Кариотипирование и FISH-анализ

Фильтр

Сортировать:

АргусСофт

ПО для автоматического FISH-анализа, Аргус-FISH

FISH 2.1

Программное обеспечение ArgusSoft для FISH анализа позволяет производить автоматические исследования по методу флуоресцентной гибридизации in situ для определения точного положения генов на хромосомах, визуализации нераспознаваемых микроскопических нарушений, определения хромосомных аберраций, оперативного установления анеуплоидности клеток, визуализации отдельных сегментов хромосом в интерфазных ядрах, установления генетического родства между отдаленными видами и т.д.

Основные возможности программы для FISH анализа:

получение серии изображений с гибридизированными ДНК (для различных наборов фильтров;
цветокодирование полученных черно-белых изображений серии с возможностью выбора цветов из палитры;
автоматическое результирующее цветное изображение, являющееся суммой псевдоокрашенных изображений серии;
автоматическое выделение хромосом (при работе с хромосомными препаратами);
автоматическое построение кариограммы хромосом человека и выведение в ней стандартных идиограмм хромосом.

Дополнительные возможности:

улучшение качества исходного изображения;
корректирование оптического сдвига суммируемых изображений друг относительно друга;
редактирование изображения;
проведение ручных измерений;
печать результатов анализа в виде отчета, вид которого формируется пользователем;
сохранение исходных изображений и результатов анализа во встроенной базе данных.

АргусСофт

ПО для автоматического анализа хромосом, кариотипирования, Аргус-Karyo

ARGUS - KARYO

РУ

Программное обеспечение Аргус-Karyo позволяет проводить автоматическое кариотипирование и FISH-анализ хромосом человека по положению бендов, а также кариотипирование хромосом животных и растений в интерактивном режиме. Есть возможность обучения программы распознаванию хромосом, используя собственную базу хромосом.

Кариотипирование:

автоматическое распознавание хромосом человека по морфологии и бендам;
автоматический поиск метафазных пластин (при комплектации микроскопа моторизованным столом);
автоматическое разделение наложенных и контактирующих хромосом;
редактирование кариограммы: перенос, поворот, выпрямление хромосом;
предустановленные стандартные идиограммы человека (разрешение 400, 550 и 850 бендов), коровы, курицы, мыши, крысы, овцы, свиньи;
создание собственных баз идиограмм;
сравнение хромосом и/или идиограмм;
сравнение гомологов с разных метафазных пластинок;
интерактивное распознавание и кариотипирование хромосом животных и растений;
возможность создания и обучения пользовательского классификатора;
объединение нескольких полей зрения в одно изображение;
автоматическая настройка камеры в зависимости от качества препарата;
программное улучшение качества изображений: повышение резкости и контраста бендов, заливка фона;
нанесение графики и комментариев, с возможностью выбора из пользовательского списка.

FISH анализ:

автоматическое получение суммарного цветокодированного изображения из монохромных изображений, полученных с различных светофильтров;
возможность работать с различными наборами флуоресцентных красителей;
получение суммарного изображения из нескольких изображений с разной фокусировкой (на живом видео);
сохранение настроек камеры для каждого зонда (флуоресцентного красителя);
проведение измерений;
коррекция оптического сдвига изображений, возникающего при смене светофильтров на микроскопе;
улучшение визуализации маркеров, коррекция или удаление фона.

Документирование:

автоматическое формирование отчетов для печати результатов анализа;
визуальный конструктор отчетов;
сохранение отчетов в стандартных форматах, совместимых с информационной базой (ЛИС) организации;
автоматическое сохранение исходных данных и результатов анализа в одном документе.

Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ №2018611612 от 02 февраля 2018 года.

Регистрационное удостоверение Росздравнадзора № РЗН 2020/9770 от 16.03. 2020 г.

Кариотипирование — цитогенетический метод определения кариотипа (совокупность признаков полного набора хромосом биологического вида, организма, клеточной линии).

Для определения кариотипа используются клетки в метафазе митоза (у человека используют, как правило, лимфоциты периферической крови, также могут быть использованы клетки костного мозга или первичная культура фибробластов кожи). Для увеличения числа клеток на стадии метафазы к культуре клеток в специальной среде незадолго перед фиксацией добавляют колхицин, который блокирует образование микротрубочек, тем самым препятствуя расхождению хроматид к полюсам деления клетки и завершению митоза.

После фиксации препараты метафазных хромосом окрашивают и фотографируют, используя исследовательские микроскопы с цифровыми камерами. Из микрофотографий формируют кариотип — нумерованный набор пар гомологичных хромосом. Далее производится анализ полученных изображений при помощи специализированных программных инструментов.

Для получения классического кариотипа используется окраска хромосом различными красителями или их смесями — в силу различий в связывании красителя с различными участками хромосом окрашивание происходит неравномерно и образуется характерная полосчатая структура (комплекс поперечных меток-banding), отражающая линейную неоднородность хромосомы и специфичная для гомологичных пар хромосом и их участков (за исключением полиморфных районов, локализуются различные аллельные варианты генов).

Достоинства метода: анализ структуры и количества непосредственно хромосом, выявление сбалансированных транслокаций, маркерных хромосом, мозаицизма.

Недостатки метода: невысокая разрешающая способность (10 Мб), невозможность определения микрохромосомных перестроек (делеций, дупликаций, инверсий, инсерций); качество анализа зависит от опыта исследователя и качества препаратов (морфологии хромосом, окрашивания); невозможность анализа при отсутствии делящихся клеток.

Области применения кариотипирования

Выявление различных хромосомных аномалий (числовых и структурных);
цитогенетический анализ животных и растений для выявления селекционной ценности, чистопородности, генетической паспортизации.

FISH-анализ (Fluorescence In Situ Hybridization) — цитогенетический метод, применяющийся для детекции и определения положения специфической последовательности ДНК на метафазных хромосомах или в интерфазных ядрах in situ, а также для выявления специфических мРНК в образце ткани (установление пространственно-временных особенностей экспрессии генов в клетках и тканях).

Метод FISH-анализа использует короткие флуоресцентно-меченые последовательности ДНК (зонды), комплементарные по отношению к исследуемым последовательностям. Зонды гибридизуются (связываются) с комплементарными участками ДНК и позволяют видеть локализацию интересующих генов в составе ДНК или хромосом. Гибридизация проводится в препарате на предметном стекле с использованием специальных термостатов-гибридайзеров. Дальнейшая обработка производится путем флуоресцентной микроскопии и специального программного обеспечения.

Достоинства метода FISH-анализа: разрешающая способность — 100-300 Kб, возможность определения микрохромосомных перестроек (делеций, дупликаций, инверсий, инсерций); более объективный, относительно легкий, быстрый и хорошо воспроизводимый метод анализа; возможность проведения анализа на культурах клеток с низкой митотической активностью, фиксированных клетках и тканях (interphase FISH).

Гибридизация проводится в препарате на предметном стекле с использованием специальных термостатов-гибридайзеров. Дальнейшая обработка производится путем флуоресцентной микроскопии и специального программного обеспечения.

Недостаток метода: таргетный анализ (зависит от специфичности используемого ДНК-зонда).

Области применения FISH-анализа

Преимплантационная генетическая диагностика (ПГД);
пренатальная диагностика;
постнатальная диагностика (уточнение/верификация результатов стандартного цитогенетического исследования; исследование сложных перестроек — тройных и более сложных транслокаций, инсерций; определение степени мозаицизма; исследование природы маркерных хромосом; исследование хромосомных перестроек в онкогематологии; диагностика солидных опухолей; скрининг анеуплоидий сперматозоидов).

Области применения кариотипирования

Области применения FISH-анализа

Оставьте заявку и мы подберем необходимую продукцию для вас