Набор для экстракции бактериального белка B-PER обеспечивает мягкую экстракцию белков из бактерий (E. coli) без необходимости механического повреждения клеток. Набор может быть использован для выделения растворенных белков и телец включения из бактериальных клеточных лизатов. В состав набора входит реагент для экстракции бактериального белка
B-PER, лизоцим и ДНКаза I, что позволяет выделять белки большого молекулярного веса (более 70 кДа) и белки экспрессирующиеся в тельцах включения. В зависимости от применения, добавочные компоненты: ингибиторы протеаз, соли, восстанавливающие агенты могут быть добавлены к реагенту.
Важная информация о продукте:
- B-PER экстрагирует белки из свежих и замороженных клеток. Обычно экстракция более эффективна из замороженных клеток. Количество реагента зависит от количества клеточной пасты. Если необходимо, добавьте ингибиторы протеаз не содержащие ЭДТА, соли, и восстанавливающие агенты прямо в реагент.
- добавьте лизоцим и ДНКазу I к B-PER реагенту для более эффективной экстракции белка. Экстракция некоторых сверхэкспрессированных белков не требует добавления лизоцима;
- если добавление лизоцима и ДНКазы I может помешать последующему применению, использование этих ферментов следует исключить;
- реагент B-PER эффективно экстрагирует растворимые белки из распространенных бактериальных штаммов и особенно подходит для штаммов BL21 с дефектной протеазной экспрессией. Если лизис клеток проходит неэффективно для определенного бактериального штамма, заморозьте клетки перед экстракцией;
- лизаты цельных клеток, приготовленные с помощью реагента B-PER, совместимы с последующими приложениями, такими как количественное определение белка методом BCA или методом Брэдфорда.
Протокол экстракции белка из бактериальных клеток:
- осадите бактериальные клетки центрифугированием при 5000 g в течении 10 минут;
-
если необходимо, добавьте 2 мкл лизоцима и 2 мкл ДНКазы I на 1 мл реагента B-PER. Добавьте ингибитор протеаз не содержащий ЭДТА;
-
добавьте 4 мл реагента B-PER на каждый грамм осадка клеток. Суспендируйте пипетированием;
-
инкубируйте 10-15 минут при комнатной температуре;
-
центрифугируйте лизат при 15000 g в течении 5 минут для отделения растворимых и нерастворимых белков.
Примечание: Если огромное количество сверхэкспрессированного белка остается в осадке, выделяемый белок может экспрессироваться в тельцах включения. В этом случае, либо используйте реагент для очистки телец включений (арт. 78115), либо измените условия экспрессии белка для минимизации образования телец включения.
Проблемы при выделении, причины и решения:
Проблема
|
Возможная причина
|
Решение
|
Выделяемый белок не растворяется
|
Выделяемый белок экспрессируется в тельцах включения
|
Измените условия экспрессии белка или используйте реагент для солюбилизации телец включения.
|
Добавьте лизоцим и ДНКазу I к реагенту B-PER
|
Бактериальные клетки не лизируются при добавлении фермента
|
Температура слишком низкая
|
Подогрейте клеточную культуру и остальные реагенты до комнатной температуры
|
Лизоцим имеет низкую активность или неактивен
|
Добавьте больше лизоцима к B-PER
реагенту или купите новый фермент.
|
Высокая вязкость клеточного экстракта
|
ДНКаза I имеет низкую активность или неактивна
|
Добавьте больше ДНКазы I к B-PER
реагенту или купите новый фермент.
|
Добавьте Mg2+ до конечной концентрации 2 mM
|
Сверхэкспрессированный белок остается в осадке
|
Только реагент B-PER не может перевести белок в растворенное состояние
|
Добавьте лизоцим и ДНКазу I к B-PER
|
Реагент B-PER
мутный после доставки
|
Реагент холодный
|
Нагрейте реагент до комнатной температуры
|
Состав набора B-PER:
- B-PER реагент для экстракции бактериального белка, 250 мл;
- лизоцим, 0.5 мл 50мг/мл;
- ДНКаза I, 0.5 мл, 2500 ед/мл.
Сопутствующие товары Thermo Scientific:
- 78990 Реагент для экстракции белка из дрожжей Y-PER, Thermo FS;
-
89802 Реагент для экстракции белка из клеток насекомых I-PER, Thermo FS;
-
78505 Реагент для экстракции белка из культивируемых клеток млекопитающих M-PER, Thermo FS;
-
78510 Реагент для экстракции белка из тканей T-PER, Thermo FS;
-
A44056 Реагент для экстракции суммарного белка из растений Pierce Plant, Thermo FS;
-
89802 Реагент для экстракции белка из насекомых I-PER, Thermo FS;
-
78115 Реагент для очистки телец включений, Thermo FS.
Информацию о данной продукции можно получить по запросу.