Электрофорез нуклеиновых кислот Выбраны параметры: Красители интеркалирующие для визуализации нк

dsGreen — безопасный краситель, используемый в целях регистрации НК в гелях при электрофорезе (агарозных или ПААГ).

dsGreen проявляет себя как избирательный в направлении ДНК краситель, без явной мутагенности. Возбуждение происходит благодаря ультрофиолетовому, либо синиму свету. Чувствительность dsGreen выше аналогичного бромистого этидия: 0,08 нг на полосу для ДНК против 2 нг на полосу.

Продукт поставляется в виде сухого оранжевого вещества в герметичной пробирке. Твердый вид продукта способствует длительному сроку хранения. При соблюдении условий хранения (защищенное от света место и температура -20 °C) краситель имеет срок хранения 24 месяца или 2 года.

dsGreen — безопасный краситель, используемый в целях регистрации НК в гелях при электрофорезе (агарозных или ПААГ).

dsGreen проявляет себя как избирательный в направлении ДНК краситель, без явной мутагенности. Возбуждение происходит благодаря ультрофиолетовому, либо синиму свету. Чувствительность dsGreen выше аналогичного бромистого этидия: 0,08 нг на полосу для ДНК против 2 нг на полосу.

Продукт поставляется в виде оранжевого жидкого вещества в герметичной пробирке. При соблюдении условий хранения (защищенное от света место и температура -20 °C) краситель имеет срок хранения 12 месяцев или 1 год.

dsSafe — безопасный краситель, используемый в целях регистрации НК в гелях при электрофорезе (агарозных или ПААГ). dsSafe проявляет себя как избирательный в направлении ДНК краситель, без явной мутагенности. Возбуждение происходит благодаря ультрофиолетовому, либо синиму свету. Это может быть полезно, так как фоновая засветка будет ниже при голубом свет, чем при УФ. Также ДНК не подвергается излишниму излучению, что способствует увеличению результативности клонирования.

Продукт поставляется в виде оранжевого жидкого вещества в герметичной пробирке. При соблюдении условий хранения (защищенное от света место и температура -20 °C) краситель имеет срок хранения 24 месяца или 2 года.

Бромистый этидий является наиболее часто используемым красителем нуклеиновых кислот в акриламидном и агарозном геле. Флуоресценция красителя увеличивается в 21 раз при связывании с двухцепочечной РНК и в 25 раз при связывании с двухцепочечной ДНК.

Упаковка – 5 г в стеклянной бутылке.

Краситель Hi-SYBr Safe представляет собой инновационное решение, разработанное в качестве более безопасной альтернативы бромиду этидия для окрашивания нуклеиновых кислот в процессе гель-электрофореза.

Этот краситель позволяет визуализировать гель как с помощью УФ-трансиллюминатора, так и с использованием трансиллюминатора синего света. Он способен обнаруживать двухцепочечные фрагменты ДНК (dsDNA) в концентрации до 0,1 нг при проведении электрофореза.

Hi-SYBr Safe обладает высокой специфичностью к дцДНК и обеспечивает незначительный фоновый сигнал. Его чувствительность в 10 раз превосходит чувствительность бромида этидия.

Краситель поставляется в виде раствора в диметилсульфоксиде (ДМСО) с концентрацией 10'000х.

Условия хранения: при температуре ‐ 20 °C, защищенный от света в эксикаторе.

• Цвет — красный.
• Концентрация основного вещества, мг/мл — 5.
• Чистота, % — 97 (HPCE).
• Длина волны возбуждения флуоресценции, нм — 520.
• Длина волны испускания флуоресценции, нм — 560.
• Температура вспышки, °С — 87.
• Условия хранения, °С — 2-8, в темном месте.

ProteOrange — краситель, применяемый в гелях, с целью регистрации белков, методом избирательного взаимодействия с белками в условиях наличия НК, полисахаридов и др. молекул. Данный краситель проявляет чувствительность выше (выявляет 3 нг белка), чем аналог Кумасси (бриллиантовый синий), выявляющий примерно 30 нг белка в полоске. При этом он взаимодействует с белковой оболочкой, состоящей из додецилсульфата натрия, уменьшая вариабельность прокрашивания разных белков.

Продукт продается в виде оранжевого жидкого вещества в герметичной пробирке. При соблюдении условий хранения (защищенное от света и влаги место, температура -20 °C) краситель имеет срок хранения 24 месяца или 2 года.

Краситель SerRed — предназначен для окрашивания дцДНК, ssDNA или РНК в агарозных гелях или полиакриламидных гелях, наиболее чувствителен к дцДНК.

Преимущества красителя SerRed

• чувствительность выше, чем у бромистого этидия;
• нетоксичен;
• термостабилен: можно добавлять непосредственно в горячий агарозный раствор;
• совместим со всеми стандартными буферами для электрофореза.

Примечание: холодное хранение не требуется, хранить при комнатной температуре во избежание выпадения осадка, при наличии осадка нагреть краситель SerRed до 45-50 °С в течение 2 мин и перемешать до растворения осадка.

Условия хранения: при комнатной температуре в защищенном от света месте.

• Цвет — оранжевый.
• Длина волны возбуждения флуоресценции, нм — 300 (УФ), 495 (голубой).
• Длина волны испускания флуоресценции, нм — 537 (желтый).
• Температура вспышки, °С — 87.
• Условия хранения — -20 °C, в темном месте.

Краситель Ultra GelRed предназначен для окрашивания дцДНК, оцДНК или РНК в агарозном геле или полиакриамидном геле, менее токсичен, чем бромистый этидий, имеет высокую термостабильность и высокую чувствительностью к обнаружению следовых количеств ДНК, особенно следовой низкомолекулярной ДНК. Под ультрафиолетовым светом, ДНК проявляет красную флуоресценцию.

Преимущества красителя Ultra GelRed

• Нетоксичный: макромолекулярные характеристики красителя Ultra GelRed делают его неспособным проходить клеточную мембрану и проникать в клетки;
• широкий спектр применений: подходит для электрофореза в агарозном геле или полиакриламидном геле; может использоваться для окрашивания дцДНК, оцДНК и РНК;
• высокая чувствительность: подходит для окрашивания электрофорезом различных размеров и очень чувствителен к низким концентрациям и следовым количествам ДНК;
• сильный флуоресцентный сигнал образца с низким фоновым сигналом;
• высокая стабильность: обладает той же стабильностью, что и бромистый этидий, и не разлагается во время подготовки геля и электрофореза.

Условия хранения: 15-25 °С, в защищенном от света месте.

Цианиновый краситель dsGold известен под названием «Oxazole Gold», окрашивает двуцепочечную и одноцепочечную ДНК, РНК при электрофорезе.

Данный краситель связывается с нуклеиновыми кислотами и усиливает флуоресцентный сигнал более чем в 1000 раз. Превосходит по характеристикам другие интеркалирующие агенты, такие как EtBr, dsGreen или ssGreen.

Флуоресцентные пики dsGold наблюдаются при длинах волн: 300 нм и 495 нм, а также при 546 нм, что обеспечивает возможность визуализации гелей под УФ и синим источниками возбуждения т. dsGold очень чувствителен и позволяет определить концентрацию ДНК в гелях с денатурирующими условиями детектирует всего 25 пг. Не связанный краситель обладает низким уровнем флуоресценции, поэтому не требует дополнительного промывания из геля с помощью формальдегида.
dsGold совместим с различными ферментами и техниками, включая Т4 ДНК-лигазу, Taq-полимеразу, рестриктазы, нортерн- и Саузерн-блоттинг.

Рекомендуется разводить в буферах TE, TBE, TAE, инкубировать гель в 1-кратном растворе от 10 до 40 мин.

Форма выпуска: 10 000х концентрат в DMSO.

Высокосенситивный ssGreen — окрашивает молекулы РНК и обладает большим сродством к ним, давая более высокий сигнал флуоресценции, по сравнению с однонитевой ДНК после электрофоретического разделения молекул в агарозном или полиакриламидном геле. Спектры поглощения комплекса РНК и красителя ssGreen.

PreciseGreen — инновационный краситель на основе бензотиазола, который специфично связывается с двунитевой ДНК. Раствор PreciseGreen 200х в ДМСО. Этот флуоресцентный сенсор позволяет детектировать эмиссию в канале флуоресцеина с использованием кюветного или микропланшетного флуориметра, или другого специализированного оборудования для анализа ДНК. Флуоресцентный сигнал PreciseGreen напрямую зависит от концентрации молекул ДНК и позволяет точно определить ее концентрацию в диапазоне от 10 пкг до 100 нг на 1 миллилитр образца.

Линейный полиакриламид (соосадитель) — это инертный материал, не содержащий энзимов, так как получен путем химического синтеза. Данный продукт используется для осаждения и экстракции нуклеиновых кислот из растворов с малой концентрацией. Линейный полиакриламид (соосадитель) не дает сигнал при A260/280 и не изменяет спектр поглощения нуклеиновых кислот. Данное свойство линейного полиакриламида используется для осаждения фрагментов нуклеиновых кислот размером более 15 п.о., и позволяет разделить продукты ПЦР-амплификации.

Определение концентрации молекул РНК в лаборатории важно для количественной оценки генной экспрессии, контроля качества и оценки эффективности проводимых исследований, является неотъемлемой частью многих молекулярно-биологических и генетических исследований.

Высокочувствительный краситель Ribo488 избирательно связывает РНК и испускает яркий зеленый сигнал в области 500/525 нм. Интенсивность флуоресценции прямопропорционально зависит от содержания молекул РНК в образце. Краситель Ribo488 применяется с целью окрашивания РНК в следующих экспериментах:

• подготовка образцов для микрочипов;
• ОТ-ПЦР;
• Норзерн-блотт;
• анализ с использованием S1-нуклеазы;
• подготовка кДНК библиотек.

Характеристики красителя Ribo488

• Форма поставки — 400 мкМ раствор в безводном DMSO;
• хранение: при −20°C;
• реактив производится в двух фасовках: 100 uL, 1ml;
• готовый к использованию раствор реагента рекомендуется использовать в течение нескольких часов после приготовления, в недоступном для света месте.

Этидиум бромид (бромистый этидий) в растворе с концентрацией 10 мг/мл является эффективным красителем для визуализации нуклеиновых кислот в акриламидном и агарозном гелях. Этот реагент, известный также как 3,8-диамино-5-этил-6-фенилфенантридиния бромид или Homidium bromide (CAS-No. 1239-45-8), легко флуоресцирует красновато-коричневым цветом под воздействием ультрафиолетового света. Флуоресценция этидиума бромида (ethidium bromide) усиливается в 21 раз при связывании с двухцепочечной РНК и в 25 раз при связывании с двухцепочечной ДНК. Химическая формула данного красителя — C₁₂H₂₀BrN₃, молекулярный вес составляет 394,31 г/моль. Содержание активного вещества в продукте достигает 95%. Внешний вид бромистого этидия представляет собой темно-красную жидкость, которая хорошо растворяется в воде. Продукт подходит для всех процедур выделения ДНК, что подтверждено тестами на соответствие.

Этидий бромистый — краситель для визуализации нуклеиновых кислот в акриламидном и агарозном геле. Легко флуоресцирует красновато-коричневым цветом при воздействии ультрафиолета, флуоресценция бромистого этидия увеличивается в 21 раз при связывании с двухцепочечной РНК и в 25 раз при связывании с двухцепочечной ДНК.