Генотипирование

Наборы реагентов для постановки специфических ПЦР для постановки ПЦР, ориентированных на STR-анализ, анализ микросателит, мультиплексный анализ, выявление мутаций, SNP, анализ на метилирование; содержат HotStarTaq Plus DNA Polymerase (модифицированная рекомбинантная ДНК полимераза из Th. aquaticus (94 кДа), клонированная в E. coli, для постановки стандартных ПЦР "горячий старт"), нуклеотиды, буферы и активные компоненты в формате мастер-микс (готовая валидированная смесь для проведения эффективной ПЦР).

Набор предназначен для определения аллелей А и В гена каппа-казеина крупного рогатого скота. Эти аллели являются маркерами молочной продуктивности коров и отличаются нуклеотидами, кодирующими аминокислотные остатки в 136 и 148 положениях в последовательности каппа-казеина, что влияет, в свою очередь, на термостабильность этого белка. Вариант А несёт треонин в 136 положении и аспарагиновую кислоту в 148 положении, вариант В - изолейцин и аланин, соответственно. Молоко, полученное от носителей аллеля В, характеризуется более высоким содержанием белка, способностью образовывать мицеллы меньшего размера, повышенной термостабильностью и считается более подходящим сырьём для производства творога и сыра.

Определение аллельного полиморфизма гена каппа-казеина производится методом анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (RFLP) — расщепления специфических ПЦР-продуктов эндонуклеазами рестрикции с последующим электрофоретическим разделением фрагментов, полученных в ходе рестрикции. В качестве матрицы для ПЦР используется геномная ДНК крупного рогатого скота.

Набор Holotype HLA 24/11 предназначен для типирования генов HLA по 11 локусам –HLA- A, B, C, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1. Набор рассчитан на 24 образца.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 24 образцов;
• 96-луночный планшет;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 24/11 предназначен для типирования генов HLA по 11 локусам –HLA- A, B, C, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1. Набор рассчитан на 24 образца.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 24 образцов;
• 96-луночный планшет;
• программное обеспечение HLA Twin.

Продукт имеет маркировку CE-IVD, подтверждающую соответствие требованиям ЕС.

Набор Holotype HLA 24/5 предназначен для типирования генов HLA по 5 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQB1. Набор рассчитан на 24 образца.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 24 образцов;
• 96-луночный планшет;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 24/7 предназначен для типирования генов HLA по 7 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQA1, DQB1, DPB1. Набор рассчитан на 24 образца

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 24 образцов;
• 96-луночный планшет;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 24/7 CE предназначен для типирования генов HLA по 7 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQA1, DQB1, DPB1. Набор рассчитан на 24 образца

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 24 образцов;
• 96-луночный планшет;
• программное обеспечение HLA Twin.

Продукт имеет маркировку CE-IVD, подтверждающую соответствие требованиям ЕС.

Набор Holotype HLA 96/11 предназначен для типирования генов HLA по 11 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 1 по 96;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/11 предназначен для типирования генов HLA по 11 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 97 по 192;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/11 предназначен для типирования генов HLA по 11 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок со 193 по 288;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/11 предназначен для типирования генов HLA по 11 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 1 по 96;
• программное обеспечение HLA Twin.

Продукт имеет маркировку CE-IVD, подтверждающую соответствие требованиям ЕС.

Набор Holotype HLA 96/5 предназначен для типирования генов HLA по 5 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 1 по 96;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/5 предназначен для типирования генов HLA по 5 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 97 по 192;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/5 предназначен для типирования генов HLA по 5 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 193 по 288;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/7 предназначен для типирования генов HLA по 7 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQA1, DQB1, DPB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 1 по 96;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/7 предназначен для типирования генов HLA по 7 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQA1, DQB1, DPB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 97 по 192;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/7 предназначен для типирования генов HLA по 7 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQA1, DQB1, DPB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок со 193 по 288;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA 96/7 предназначен для типирования генов HLA по 7 локусам – HLA- A, B, C, DRB1, DQA1, DQB1, DPB1. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет с нумерацией лунок с 1 по 96;
• программное обеспечение HLA Twin.

Продукт имеет маркировку CE-IVD, подтверждающую соответствие требованиям ЕС.

Набор Holotype HLA-AB 96 предназначен для типирования генов HLA по локусам HLA-A и B. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA-B 96 предназначен для типирования генов HLA по локусу HLA-B. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет;
• программное обеспечение HLA Twin.

Набор Holotype HLA-DQ 96 предназначен для типирования генов HLA по локусу HLA-DQ. Набор рассчитан на 96 образцов.

Состав:

• праймеры;
• набор реагентов для пробоподготовки и специфической амплификации 96 образцов;
• 96-луночный планшет;
• программное обеспечение HLA Twin.

Наборы для постановки ПЦР в реальном времени для ПЦР в реальном времени геномной, вирусной и комплиментарной ДНК, в том числе для анализа мРНК: QuantiTect - наборы для стандартной ПЦР на основе HotStarTaq рекомбинантной ДНК-полимеразы из Th. aquaticus (94 кДа), активирующейся в течение 15 мин при 95 °С); QuantiFast - наборы для высокоскоростной ПЦР на основе HotStarTaq Plus рекомбинантной ДНК-полимеразы, активирующейся в течение 5 мин при 95 °С).
Наборы содержат красители (опционально ROX, SYBRgreen), буферы, нуклеотиды и активные компоненты в формате мастер-микс (готовая валидированная смесь для проведения эффективной ПЦР в режиме реального времени с системами детекции SYBRgreen, TaqMan, FRET probes, Molecular Beacons); совместно с наборами QuantiTect возможно использование урацил-N-гликозилазы (для удаления ПЦР-продуктов, инактивируется при 95 °С в течение 15 мин).

Наборы реагентов для постановки специфических ПЦР для постановки ПЦР, ориентированных на STR-анализ, анализ микросателит, мультиплексный анализ, выявление мутаций, SNP, анализ на метилирование; содержат HotStarTaq Plus DNA Polymerase (модифицированная рекомбинантная ДНК полимераза из Th. aquaticus (94 кДа), клонированная в E. coli, для постановки стандартных ПЦР "горячий старт"), нуклеотиды, буферы и активные компоненты в формате мастер-микс (готовая валидированная смесь для проведения эффективной ПЦР).

Наборы реагентов для постановки специфических ПЦР для постановки ПЦР, ориентированных на STR-анализ, анализ микросателит, мультиплексный анализ, выявление мутаций, SNP, анализ на метилирование; содержат HotStarTaq Plus DNA Polymerase (модифицированная рекомбинантная ДНК полимераза из Th. aquaticus (94 кДа), клонированная в E. coli, для постановки стандартных ПЦР "горячий старт"), нуклеотиды, буферы и активные компоненты в формате мастер-микс (готовая валидированная смесь для проведения эффективной ПЦР).

Платформа Affymetrix – это комплексные решения для высокопроизводительного генетического анализа, в основе которых лежит гибридизация флуоресцентно-меченных фрагментов генома с олигонуклеотидными ДНК-зондами, закрепленными на твердой подложке (технология ДНК-микрочипов). Эти решения широко используются для фундаментальных и прикладных исследований ДНК (для генотипирования) и РНК (для анализа экспрессии генов). Формат ДНК-чипов: картриджи, плашки или стрипы. Задайте вопросы или оформите заказ у специалистов Диаэм: Кристина Яковлева +7 (495) 745-05-08 доб. 109, kyakovleva@dia-m.ru; Михаил Минашкин +7 (495) 745-05-08, mminashkin@dia-m.ru.

Гибридизационный ДНК-чип представляет собой твёрдую поверхность, на которую методом фотолитографического синтеза нанесены ДНК-олигонуклеотиды заданной последовательности (так называемые зонды). Зонды могут гибридизоваться с комплиментарными областями фрагментов ДНК, кДНК или РНК, которые предварительно помечены специальными флуоресцентными молекулами. Гибридизация зондов с целевой НК определяется путём детекции флуоресценции или хемилюминесценции. Задавая нужную последовательность ДНК-зондов, можно конструировать чипы для выявления практически любых последовательностей ДНК, определения точечных полиморфизмов (SNP), анализа копийности любых участков генома (CNV), определения видовой принадлежности ДНК, а также анализа экспрессии генов, для полногеномного анализа, молекулярного кариотипирования, онкологии. Особо стоит отметить широкую линейку ДНК-чипов для агрогенетики: идентификации и паспортизации сортов и пород сельскохозяйственных растений и животных, а также для ДНК-скрининга селекционных маркеров при скрещивании и выявлении наследуемых патологий.

	ДНК-чипы для GWAS-генотипирования в формате картриджей для полногеномного поиска генетических маркеров, ассоциированных с наследственными заболеваниями человека (GWAS-генотипирование). В комплект входят наборы реактивов, позволяющие анализировать в одном эксперименте от 10 тыс. (Human Mapping) до 1,8 млн (Genome-Wide) генетических маркеров (распространённые и редкие точечные полиморфизмы, анализ числа копий, CNV).
	Чипы Axiom для GWAS-генотипирования в формате плашек по 800 тыс. маркеров для персональной медицины для анализа наследственных заболеваний, генетической предрасположенности к иммунным, воспалительным, онкологическим и другим заболеваниям, фенотипического исследования крови, фармакогеномики и др. Для биобанков, в т.ч. HLA-типирование для трансплантологии; для анализа полиморфизмов в белок-кодирующих областях человеческого генома; для генотипирования различных человеческих популяций (европейская, африканская, латиноамериканская, восточноазиатская); анализа сайтов связывания микроРНК; для генетического анализа сообществ микроорганизмов; для таргетного генотипирования человеческого генома различных форматов (24, 96, 384 лунки), содержащие пользовательские панели полиморфизмов.
	Чипы для генотипирования других живых организмов: для точечного генотипирования и анализа экспрессии генов Arabidopsis thaliana; для анализа генома собаки, в частности, определения чистопородности; для анализа генома лабораторных мышей различных линий.
	Чипы для анализа сельскохозяйственных животных и растений: видоспецифические панели для генотипирования яблони, кукурузы, пшеницы, клубники, хлопка, крупного и мелкого рогатого скота, домашней птицы, лошадей, свиней и др., а также пользовательские панели; панели для выявления однонуклеотидных полиморфизмов, CNV и хромосомных аберраций в человеческом геноме; наборы для выявления хромосомных аберраций, соматических мутаций и CNV в гистологических препаратах для онкологических исследований; реагенты для секвенирования митохондриальной ДНК; реагентика для фармакогенетического анализа.

Продукция Affymetrix для анализа РНК (экспресии генов): реактивы 3’ IVT Expression Profiling для построения экспрессионного профиля различных живых организмов — человека, мыши, крысы и др.; для анализа экспрессии человеческих генов — более 8500 последовательностей, верифицированных по NCBI RefSeq, 10000 полноразмерных генов и более 47000 транскриптов для анализа экспрессии генов в организме мыши или крысы; реактивы нового поколения для построения экспрессионного профиля транскриптома человека, мыши, крысы, позволяющие также идентифицировать альтернативный сплайсинг или длинные некодирующие РНК.

Оборудование для пробоподготовки и работы с чипами Nimbus — автоматическая станция для пробоподготовки при работе с чипами Axiom – амплификация ДНК, фрагментация, очистка, гибридизация и окрашивание; пробоподготовка после ПЦР. Пробоподготовка может быть осуществлена автоматически с помощью станции Beckman Coulter Biomek FX. GeneTitan – автоматическая платформа для SNP-генотипирования и анализа экспрессии генов на микрочипах Axiom в формате Array Plates. На этой платформе предлагаются два прибора – одноканальный GeneTitan для анализа экспрессии генов и мультиканальный GeneTitan MC для анализа экспрессии генов и генотипирования. GeneAtlas предназначена для анализа экспрессии генов; работает с чипами в формате стрипов. GeneChip – для работы с ДНК-чипами в формате картриджей, включает полный комплект оборудования (сканер, станция пробоподготовки, гибридизационная печь, ПК со специальным ПО). ПО для анализа ДНК-микрочипов: для анализа человеческого генома, анализа сообществ микроорганизмов (микробиома), таргетного SNP-генотипирования, экспорта данных в базу генотипов крупного рогатого скота (Council of Dairy Cattle Breeding database), анализа результатов SNP-генотипирования с помощью графического интерфейса, хромосомных аберраций, экспрессии генов и транскриптомный анализ.

Сервисные услуги для исследователей Дизайн и производство чипов для решения конкретной задачи по генотипированию или экспрессии генов различных живых организмов, выполнение исследовательских работ в лаборатории Affymetrix: генотипирование на базе Axyom, GWAS-исследования на базе SNP Array 6.0, исследования гистологических срезов на базе OncoScan.