История
История
|
Выявление разновидностей HLA называется HLA-типированием. HLA-типирование не является рутинным обследованием, но в ряде случаев оно необходимо. В первую очередь, HLA-типирование играет ключевую роль при трансплантации. Успешность трансплантации напрямую зависит от совместимости клеток донора и реципиента по HLA, главным образом по HLA-DR. Поэтому HLA-типирование обязательно при создании банков костного мозга и пуповинной крови. HLA-типирование необходимо при диагностике причин невынашивания беременности. Некоторые сочетания HLA-генотипов супругов являются несовместимыми, и для сохранения плода необходима иммунотерапия. Кроме того, ряд HLA-генотипов cвязан с повышенным риском аутоиммунных заболеваний, онкологии или повышенной восприимчивостью (или, наоборот, устойчивостью) к инфекционным болезням, таким, как гепатит С. Методы HLA-типирования можно разделить на 2 группы: иммунологические (серологические) и генетические. Серологические методы менее затратные, но достаточно трудоёмки, и точность этих методов относительно невысока. Поэтому генетические методы становятся всё более распространёнными. |
|
В настоящее время распространены следующие генетические методы:
|
|
SSP (метод специфических праймеров, sequence-specific primers) |
SSO (метод специфических олигонуклеотидов, sequence-specific oligonucleotides) |
|
|
|
|
| В основе метода — ПЦР с праймерами, специфичными к определённому варианту или группе вариантов, а затем продукты амплификации анализируются электрофорезом. Метод позволяет достаточно быстро произвести типирование, но могут быть ошибки. Также может потребоваться много анализов для получения точного генотипа. | В основе метода — гибридизация ДНК со специфическими олигонуклеотидами, меченными по технологии xMap. Чипы после гибридизации анализируются на мультиплексном проточном анализаторе (например, Bio-Plex 3D). Эти методы позволяют провести типирование достаточно быстро, но не со 100% точностью. Недостаток этих методов — невозможность точно типировать вариант с нуля. За один прием можно или определить HLA-тип в каких-то рамках, или уточнить тип на основании имеющихся данных. Для получения полного генотипа потребуется множество анализов. |
Секвенирование
Секвенирование по Сэнгеру (SBT-typing). Так как гены главного комплекса гистосовместимости (MHC, Major Histocompatibility Complex) имеют значительную протяжённость, то секвенируются только вариабельные области генов HLA (отдельные экзоны). Это точный и быстрый метод, но низкая производительность и недостаточно полное типирование делают его пригодным только для уточнения HLA-типа. Также возможны ошибки при анализе гетерозигот.|
NGS. С помощью полногеномного секвенирования можно получить полную последовательность всех генов главного комплекса гистосовместимости. Основные трудности — специфическая амплификация области генома, содержащей эти гены, и правильная интерпретация результатов секвенирования. Комплекты для HLA-типирования Holotype HLA, Omixon успешно решают обе задачи. Продукт включает в себя набор реагентов для пробоподготовки, в том числе уникальные праймеры для специфической амплификации до 11 локусов HLA, а также программное обеспечение
HLA Twin для интерпретации результатов секвенирования. Holotype HLA предназначен для секвенирования на платформе Illumina и обеспечивает высокую производительность — за один прогон на секвенаторе MiSeq можно проанализировать от 4 до 96 образцов по 11 локусам, до 192 образцов по 7 локусам или до 288 образцов по 5 локусам. Полное и равномерное покрытие всей области генов главного комплекса гистосовместимости сочетается с балансом между аллелями в одном локусе, между локусами в одном образце и между образцами в одном анализируемом пуле ДНК. Достоверность интерпретации результатов обеспечивается двумя независимыми алгоритмами консенсусного и статистического генотипирования. Также программное обеспечение HLA Twin даёт возможность выявления нулевых и новых аллелей генов МНС. Ещё одно преимущество — HLA Twin может использоваться на платформах Windows, OS X и Linux. Кроме Holotype HLA, Omixon предлагает другие продукты: наборы Monotype HLA и программное обеспечение HLA Explore. Наборы Monotype HLA предназначены для генотипирования отдельных локусов МНС, связанных с повышенным риском некоторых заболеваний. Например, набор Monotype HLA-DQ предназначен для выявления аллелей риска целиакии и нарколепсии. Возможен также дизайн праймеров для анализа любых локусов по заказу исследователя. |
|
|
|
|
Наборы Holotype HLA предназначены для типирования генов HLA I класса по локусам HLA-A, B, С и II класса HLA- DQA1/B1, DRB1/B3/B4/B5, DPA1/B1.
Продукт доступен в двух форматах – для одновременного анализа 24 или 96 образцов по 5, 7 или 11 локусам HLA. Планшеты, входящие в состав набора, для удобства по желанию клиента могут идти в трех конфигурациях – A, B, C. Это подразумевает, что каждый последующий планшет продолжает нумерацию предыдущего. Таким образом, с 3-мя наборами 96/5 можно проанализировать до 288 образцов, имея планшеты с тремя конфигурациями. Все наборы Holotype HLA соответствуют стандарту ISO-13485 / GMP. Для продуктов, анализирующих одновременно 7 и 11 локусов HLA, возможна маркировка CE-IVD, подтверждающая соответствие требованиям ЕС. |
|
| Тип набора | Локусы | Количество анализируемых образцов |
| Набор из 5 локусов | A, B, C, DRB1, DQB1 | 96 |
| Набор из 7 локусов | A, B, C, DRB1, DQA1/B1, DPB1 | 24/96 |
| Набор из 11 локусов | A, B, C, DRB1/B3/B4/B5, DQA1/B1, DPA1/B1 | 24/96 |
|
Наборы Monotype HLA предназначены для типирования отдельных локусов HLA-B и DQ. Они используются, в основном, для выявления отдельных заболеваний, исследований в области популяционной генетики и тестирования чувствительности к лекарственным средствам. Так же, как и Holotype HLA, Monotype HLA доступны в 2 форматах – для одновременного анализа 24 или 96 образцов в трех конфигурациях. Состав продуктов Holotype HLA и Monotype HLA:
Программное обеспечение HLA Twin защищено ключами и поставляется бесплатно для пользователя при покупке набора. В случае использования набора Monotype HLA с самостоятельно сконструированными праймерами Omixon предлагает к использованию специально разработанное ПО HLA Explore. |
|
HLA 24/7
|
|
24 образца
|
|
РУ
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие
Росздравнадзора
|
По запросу По запросу |
|
|
|
||||
|
Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека. Подготовка образцов
Подготовка библиотеки
Секвенирование
Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN
Технические характеристики Набора Holotype HLA 24/7
|
||||||||||||
|
|
||||||||||||
С помощью личного кабинета Вы сможете:
Сравнение
