Реагенты и наборы для выделения и очистки нуклеиновых кислот российского и зарубежного производства: что всегда есть на нашем складе

Содержание статьи:

• Поставщики продукции: привычные и новые
• Выделение и очистка НК на спин-колонках
• Наборы для выделения НК на магнитных частицах
• Выделение НК методом органической экстракции
• Реагенты для работы с РНК
• Прочие реактивы для работы с НК
• Сайт: наличие на складе
• Реактивы для количественного анализа ДНК

Эта публикация отражает содержание первой части вебинара «Получение высококачественных ДНК и РНК: реагенты, наборы и оборудование – и новое, и старое», состоявшегося 29 сентября 2022 г. в рамках проекта «Онлайн-лекторий Диаэм».

Специалист «Диаэм» Светлана Олейникова рассказала о реагентах и наборах для выделения и очистки нуклеиновых кислот российского и зарубежного производства, доступных к поставке от «Диаэм» в новых условиях рынка – о том, что из привычной продукции по-прежнему доступно, а также о новинках ассортимента.

Поставщики продукции: привычные и новые

В настоящее время «Диаэм» по-прежнему продолжает поставлять продукцию знакомых пользователям западных производителей: на слайде приведены логотипы лишь некоторых из них, например, New England Biolabs, ThermoFisher Scientific, Abcam, Binder, Vilber, PHCbi, Bio-Rad, MP Biomedicals, Sigma-Aldrich. Все они продолжают работать на территории России.

Кроме того, за последние месяцы в «Диаэм» нашли новых производителей и поставщиков различной реагентики для молекулярной биологии.

В их числе neoFroxx (Германия) – производитель обширного списка химических реактивов, применяемых в каждой молекулярно-биологической лаборатории. Среди новых поставщиков также китайские производители: Vazyme, Servicebio, ABclonal, предлагающие широкий перечень продукции – реагентов, в том числе мастермиксов для ПЦР, реагентов для выделения, а ABclonal к тому же предлагает множество различных антител и ИФА наборов.

В числе других компаний, производящих реактивы и оборудование для молекулярной биологии – Nest, Allsheng, SCI-STORE, Biobase, BioSino, Techstar, RWD Life Science, Drawell, Arigo Biolaboratories (Arigobio).

Выделение и очистка НК на спин-колонках

Итак, для выделения и очистки ДНК и РНК «Диаэм» предлагает прежде всего наборы, основанные на спин-колонках. Для выделения ДНК мы можем предложить наборы для выделения из множества различных биологических образцов:

• бактериальных клеток,
• гистологических препаратов, фиксированных в формалине,
• культур клеток,
• животных тканей,
• дрожжей,
• пищевых продуктов и сырья,
• плазмы крови,
• растительной ткани,
• соскобов буккального эпителия,
• слюны,
• сухих пятен крови,
• сперматозоидов,
• цельной крови,
• широкого спектра биологических образцов,
• реакционных смесей,
• агарозного геля.
РНК можно выделить из:
• плазмы крови,
• культур клеток,
• растений,
• животных тканей.

Представлен широкий ассортимент наборов DiaGene и Vazyme, доступных в комплектации «мини», «миди» и «макси». Наборы для выделения НК на магнитных частицах

Для выделения на магнитных частицах «Диаэм» предлагает

• наборы для выделения ДНК из крови и буккального эпителия LumiMAG от российской компании Lumiprobe, а также
• наборы для выделения ДНК из растительной ткани «Диаэм»,
• магнитный силикагель, который производится под маркой diaGene («Диаэм») для выделения на магнитных штативах,
• для автоматического выделения ДНК и РНК из широкого спектра образцов есть в наличии наборы китайских компаний Nest и Vazyme, которая предоставляет ряд наборов для:
• выделения ДНК и РНК из разных типов образцов – жидких образцов (кровь, сыворотка, плазма),
• выделения вирусной ДНК,
• выделения вирусной ДНК/РНК,
• свободно циркулирующей ДНК (VAHTS Maxi Kit),
• выделения патогенной микробной ДНК.

Все эти наборы Vazyme подходят и для ручного, и для автоматического выделения, и все они были протестированы на совместимость с прибором KingFisher от Thermo FS.

Для выделения НК методом органической экстракции у «Диаэм» появились наборы российского производства, которые являются аналогами реагентов западных производителей:

• реагент DiZol для выделения ДНК (артикулы 3790.100, 3790.250) – российского производства, аналог реагента DNAzol от Thermo FS
• реагент RiZol (артикулы 3789.100, 3789.250) – аналог всем известных TRIzol (Тризола) от Thermo FS, реагентов QIAzol Lysis (Qiagen) и Purezol для выделения суммарной РНК (Bio-Rad).

Мы получили положительный отзывы о «РиЗоле», свидетельствующие о том, что он нормально выделяет РНК.

На сайте «Диаэм» мы стараемся дополнить информацию о реактивах инструкциями от производителей: какие существуют протоколы использования и так далее. Эти инструкции можно найти в карточке реагента во вкладке «Техническая информация»: на примере видно, что здесь представлена инструкция по использованию реагента (набора).

Реагенты для работы с РНК

Для работы с РНК «Диаэм» может предложить реагенты – аналоги привычных пользователям реагентов от Thermo FS, которыми все давно привыкли пользоваться.

Это:

• Riti (diaGene, Россия, 250 мл, артикулы 3787.100, 3787.250) – реагент для стабилизации РНК в разнообразных образцах тканей, аналог RNAlater от Thermo FS;
• RiTube (diaGene, Россия, артикулы 3786) – шприц-пробирки для стабилизации и хранения внутриклеточной мРНК в образцах крови и костного мозга – аналог пробирок Tempus для стабилизации РНК в образцах крови для последующего анализа от Thermo FS;
• Для ингибитора РНКаз Ribolock (40 ед/мкл) от Thermo FS представлено сразу несколько аналогов:
• ингибитор РНКаз RiBond (diaGene, Россия, артикулы 3784.2000, 3784.10000),
• немецкий ингибитор РНКаз от neoFroxx,
• китайский ингибитор РНКаз RK21401 ABClonal;
• От российского производителя diaGene представлен набор RiSave (артикулы 3788.250, 3788.100) для стабилизации и хранения РНК в образцах крови или костного мозга для последующего анализа.

Прочие реактивы для работы с НК

Среди других реактивов, используемых в работе с нуклеиновыми кислотами, следует отметить:

• Стерильную воду для работы с НК, обработанную ДЭПК, свободную от ДНКаз и РНКаз – российского производства (dieGene, артикулы 3783.0005, 3783.0050). Теперь нет необходимости покупать воду от Thermo FS или Sigma-Aldrich или New England Biolabs – вода российского производства всегда есть на складе в Москве;
• ДНКазу I без РНКаз, 2 ед/мкл, 2000 е.а. (diaGene, арт. 3911.2000) – новинку, появившуюся в ассортименте в сентябре 2022 г.: этот фермент сразу стал популярным и получил хорошие отзывы;
• Протеиназу К рекомбинантную от «Диаэм» - давно поставляемую складскую позицию, ставшую заменой Протеиназе К от Sigma-Aldrich: она рекомбинантная, высокоактивная, ничем не уступает по качеству.
• Уникальный фермент бензазу от diaGene – аналог бензонуклеазы Sigma-Aldrich. Она представлена с конца 2020 г и также получила положительные отзывы, ее предлагают всем клиентам.
• Рекомбинантную РНКазу А от китайского производителя Servicebio (артикул G3405-1ML);
• Лизоцим от китайской компании Vazyme, который может кому-то пригодиться в работе.

Сайт: наличие на складе

На сайте «Диаэм» есть удобная опция: зайдя в нужный раздел (например, «Выделение и очистка нуклеиновых кислот»), пользователь может посмотреть наличие на складе, воспользовавшись выпадающим меню «доступность» справа.

В нем есть опции «На складе» и «Все товары». После выбора «На складе» программа отсортирует все товары, которые есть в наличии, они обычно помечены зелеными галочками.

Реактивы для количественного анализа ДНК

После выделения НК нужно провести ее количественный анализ.

Многие для этого используют флуориметр. От российского производителя на складе «Диаэм» есть наборы QuDye для количественного определения двухцепочечной и одноцепочечной ДНК – в двух вариантах, просто набор и набор с пробирками, совместимый со всеми флуориметрами, которые представлены в России:

• QuDye BR – для количественного определения двухцепочечной ДНК (2-1000 нг) на 100 реакций;
• QuDye BR – для количественного определения двухцепочечной ДНК (2-1000 нг) на 100 реакций, с пробирками;
• QuDye HS – для количественного определения двухцепочечной ДНК (2-1000 нг) на 100 реакций;
• QuDye HS – для количественного определения двухцепочечной ДНК (2-1000 нг) на 100 реакций, с пробирками;
• QuDye – для количественного определения одноцепочечной ДНК (2-1000 нг) на 100 реакций.

В заключение нужно отметить: если что-то не нашли на сайте «Диаэм», обязательно задайте вопрос: ежедневно у компании появляется много продукции, а менеджеры расскажут о новинках и о том, какие реагенты можно предложить пользователю на замену привычным при необходимости.