Дата загрузки: 2022-11-10T14:51:14+03:00

Электрофоретические системы Pippin Prep, BluePippin, PippinHT, Sage ELF, Sage Science, обзор, англ., 2020 г. - обзоры товаров и технологий от Диаэм. Смотрите сотни познавательных видео

Видео. Электрофоретические системы Pippin Prep, BluePippin, PippinHT, Sage ELF, Sage Science, обзор, англ., 2020 г.

23.08.2021

/
Пока нет данных. Перейти в каталог
HTP0001
11 571 200, руб.
  • Одновременный прогон до 24 образцов;
  • подготовка образцов, мин — 3;
  • время протекания процесса электрофореза, мин —50-100 (в зависимости от размера фрагментов);
  • разделение образцов идёт в изолированных агарозных капиллярах;
  • максимальная нагрузка фрагментированной геномной ДНК на дорожку, мкг — 1,5;
  • минимальная нагрузка фрагментированной геномной ДНК на дорожку, нг — 15;
  • длина волны возбуждения, нм — 470;
  • длина детекции, нм — 525;
  • напряжение при электрофорезе, В — 75 в режиме постоянного тока и в режиме пульс-электрофореза;
  • точность (режим постоянного тока), % — > 93;
  • воспроизводимость (режим постоянного тока), % — > 92;
  • минимальное распределение по размерам, % — ≤ 8;
  • выход образца, % — 50-80;
  • габариты, ШхГхВ, см — 64 х 33 х 46;
  • вес, кг — 9.
ELF0001
3 018 839, руб.

Система SageELF – электрофорезная система для разделения образцов ДНК или белков по размеру и последующего фракционирования всего образца или его секций на 12 фракций. Целевой фрагмент собирается в отдельную лунку для возможности его отбора пипеткой. Система оборудуется электрофорезом пульсирующего поля для разделения больших ДНК. Диапазоны фракционирования регулируются ПО, фракции собираются в буфере. Один образец фракционируется на одной готовой агарозной кассете, за один раз можно использовать одну или две кассеты.
  • Количество лунок для разделения, шт. – 12;
  • размеры ДНК фрагментов, п.н. – 1-18000 (в зависимости от применяемой кассеты, с/без применения режим пульс-электрофорез);
  • распределение фрагментов (коэффициент вариации), % - 10-30 (в зависимости от величин фрагментов);
  • молекулярный вес белков, кДа – 10-500 (в зависимости от применяемой кассеты);
  • масса образца (разделение белков), мкг – не более 350;
  • объём образца (разделение белков), мкл – 30;
  • продолжительность разделения, мин – 100-180;
  • выход белков, % - более 50;
  • оптический детектор (возбуждение), нм — 470;
  • оптический детектор (испускание), нм — 525;
  • выходное напряжение, В — от 25 до 150 (постоянное, переменное или пульсирующее);
  • габариты, ШхГхВ, см — 34×27×27;
  • вес, кг — 9.

Комплект поставки: SageELF со встроенным ПК, монитор, клавиатура, мышка.

PIP0001
1 509 419, руб.

Система препаративного электрофореза для разделения и выделения только фрагментов ДНК размером от 50 до 8000 п.о.; детекция фракций осуществляется без использования УФ, что гарантирует отсутствие повреждения фрагментов.


Технические характеристики:

  • Одновременный прогон до 5 образцов;
  • напряжение при электрофорезе, В - 100 или 150;
  • ток (на каждую дорожку), мА - 2;
  • длина волны возбуждения, нм – 535;
  • длина детекции, нм – 640;
  • максимальная нагрузка фрагментированной геномной ДНК на дорожку, мкг — 5;
  • минимальная нагрузка фрагментированной геномной ДНК на дорожку, нг — 15;
  • размер ДНК - 100 bp - 1.5 kb;
  • точность выделения, % - > 93;
  • воспроизводимость выделения, % - > 92;
  • минимальное распределение по размерам, % - 8;
  • выход образца, % - 50-80;
  • габариты, ШхГхВ, см - 18x28x53;
  • вес, кг - 7.

Принцип работы:

В системе используются готовые кассеты на пять изолированных капилляров, заполненных агарозным гелем. В конце каждого капилляра есть Y-образное разветвление. Оба выходящих капилляра имеют независимое подключение к катодам. Движение фрагментов ДНК в капилляре как и в «классической» методике происходит под действием тока, но при приближении фрагментов ДНК требуемого размера к месту разветвления, происходит переключение катодов, и искомый фрагмент попадает в боковое ответвление капилляра и собирается в канале для сборки.


Преимущества метода:

  • за один сеанс система может работать параллельно с 4 образцами + 1 внешний стандарт или с 5 образцами при использовании внутреннего стандарта; время подготовки - 3 минуты, время проведения самой процедуры – 50-100 мин в зависимости от размеров фрагментов;
  • благодаря готовым гелевым чипам достигается максимальная воспроизводимость экстракции и, как следствие, более точный результат секвенирования;
  • каналы, в которых идёт разгонка, полностью изолированы друг от друга, что снижает риск перекрёстной контаминации;
  • отбор осуществляется, автоматически в соответствии с заданным через ПО диапазоном длин фрагментов, что может использоваться для секвенирования спаренных концов.

Области применения:

  • приготовление библиотек при проведении NGS;
  • подготовка образцов для парноконцевого секвенирования, ChIP-секвенирования;
  • улучшение библиотек при проведении эмульсионной ПЦР;
  • выделение белков и НК.

Характеристики картриджей:

0,75% агарозные картриджи BluePippin 0,75% агарозные картриджи PippinPrep 1,5% агарозные картриджи 2% агарозные картриджи 3% агарозные картриджи
Количество образцов 4 4 4 4 4
Диапазон размеров НК 1000-50000 п.о. 2000-8000 п.о. 180-1500 п.о. 100 – 600 п.о. 50 – 200 п.о.
Точность детекции, %

± 5 (с интеркалирующим красителем)

± 10 (без красителя)

± 5 (с интеркалирующим красителем)

± 10 (без красителя)

± 5 (с интеркалирующим красителем)

± 10 (без красителя)

± 5 (с интеркалирующим красителем)

± 10 (без красителя)
± 5
BLU0001
9 601 200, руб.
BluePippin — система препаративного электрофореза и пульс-электрофореза, позволяет разделять и выделять фрагменты НК, размером 90-50000 п.н., а так же белки массой 18-200 кДа.

  • Одновременный прогон до 5 образцов;
  • напряжение при электрофорезе, В — 25, 100 и 150 (постоянный ток), или 100 в режиме пульс-электрофореза;
  • ток (на каждую дорожку), мА — 2 или 3;
  • длина волны возбуждения, нм — 470;
  • длина детекции, нм — 525;
  • максимальная нагрузка фрагментированной геномной ДНК на дорожку, мкг — 5;
  • минимальная нагрузка фрагментированной геномной ДНК на дорожку, нг — 15;
  • размер ДНК - 100 bp - 50 kb;
  • точность выделения, % - > 93;
  • воспроизводимость выделения, % - > 92;
  • минимальное распределение по размерам, % - 8;
  • выход образца, % - 50-80;
  • габариты, ШхГхВ, см — 28х53х18;
  • вес, кг — 7.

Области применения:

Принцип работы: в системе используются готовые картриджи на пять изолированных капилляров, заполненных агарозным гелем разной процентной концентрации, которая выбирается пользователем в зависимости от величины фрагмента образца. В конце каждого капилляра имеется Y-образное разветвление. Оба выходящих капилляра имеют независимое подключение к катодам. Движение фрагментов ДНК в капилляре как и в «классической» методике происходит под действием тока, но при приближении фрагментов ДНК требуемого размера к месту разветвления, происходит переключение катодов, и искомый фрагмент попадает в боковое ответвление капилляра и собирается в канале для сборки. Для проведения электрофореза нуклеиновых кислот используется Tris-TAPS (или Трис-ТАПС) буфер, для белков — SDS-буфер. Программное обеспечение определяет время элюирования на основе миграции ДНК-маркера.

4 режима программирования:

  1. Tight (узкий) – сбор коротких фрагментов образца, выбирается в основном для работы с молекулами небольших размеров.
  2. Range (диапазон) – пользователь может сам выбрать диапазон размера фракций который ему необходим. Подход используется, когда не важна высокая точность исследования.
  3. Time (время) – коллекционирование образцов происходит в зависимости от заданного времени. Подход используется, когда не важна высокая точность исследования.
  4. Peak (пик) – сбор пиков (нескольких фрагментов разного размера).

3 стратегии детектирования фракций:

  • Для ДНК малых размеров (90 п.н. -1,5 тыс.п.н.):
    Стратегия без окрашивания с внутренними флуоресцентно-мечеными маркерами. В качестве внутренних стандартов используются флуоресцентно-меченые маркеры ДНК, определенной молекулярной массы. Добавляются в лунку совместно с исследуемым образцом. Одновременно возможен анализ 5 образцов.
  • Для ДНК больших размеров (> 2 тыс. п.н.):
    Стратегия без окрашивания с внешним флуоресцентно-меченым маркером. В качестве внешнего стандарта используется флуоресцентно-меченый маркер ДНК определённой молекулярной массы, добавляется в отдельную лунку. Одновременно возможен анализ 4 образцов + 1 внешний стандарт.
  • Для выделения ДНК с дорожки (band capture) (> 2 тыс. п.н.):
    Окрашивание образцов флуоресцентным красителем Midori Green. Образцы окрашиваются флуоресцентным красителем Midori Green. Одновременно возможен анализ 4 образцов + 1 внешний стандарт.

Преимущества метода:

  • Время подготовки — 3 минуты, время проведения самой процедуры — 50-100 мин в зависимости от размеров фрагментов.
  • Благодаря готовым гелевым чипам достигается максимальная воспроизводимость экстракции и, как следствие, более точный результат секвенирования.
  • Каналы, в которых идёт разгонка, полностью изолированы друг от друга, что снижает риск перекрёстной контаминации.
  • Отбор осуществляется, автоматически в соответствии с заданным через ПО диапазоном длин фрагментов, что может использоваться для секвенирования спаренных концов.
  • Отбор образцов из пробоотборной камеры производится вручную с помощью стандартного дозатора.

Схема работы:

  1. Пробоподготовка:
    • Подготовка материала, если используются внутренние стандарты: образец ДНК довести до 30 мкл ТЕ буфером, добавить 10 мкл флуоресцентно - меченного маркера.
    • Подготовка материала, если используется внешний стандарт: образец ДНК довести до 30 мкл ТЕ буфером, добавить 10 мкл загрузочного раствора. 40 мкл готового стандарта помещается в отдельную дорожку.
    • В случае с красителем Midori Green, 40 мкл красителя помещается в каждую из пяти + буферную камеру и при включении тока будет двигаться на встречу образцам.
  2. Эксперимент:
    • Выбираем картридж в соответствии со стратегией, с помощью которой будет производиться детектирование НК;
    • помещаем картридж в прибор и выбираем её в ПО из списка предложенных программой (ПО само установит все необходимые параметры для проведения электрофореза под выбранный картридж);
    • По истечении времени, заданного программой, образец аккуратно собираем из коллектора фракций пипеточным дозатором.

Информация о свежих статьях:

1. Nature Methods. Assembly and diploid architecture of an individual human genome via single-molecule technologies (июнь, 2015); Authors: Matthew Pendleton, Robert Sebra, Andy Wing Chun Pang, Ajay Ummat et al.
2. BioTechniques. Optimization and cost-saving in tagmentation-based mate-pair library preparation and sequencing. (май, 2015) DOI:10.1038/nmeth.3454; Authors: Kaori Tatsumi, Osamu Nishimura, Kazu Itomi, Chiharu Tanegashima, and Shigehiro Kuraku.

Видео:
Системы препаративного электрофореза BluePippin и Pippin Prep

Для проведения пульс-электрофореза применяется специальный источник питания Pippin Pulse.

К списку видеороликов

Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!