Ферменты

Smart транспозаза Tn5 - это универсальный фермент, который случайным образом гидролизует ДНК и одновременно встраивает олигонуклеотидные последовательсти в ДНК-мишень. Smart транспозаза Tn5 выделена из штамма E.coli, несущего модифицированный клонированный ген транспозазы T5.

Применение Smart Транспозазы Tn5: конструирование бибилиотек для NGS.

Комплект поставки: Smart транспозаза Tn5; 5х буфер для проведения реакции, 5х буфер с ДМФА (N,N-Диметилформамид) для проведения реакции.

Условия хранения: -20 °С.

Бензонуклеаза — это нуклеаза, расщепляющая все формы как ДНК, так и РНК (одноцепочечные, двухцепочечные, линейные и кольцевые). Фермент эффективен в широком диапазоне рабочих условий. Оптимальное значение pH для активности фермента составляет от 8,0 до 9,2. Бензонуклеаза гидролизует фосфодиэфирные связи, что приводит к образованию олигодезоксинуклеотидов с концевыми 5’-монофосфатами длиной 3-5 оснований.

Применение:

Бензонуклеаза идеальна для широкого спектра применений, где желательно полное расщепление нуклеиновых кислот:

• для гидролиза природных или денатурированных нагреванием ДНК и РНК;
• для удаления нуклеиновых кислот во время экстракции белка: бензонуклеаза уменьшает вязкость образца и облегчает последующие операции по очистке рекомбинантного белка или экстракции белка из образцов клеток тканей;
• для удаления нуклеиновой кислоты из клеточного или бактериального лизата, снижения вязкости раствора и увеличения выхода белка;
• для удаления примесей нуклеиновых кислот из препаратов рекомбинантного белка для подготовки образцов для двумерного гель-электрофореза белков;
• для предотвращения слипания клеток в клеточной смеси;
• для расщепление нуклеиновых кислот для облегчения получения высококачественных телец включения перед ренатурацией нерастворимых белков;
• для удаления загрязнения ДНК при приготовлении проб вакцины и вируса.

Единица активности.

За единицу активности бензонуклеазы принимают количество фермента, превращающего 50 мкг ДНК спермы лосося в нуклеотиды за 30 минут при 37 °C в реакционном буфере: 50 мМ Трис-HСl, pH 8,0 и 1 мМ MgCl₂.

CAS No	9025-65-4
Чистота	≥ 90% (SDS-PAGE)
Концентрация	250 ед./мкл
Молекулярный вес (кДа)	30 000
Источник	Рекомбинантный белок полученный из E. coli
Оптимальная реакционная температура	20 - 37 °С
Оптимальный реакционный буфер	50 мМ Трис-HСl, 1 мМ MgCl₂, 50 - 150 мМ NaCl, pH 8,0
Токсичность	атоксичный
Условия хранения	50 мМ Трис-HCl, pH 8,0, 50 мМ NaCl, 5 мМ MgCl₂ и 50% глицерин
Температура хранения	-20 °C

Бензаза (бензонуклеаза) — это нуклеаза, расщепляющая все формы как ДНК, так и РНК (одноцепочечные, двухцепочечные, линейные и кольцевые). Фермент эффективен в широком диапазоне рабочих условий. Оптимальное значение pH для активности фермента составляет от 8,0 до 9,2. Бензонуклеаза гидролизует фосфодиэфирные связи, что приводит к образованию олигодезоксинуклеотидов с концевыми 5’-монофосфатами длиной 3-5 оснований.

Применение бензазы (бензонуклеазы)

Бензаза (бензонуклеаза) идеальна для широкого спектра применений, где желательно полное расщепление нуклеиновых кислот:

• для гидролиза природных или денатурированных нагреванием ДНК и РНК;
• для удаления нуклеиновых кислот во время экстракции белка: бензонуклеаза уменьшает вязкость образца и облегчает последующие операции по очистке рекомбинантного белка или экстракции белка из образцов клеток тканей;
• для удаления нуклеиновой кислоты из клеточного или бактериального лизата, снижения вязкости раствора и увеличения выхода белка;
• для удаления примесей нуклеиновых кислот из препаратов рекомбинантного белка для подготовки образцов для двумерного гель-электрофореза белков;
• для предотвращения слипания клеток в клеточной смеси;
• для расщепление нуклеиновых кислот для облегчения получения высококачественных телец включения перед ренатурацией нерастворимых белков;
• для удаления загрязнения ДНК при приготовлении проб вакцины и вируса.

Единица активности бензазы (бензонуклеазы)

За единицу активности бензазы (бензонуклеазы) принимают количество фермента, превращающего 50 мкг ДНК спермы лосося в нуклеотиды за 30 минут при 37 °C в реакционном буфере: 50 мМ Трис-HСl, pH 8,0 и 1 мМ MgCl₂.

CAS No	9025-65-4
Чистота	≥ 99% (SDS-PAGE)
Концентрация	250 ед./мкл
Молекулярный вес (кДа)	30 000
Источник	Рекомбинантный белок полученный из E. coli
Оптимальная реакционная температура	20 - 37 °С
Оптимальный реакционный буфер	50 мМ Трис-HСl, 1 мМ MgCl₂, 50 - 150 мМ NaCl, pH 8,0
Токсичность	атоксичный
Условия хранения	50 мМ Трис-HCl, pH 8,0, 50 мМ NaCl, 5 мМ MgCl₂ и 50% глицерин
Температура хранения	-20 °C

10x буфер B (Blue) обеспечивает оптимальные условия реакции для эндонуклеаз рестрикции; предварительно смешан с BSA для повышения стабильности.

Концентрация	10x
Состав	1x (10 мМ Tris-HCl (рН 7,5 при 37 °С), 10 мМ MgCl₂, 0.1 мг/мл BSA)
Примечание	Буфер содержит BSA, не рекомендуется хранить буфер при 4 °С более одной недели.
Условия хранения	-20 °С

Пятибуферная система Thermo FS обеспечивает оптимальные условия реакции для каждой эндонуклеазы рестрикции. Эта система состоит из буферов: B (blue), G (green), O (orange), R (red), и Tango (yellow). Все эндонуклеазы рестрикции поставляются в цветокодированных пробирках для указания рекомендуемого реакционного буфера. Рекомендуемый буфер и/или универсальный буфер Tango поставляются с каждым ферментом.

Примечание: полный перечень эндонуклеаз рестрикции Thermo FS смотрите в таблице:

Эндонуклеазы рестрикции, Thermo FS, таблица, рус, 5 стр.

Буфер G (Green) обеспечивает оптимальные условия реакции для эндонуклеаз рестрикции; предварительно смешан с BSA для повышения стабильности.

Концентрация	10x
Состав	1x (10 мМ Tris-HCl (рН 7,5 при 37 °С), 10 мМ MgCl₂, 50 мМ NaCl 0.1 мг/мл BSA)
Примечание	Буфер содержит BSA, не рекомендуется хранить буфер при 4 °С более одной недели.
Условия хранения	-20 °С

Пятибуферная система Thermo FS обеспечивает оптимальные условия реакции для каждой эндонуклеазы рестрикции. Эта система состоит из буферов: B (blue), G (green), O (orange), R (red), и Tango (yellow). Все эндонуклеазы рестрикции поставляются в цветокодированных пробирках для указания рекомендуемого реакционного буфера. Рекомендуемый буфер и/или универсальный буфер Tango поставляются с каждым ферментом.

Примечание: полный перечень эндонуклеаз рестрикции Thermo FS смотрите в таблице:

Эндонуклеазы рестрикции, Thermo FS, таблица, рус, 5 стр.

10X буфер GeneAmp PCR Gold оптимизирован для использования с ДНК-полимеразой AmpliTaq Gold и ДНК-полимеразой AmpliTaq Gold LD.

Буфер GeneAmp PCR Gold не содержит в своем составе ионы магния. Буфер поставляется в комплекте с раствором MgCl₂. Совместное использование буфера GeneAmp 10X PCR Gold и раствора MgCl₂ обеспечивает большую универсальность в оптимизации концентрации ионов магния для достижения оптимальных условий для ПЦР с любым специфическим набором праймеров и ДНК-матрицы.

Список компонентов:

• буфер GeneAmp PCR Gold, 10X: 150 мМ Tris-HCl, рН 8.0; 500 мМ KCl;
• раствор 25 мМ MgCl₂;
• все растворы приготовлены на автоклавированной, деионизированной, ультрафильтрованной воде.

Эндонуклеазы рестрикции от New England Biolabs комплектуются буфером, обеспечивающим максимальную активность конкретного фермента. Буфер NEBbuffer 1.1 (жёлтая маркировка) — один из четырёх стандартных рестриктазных буферов.

Состав 1-кратного буфера:

• 10 мМ MgCl₂;
• 10 мМ Бис-Трис-Пропан-HCl;
• 100 мкг/мл БСА;
• pH 7 (+25 °C).

Условия хранения — -20 ^°С.

Эндонуклеазы рестрикции от New England Biolabs комплектуются буфером, обеспечивающим максимальную активность конкретного фермента. Буфер NEBbuffer 2 (синяя маркировка) — один из четырёх стандартных рестриктазных буферов. В отличие от буфера NEBuffer 2.1, этот буфер не содержит БСА, поэтому рекомендуется использовать его с рестриктазами, не требующими БСА для своей работы.

Условия хранения — -20 ^°С.

Эндонуклеазы рестрикции от New England Biolabs комплектуются буфером, обеспечивающим максимальную активность конкретного фермента. Буфер NEBbuffer 2.1 (синяя маркировка) — один из четырёх стандартных рестриктазных буферов.

Состав 1-кратного буфера:

• 50 мМ NaCl;
• 10 мМ MgCl₂;
• 10 мМ Трис-HCl;
• 100 мкг/мл БСА;
• pH 7 (+25 °C).

Условия хранения — -20 ^°С.

Эндонуклеазы рестрикции New England Biolabs комплектуются буфером, обеспечивающим максимальную активность конкретного фермента. Буфер NEBbuffer 3 (красная маркировка) — один из четырёх стандартных рестриктазных буферов. В отличие от буфера NEBuffer 3.1, этот буфер не содержит БСА, поэтому рекомендуется использовать tuj с рестриктазами, не требующими БСА для своей работы.

Состав 1-кратного буфера:

• 10 мМ MgCl₂;
• 50 мМ Трис-HCl;
• 100 мМ NaCl;
• 1 мМ ДТТ;
• pH 7,9 (+25 °C).

Условия хранения — -20 °С.

Эндонуклеазы рестрикции от New England Biolabs комплектуются буфером, обеспечивающим максимальную активность конкретного фермента. Буфер NEBbuffer 3.1 (красная маркировка) — один из четырёх стандартных рестриктазных буферов.

Состав 1-кратного буфера:

• 10 мМ MgCl₂;
• 50 мМ Трис-HCl;
• 100 мМ NaCl;
• 100 мкг/мл БСА;
• pH 7,9 (+25 °C).

Условия хранения — -20 ^°С.

Эндонуклеазы рестрикции New England Biolabs комплектуются буфером, обеспечивающим максимальную активность конкретного фермента. Буфер NEBbuffer 4 (зелёная маркировка) — один из четырёх стандартных рестриктазных буферов. Этот буфер не содержит БСА, поэтому рекомендуется использовать его с рестриктазами, не требующими БСА для своей работы.

Состав 1-кратного буфера:

• 10 мМ MgCl_₂;
• 50 мМ ацетат калия;
• 20 мМ Трис-ацетат;
• 1 мМ ДТТ;
• pH 7,9 (+25 °C).

Условия хранения — -20 ^°С.

Эндонуклеазы рестрикции от New England Biolabs комплектуются буфером, обеспечивающим максимальную активность конкретного фермента. Буфер NEBbuffer 1 (жёлтая маркировка) — один из четырёх стандартных рестриктазных буферов. В отличие от буфера NEBuffer 1.1, этот буфер не содержит БСА, поэтому рекомендуется использовать его с рестриктазами, не требующими БСА для своей работы.

Состав 1-кратного буфера:

• 10 мМ MgCl₂;
• 1 мМ ДТТ;
• 10 мМ Бис-Трис-Пропан-HCl;
• pH 7,9 (+25 °C).

Условия хранения — -20 ^°С.

Буфер O (Orange) обеспечивает оптимальные условия реакции для эндонуклеаз рестрикции; предварительно смешан с BSA для повышения стабильности.

Концентрация	10x
Состав	1x (50 мМ Tris-HCl (рН 7,5 при 37 °С), 10 мМ MgCl₂, 100 мМ NaCl, 0.1 мг/мл BSA)
Примечание	Буфер содержит BSA, не рекомендуется хранить буфер при 4 °С более одной недели.
Условия хранения	-20 °С

Пятибуферная система Thermo FS обеспечивает оптимальные условия реакции для каждой эндонуклеазы рестрикции. Эта система состоит из буферов: B (blue), G (green), O (orange), R (red), и Tango (yellow). Все эндонуклеазы рестрикции поставляются в цветокодированных пробирках для указания рекомендуемого реакционного буфера. Рекомендуемый буфер и/или универсальный буфер Tango поставляются с каждым ферментом.

Примечание: полный перечень эндонуклеаз рестрикции Thermo FS смотрите в таблице:

Эндонуклеазы рестрикции, Thermo FS, таблица, рус, 5 стр.

Буфер R (Red) обеспечивает оптимальные условия реакции для эндонуклеаз рестрикции; предварительно смешан с BSA для повышения стабильности.

Концентрация	10x
Состав	1x (10 mM Tris-HCl (pH 8.5 at 37 °C), 10 мМ MgCl₂ , 100 мМ KCl, 0.1 мг/мл BSA)
Примечание	Буфер содержит BSA, не рекомендуется хранить буфер при 4 °С более одной недели.
Условия хранения	-20 °С

Пятибуферная система Thermo FS обеспечивает оптимальные условия реакции для каждой эндонуклеазы рестрикции. Эта система состоит из буферов: B (blue), G (green), O (orange), R (red), и Tango (yellow). Все эндонуклеазы рестрикции поставляются в цветокодированных пробирках для указания рекомендуемого реакционного буфера. Рекомендуемый буфер и/или универсальный буфер Tango поставляются с каждым ферментом.

Примечание: полный перечень эндонуклеаз рестрикции Thermo FS смотрите в таблице:

Эндонуклеазы рестрикции, Thermo FS, таблица, рус, 5 стр.

Буфер Tango (yellow) обеспечивает оптимальные условия реакции для эндонуклеаз рестрикции; предварительно смешан с BSA для повышения стабильности.

Буфер танго был разработан для проведения реакции двойного гидролиза ДНК эндонуклеазами рестрикции.

Концентрация	10x
Состав	1x (33 мМ трис-ацетат (рН 7,9 при 37 °С), 10 мМ ацетат магния, 66 мМ ацетат калия, 0.1 мг/мл BSA)
Примечание	Буфер содержит BSA, не рекомендуется хранить буфер при 4 °С более одной недели.
Условия хранения	-20 °С

Пятибуферная система Thermo FS обеспечивает оптимальные условия реакции для каждой эндонуклеазы рестрикции. Эта система состоит из буферов: B (blue), G (green), O (orange), R (red), и Tango (yellow). Все эндонуклеазы рестрикции поставляются в цветокодированных пробирках для указания рекомендуемого реакционного буфера. Рекомендуемый буфер и/или универсальный буфер Tango поставляются с каждым ферментом.

Примечание: полный перечень эндонуклеаз рестрикции Thermo FS смотрите в таблице:

Эндонуклеазы рестрикции, Thermo FS, таблица, рус, 5 стр.

Эндонуклеазы рестрикции от New England Biolabs комплектуются буфером, обеспечивающим максимальную активность конкретного фермента. Обычно это один из четырёх стандартных буферов - 1.1, 2.1, 3.1 или CutSmart (для некоторых рестриктаз необходим специальный буфер). Все эти буферы имеют соответствующую цветовую маркировку на этикетке - жёлтую, синюю, красную или зелёную.
Состав буферов приведён на сайте New England Biolabs.

Условия хранения — -20 ^°С.

T4 ДНК лигаза катализирует образование фосфодиэфирной связи между 5`-фосфатной и 3`-гидроксильными концевыми группами ДНК или РНК, выделена из штамма E.coli, несущего клонированный ген ДНК-лигазы из фага T4. Необходим АТФ в качестве кофактора.

Применение T4 ДНК лигазы

• Клонирование ДНК;
• лигирование «тупых» и «липких» концов ДНК;
• присоединение линкеров или адаптеров к двуцепочечной ДНК;
• восстановление одноцепочечных разрывов в двуцепочечной ДНК, РНК или гибридах ДНК/РНК;
• лигазная детекция;
• сайт-направленный мутагенез.

Комплект поставки: T4 лигаза; 10х буфер для проведения реакции.

Условия хранения: -20 °С.

Taq ДНК-лигаза катализирует образование фосфодиэфирной связи между совмещенными 5 ́ фосфатом и 3 ́ гидроксильными концами двух соседних нуклеотидов в контексте двухцепочечной молекулы ДНК. Лигирование будет происходить только в том случае, если смежные нуклеотиды идеально спарены и не имеют зазоров между ними, что позволяет использовать этот фермент в качестве инструмента для обнаружения замещений с одним основанием. Taq ДНК-лигаза использует NAD + в качестве кофактора.

Особенности Taq ДНК-лигазы

• Термостабильность – проявляет максимальную активность при 45-70 °С;
• селективно лигирует ники в 2-цепочечной ДНК;
• не является заменой T4 ДНК лигазе;
• NAD-зависимая ДНК-лигаза;
• высокая точность лигирования.

Применение Taq ДНК лигазы

• Клонирование методом Гибсона;
• высокоточное лигирование;
• лигазная цепная реакция (LCR – ligase chain reaction);
• обнаружение однонуклеотидных замен;
• сборка генов;
• сайт-направленный мутагенез.

Комплект поставки: Taq ДНК лигаза; 10х буфер для проведения реакции; NAD (Никотинамид-ß-аденин динуклеотид).

Условия хранения: -20 °С.

ДНК-лигаза Т4 катализирует образование фосфодиэфирной связи между 5'-фосфатом и 3'-гидроксильной группой в дуплексной ДНК или РНК. Фермент соединяет тупые и липкие концы, а также одноцепочечные разрывы в дуплексной ДНК и некоторых ДНК/РНК гибридах. Т4 ДНК-лигаза применяется для клонирования фрагментов рестрикции и для присоединения линкеров и адаптеров к ДНК имеющей тупые концы.

Особенности T4 ДНК-лигазы

• Катализирует образование фосфодиэфирной связи между совмещенными 5'-фосфатом и 3'-гидроксильными концами в дуплексной ДНК или РНК;
• катализирует репарацию двухцепочечной ДНК, РНК, гибридов ДНК/РНК;
• подходит для различных типов образцов: геномная ДНК, фиксированные в формалине парафинизированные образцы, свободноциркулирующая ДНК.

Комплект поставки: T4 ДНК лигаза (400 е.а./мл), 10х буфер для проведения реакции.

Условия хранения: -20 °С.

ДНК-лигаза Т4 катализирует образование фосфодиэфирной связи между 5'-фосфатом и 3'-гидроксильной группой в дуплексной ДНК или РНК. Фермент соединяет тупые и липкие концы, а также одноцепочечные разрывы в дуплексной ДНК и некоторых ДНК/РНК гибридах. Т4 ДНК-лигаза применяется для клонирования фрагментов рестрикции и для присоединения линкеров и адаптеров к ДНК имеющей тупые концы.

Особенности T4 ДНК-лигазы

• Катализирует образование фосфодиэфирной связи между совмещенными 5'-фосфатом и 3'-гидроксильными концами в дуплексной ДНК или РНК;
• катализирует репарацию двухцепочечной ДНК, РНК, гибридов ДНК/РНК;
• подходит для различных типов образцов: геномная ДНК, фиксированные в формалине парафинизированные образцы, свободноциркулирующая ДНК.

Области применения ДНК-лигаза T4

• Клонирование фрагментов ДНК после рестрикции;
• клонирование ПЦР-фрагментов;
• пришивка олигонуклеотидных линкеров и адаптеров к ДНК;
• репарация 1-цепочечных разрывов в двухцепочечных молекулах нуклеиновых кислот.

Комплект поставки: T4 ДНК лигаза (2000 е.а./мл), 10х буфер для проведения реакции.

Условия хранения: -20 °С.

ДНК-лигаза Т4 катализирует образование фосфодиэфирной связи между 5’-фосфорилированным и 3’-гидроксилированным концами двух фрагментов двойной цепи ДНК или РНК. Фермент восстанавливает однонитевые разрывы в двойных цепях ДНК, РНК или гибридов ДНК/РНК. ДНК-лигаза сшивает как липкие, так и тупые концы, но не однонитевые нуклеиновые кислоты.

В качестве кофермента требуется наличие АТФ.

ДНК-лигаза Т4 от Thermo Scientific активна в рестриктазных буферах, лигазном буфере и буфере для обратной транскрипции.

Реакция лигирования липких концов происходит в течение 10 минут при комнатной температуре.

Для лигирования тупых концов в комплект входит раствор полиэтиленгликоля.

Области применения:

• Клонирование фрагментов ДНК или ПЦР-фрагментов в вектор после рестрикции;
• пришивка олигонуклеотидных линкеров и адапторов к ДНК;
• лигазная детекция РНК ;
• репарация 1-цепочечных разрывов в двухцепочечных молекулах нуклеиновых кислот;
• циркуляризация линейной ДНК.

ДНК-лигаза Т4 Thermo Scientific комплекутется 10-кратным лигазным буфером и 50% растворов ПЭГ.

Активность ДНК-лигазы может измеряться в единицах лигирования липких концов (лигирование 50% HindIII-фрагментов ДНК фага в течение 30 минут) или в единицах Вейсса (каталитическое превращение 1 нмоль дифосфата в течение 20 минут). 1 единица Вейса равна 200 единицам лигирования липких концов.

Важно!

1) Связывание лигазы с ДНК може приводить к смещению полос в агарозном геле. Во избежание подобного смещения рекомендуется добавлять к электрофорезным образцам буфер для нанесения с SDS и инкубировать образцы в течение 10 минут при +65^оС, а затем охладить во льду.

2) При электротрансформации лигазной смеси необходимо произвести очистку ДНК от фермента (на спин-колонках или фенол-хлороформной экстракцией)

Условия хранения: -20^оС

ДНК-лигаза Т4 катализирует образование фосфодиэфирной связи между 5’-фосфорилированным и 3’-гидроксилированным концами двух фрагментов двойной цепи ДНК или РНК. Фермент восстанавливает однонитевые разрывы в двойных цепях ДНК, РНК или гибридов ДНК/РНК. ДНК-лигаза сшивает как липкие, так и тупые концы, но не однонитевые нуклеиновые кислоты.

В качестве кофермента требуется наличие АТФ.

ДНК-лигаза Т4 от Thermo Scientific активна в рестриктазных буферах, лигазном буфере и буфере для обратной транскрипции.

Реакция лигирования липких концов происходит в течение 10 минут при комнатной температуре.

Для лигирования тупых концов в комплект входит раствор полиэтиленгликоля.

Области применения:

• Клонирование фрагментов ДНК или ПЦР-фрагментов в вектор после рестрикции;
• пришивка олигонуклеотидных линкеров и адапторов к ДНК;
• лигазная детекция РНК ;
• репарация 1-цепочечных разрывов в двухцепочечных молекулах нуклеиновых кислот;
• циркуляризация линейной ДНК.

ДНК-лигаза Т4 Thermo Scientific комплекутется 10-кратным лигазным буфером и 50% растворов ПЭГ.

Активность ДНК-лигазы может измеряться в единицах лигирования липких концов (лигирование 50% HindIII-фрагментов ДНК фага в течение 30 минут) или в единицах Вейсса (каталитическое превращение 1 нмоль дифосфата в течение 20 минут). 1 единица Вейса равна 200 единицам лигирования липких концов.

Важно!

1) Связывание лигазы с ДНК може приводить к смещению полос в агарозном геле. Во избежание подобного смещения рекомендуется добавлять к электрофорезным образцам буфер для нанесения с SDS и инкубировать образцы в течение 10 минут при +65^оС, а затем охладить во льду.

2) При электротрансформации лигазной смеси необходимо произвести очистку ДНК от фермента (на спин-колонках или фенол-хлороформной экстракцией)

Условия хранения: -20^оС