Высокопроизводительное генотипирование в сельском хозяйстве и ветеринарии. | Диаэм


Высокопроизводительное генотипирование в сельском хозяйстве и ветеринарии.

18.11.2021

Современная селекция базируется на использовании молекулярных маркеров (последовательностей нуклеотидов). Микрочипы Axiom (технология microarray) предоставляют селекционерам мощный инструмент для идентификации, проверки и скрининга генетических признаков растений и животных. Панели AgriSeq (технология таргетного секвенирования) позволяют анализировать конкретные участки генома (локусы), а не весь геном целиком. Данные технологии значительно упрощают и ускоряют работы по генотипированию.


Микрочипы Axiom

Генотипирование при помощи ДНК-микрочипов позволяет эффективно исследовать геномы любой плоидности и размера. За одно исследование возможно проанализировать сотни тысяч маркеров, включая точечные полиморфизмы (SNP), инсерции, делеции, изменчивость копийности участков генома (CNV). Широкий охват маркеров позволяет выбрать наиболее информативные, в том числе для разработки микрочипов для рутинной диагностики или оптимизации дизайна панелей AgriSeq.

Особенности микрочипов Axiom:

  • отсутствие выпадений маркеров (SNP dropout) на конкретном планшете и между разными партиями, поскольку зонды наносятся непосредственно на подложку методом фотолитографии;
  • нет необходимости в валидации партии микрочипов (подтверждения наличия всех маркеров);
  • планшеты различной плотности: 24-, 96-, mini 96-, 384-матричные форматы;
  • индивидуальный дизайн чипов на основе базы маркеров Axiom Genomic Database;
  • помощь профессиональных биоинформатиков в подборе маркеров для конкретной задачи;
  • возможность использовать на одном планшете маркеры для разных биологических видов без ограничений по количеству видов и маркеров на каждый вид;
  • возможность анализа SNP, расположенных в геноме на расстоянии от 10 п.н. друг от друга;
  • полностью автоматизируемый и легко масштабируемый процесс;
  • срок годности микрочипа — 24 месяца.

96-формат


384-формат


Мини 96-формат



  • Высокая плотность — от 65 000 до 650 000 маркёров.
  • Высокая производительность.
  • Полногеномный скрининг.
  • Выбор маркёров для рутинного скрининга.

  • Средняя плотность — от 100 до 650 000 маркёров.
  • Высокая производительность.
  • Рутинные задачи.

  • Средняя плотность — от 100 до 650 000 маркёров (состав идентичен чипу 384-матричного формата).
  • Меньшее количество образцов.
  • Рутинные задачи.


Информация для заказа:

Пока нет данных. Перейти в каталог
Фильтр
Цена в валюте производителя / в рублях
901791
845 070,=
11 137,= USD
  • Микрочип Axiom для генотипирования круп-ного рогатого скота (96-матричный формат, 640 000 маркеров)
550588
По запросу
По запросу
  • Микрочип Axiom для генотипирования свиней (96-матричный формат, 658 000 маркеров)
902148
По запросу
По запросу
  • Микрочип Axiom для генотипирования кур (96-матричный формат, 580 000 маркеров)
550538
По запросу
По запросу
  • Микрочип Axiom для генотипирования индеек (96-матричный формат, 643 000 маркеров)
550583
хранение -20°C
По запросу
По запросу
  • Микрочип Axiom для генотипирования лошадей (96-матричный формат, 670 000 маркеров)
550772
По запросу
По запросу
  • Микрочип Axiom для генотипирования собак (96-матричный формат, 670 000 маркеров)
550669
По запросу
По запросу
  • Микрочип Axiom для генотипирования кроликов (96-матричный формат, 200 000 маркеров)

Таргетное секвенирование. Панели AgriSeq

Особенности панелей AgriSeq:

  • комплексное решение от проектирования панелей до внедрения;
  • возможность создания индивидуальных пользовательских панелей (срок 2-6 недель);
  • наличие более 130 индивидуальных (custom) панелей для 29 видов животных и растений;
  • собственная русскоязычная команда специалистов по биоинформатике для разработки индивидуальных панелей под задачи конкретного пользователя;
  • количество анализируемых точечных полиморфизмов (SNP) — от 50 до 5000 на панель;
  • время, требуемое для анализа — 2 суток;
  • ожидаемый уровень определения (call rates) — 95%;
  • максимальное количество анализируемых образцов (чип Ion 550, 100-кратное покрытие) — 1536;
  • высокая степень масштабируемости и автоматизации.


Информация для заказа:

Пока нет данных. Перейти в каталог
Фильтр
Цена в валюте производителя / в рублях
A43406
хранение -30...-5°C
По запросу
По запросу
  • Панель AgriSeq для выявления отдельных признаков и заболеваний псовых (154 маркера), 960 реакций
A43407
хранение -30...-5°C
По запросу
По запросу
  • Панель AgriSeq для определения происхождения и выявления видовой принадлежности псовых (381 SNP маркеров), 960 реакций
A43408
хранение -30...-5°C
По запросу
По запросу
  • Панель AgriSeq для определения происхождения (111 маркеров) и выявления клинически значимых признаков кошачьих (64 маркера), 960 реакций
A35297
хранение -30...-5°C
123 813,=
1 632,= USD
  • Панель AgriSeq для определения происхождения крупного рогатого скота (200 маркеров, рекомендованных ISAG - Международное общество генетики животных), 960 реакций
A31975
По запросу
По запросу
  • Индивидуальная панель AgriSeq (растения, животные, аквакультур

См. также:


Ниже вы можете задать вопрос или оставить запрос в свободной форме

Раскрыть анкету для отправки запроса

Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!