight (узкий) – сбор коротких фрагментов образца, выбирается в основном для работы с молекулами небольших размеров.
  2. Range (диапазон) – пользователь может сам выбрать диапазон размера фракций который ему необходим. Подход используется, когда не важна высокая точность исследования.
  3. Time (время) – коллекционирование образцов происходит в зависимости от заданного времени. Подход используется, когда не важна высокая точность исследования.
  4. Peak (пик) – сбор пиков (нескольких фрагментов разного размера).

3 стратегии детектирования фракций:

  • Для ДНК малых размеров (90 п.н. -1,5 тыс.п.н.):
    Стратегия без окрашивания с внутренними флуоресцентно-мечеными маркерами. В качестве внутренних стандартов используются флуоресцентно-меченые маркеры ДНК, определенной молекулярной массы. Добавляются в лунку совместно с исследуемым образцом. Одновременно возможен анализ 5 образцов.
  • Для ДНК больших размеров (> 2 тыс. п.н.):
    Стратегия без окрашивания с внешним флуоресцентно-меченым маркером. В качестве внешнего стандарта используется флуоресцентно-меченый маркер ДНК определённой молекулярной массы, добавляется в отдельную лунку. Одновременно возможен анализ 4 образцов + 1 внешний стандарт.
  • Для выделения ДНК с дорожки (band capture) (> 2 тыс. п.н.):
    Окрашивание образцов флуоресцентным красителем Midori Green. Образцы окрашиваются флуоресцентным красителем Midori Green. Одновременно возможен анализ 4 образцов + 1 внешний стандарт.

Преимущества метода:

  • Время подготовки — 3 минуты, время проведения самой процедуры — 50-100 мин в зависимости от размеров фрагментов.
  • Благодаря готовым гелевым чипам достигается максимальная воспроизводимость экстракции и, как следствие, более точный результат секвенирования.
  • Каналы, в которых идёт разгонка, полностью изолированы друг от друга, что снижает риск перекрёстной контаминации.
  • Отбор осуществляется, автоматически в соответствии с заданным через ПО диапазоном длин фрагментов, что может использоваться для секвенирования спаренных концов.
  • Отбор образцов из пробоотборной камеры производится вручную с помощью стандартного дозатора.

Схема работы:

  1. Пробоподготовка:
    • Подготовка материала, если используются внутренние стандарты: образец ДНК довести до 30 мкл ТЕ буфером, добавить 10 мкл флуоресцентно - меченного маркера.
    • Подготовка материала, если используется внешний стандарт: образец ДНК довести до 30 мкл ТЕ буфером, добавить 10 мкл загрузочного раствора. 40 мкл готового стандарта помещается в отдельную дорожку.
    • В случае с красителем Midori Green, 40 мкл красителя помещается в каждую из пяти + буферную камеру и при включении тока будет двигаться на встречу образцам.
  2. Эксперимент:
    • Выбираем картридж в соответствии со стратегией, с помощью которой будет производиться детектирование НК;
    • помещаем картридж в прибор и выбираем её в ПО из списка предложенных программой (ПО само установит все необходимые параметры для проведения электрофореза под выбранный картридж);
    • По истечении времени, заданного программой, образец аккуратно собираем из коллектора фракций пипеточным дозатором.

Информация о свежих статьях:

1. Nature Methods. Assembly and diploid architecture of an individual human genome via single-molecule technologies (июнь, 2015); Authors: Matthew Pendleton, Robert Sebra, Andy Wing Chun Pang, Ajay Ummat et al.
2. BioTechniques. Optimization and cost-saving in tagmentation-based mate-pair library preparation and sequencing. (май, 2015) DOI:10.1038/nmeth.3454; Authors: Kaori Tatsumi, Osamu Nishimura, Kazu Itomi, Chiharu Tanegashima, and Shigehiro Kuraku.

Видео:
Системы препаративного электрофореза BluePippin и Pippin Prep

Для проведения пульс-электрофореза применяется специальный источник питания Pippin Pulse.

  • Электрофорез препаративный
HTP0001
2 802 608,=
38 200,= USD
  • Одновременный прогон до 24 образцов;
  • подготовка образцов, мин — 3;
  • время протекания процесса электрофореза, мин —50-100 (в зависимости от размера фрагментов);
  • разделение образцов идёт в изолированных агарозных капиллярах;
  • максимальная нагрузка фрагментированной геномной ДНК на дорожку, мкг — 1,5;
  • минимальная нагрузка фрагментированной геномной ДНК на дорожку, нг — 15;
  • длина волны возбуждения, нм — 470;
  • длина детекции, нм — 525;
  • напряжение при электрофорезе, В — 75 в режиме постоянного тока и в режиме пульс-электрофореза;
  • точность (режим постоянного тока), % — > 93;
  • воспроизводимость (режим постоянного тока), % — > 92;
  • минимальное распределение по размерам, % — ≤ 8;
  • выход образца, % — 50-80;
  • габариты, ШхГхВ, см — 64 х 33 х 46;
  • вес, кг — 9.
  • Электрофорез препаративный
  • Электрофорез препаративный
  • Электрофорез препаративный
  • Электрофорез препаративный
  • Электрофорез препаративный
  • Электрофорез препаративный
  • Электрофорез препаративный
  • Электрофорез препаративный
ELF0001
2 242 086,=
30 560,= USD

Система SageELF – электрофорезная система для разделения образцов ДНК или белков по размеру и последующего фракционирования всего образца или его секций на 12 фракций. Целевой фрагмент собирается в отдельную лунку для возможности его отбора пипеткой. Система оборудуется электрофорезом пульсирующего поля для разделения больших ДНК. Диапазоны фракционирования регулируются ПО, фракции собираются в буфере. Один образец фракционируется на одной готовой агарозной кассете, за один раз можно использовать одну или две кассеты.
  • Количество лунок для разделения, шт. – 12;
  • размеры ДНК фрагментов, п.н. – 1-18000 (в зависимости от применяемой кассеты, с/без применения режим пульс-электрофорез);
  • распределение фрагментов (коэффициент вариации), % - 10-30 (в зависимости от величин фрагментов);
  • молекулярный вес белков, кДа – 10-500 (в зависимости от применяемой кассеты);
  • масса образца (разделение белков), мкг – не более 350;
  • объём образца (разделение белков), мкл – 30;
  • продолжительность разделения, мин – 100-180;
  • выход белков, % - более 50;
  • оптический детектор (возбуждение), нм — 470;
  • оптический детектор (испускание), нм — 525;
  • выходное напряжение, В — от 25 до 150 (постоянное, переменное или пульсирующее);
  • габариты, ШхГхВ, см — 34×27×27;
  • вес, кг — 9.

Комплект поставки: SageELF со встроенным ПК, монитор, клавиатура, мышка.

  • Электрофорез препаративный
Электрофорез — это метод разделения макромолекул (белков и нуклеиновых кислот, а также их фрагментов) под действием электрического поля за счёт их отличий по заряду, молекулярной массе и конфигурации.

Разделение проводят в агарозном, полиакриламидном гелях или электропроводящей жидкости в случае капиллярного электрофореза.

Электрофорез делят на аналитический и препаративный.

Аналитический электрофорез имеет целью только электрофоретическое разделение макромолекул с последующей визуализацией, документированием и анализом полученных данных, для чего могут быть использованы гель-документирующие системы.

Препаративный электрофорез предполагает также электрофоретическое разделение макромолекул и визуальную идентификацию нужной полосы на геле, но с последующим дополнительным вырезанием скальпелем данного фрагмента и элюцией белков или нуклеиновых кислот с помощью буферных растворов, центрифугирования, замораживания, оттаивания и прочего. Данный метод весьма трудоемок, а результат зависит от того насколько компетентен исследователь, проводящий данную процедуру. Упростить данный метод стало возможным благодаря автоматизации процесса. Компания Sage Science предлагает уникальное решение для препаративного электрофореза белков и нуклеиновых кислот. Разделение образцов в данном случае идёт также под действием тока, но в изолированных агарозных капиллярах с разветвлением на концах. При приближении фрагментов требуемого размера к месту разветвления, происходит переключение катодов, искомый фрагмент попадает в боковое ответвление капилляра и собирается в канале для сборки. Капилляры, в которых идёт разгонка образцов, полностью изолированы друг от друга, что снижает риск перекрёстной контаминации. Благодаря готовым гелевым чипам достигается максимальная воспроизводимость экстракции и, как следствие, более точный результат последующих анализов полученных фрагментов. Также возможно электронное документирование полученных данных.

Области применения препаративного электрофореза:
Диаэм предлагает широкий выбор агароз для различных экспериментальных задач, а также маркеры длин ДНК, буферные растворы и другие реагенты для электрофореза (акриламид, бис-акриламид персульфат аммония, ТЕМЕД и др.), красители для визуализации нуклеиновых кислот в геле и оборудование, для горизонтального, вертикального и пульс-электрофореза нуклеиновых кислот.
ss.jpg
ss2.png

Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!