Пульс-электрофорез — метод фракционирования высокомолекулярных фрагментов ДНК от 10 000 п.н. до 10 млн п.н. с помощью электрофореза в агарозном геле в условиях периодически меняющегося по направлению (пульсирующего) электрического поля. Пульсирующее электрическое поле вынуждает молекулы менять свое направление движения в агарозном геле. При этом крупные молекулы дольше переориентируются и, соответственно, медленнее движутся. На гелях хромосомы бактерий или дрожжей выявляются в виде отдельных полос, что позволяет определять хромосомные перестройки. В отличие от пульс-электрофореза, методом обычного горизонтального электрофореза можно разделять только низкомолекулярные ДНК ввиду однонаправленного электрического поля.
Модель подходит как для новичков, так и для опытных пользователей, так как предлагает два пути оптимизации разделения ДНК: 1) полностью автоматический алгоритм, подбирающий подходящие условия для разделения молекул белков и ДНК по их размеру; 2) второй - интерактивный, который позволяет добавлять данные и оптимальные условия.
Возможность программирования до 99 программ;
оптимальный размер фрагмента, пар оснований - 100 - 10 млн;
угол пульса от 0 до 360 позволяет оптимально разделить как хромосомальную, так и плазмидную ДНК;
использование ассиметричных углов, позволяют работать как с фрагментами в тысячи н.п. (нуклеатидных пар), так и с фрагментами в миллионы н.п.;
разделение очень больших молекул ДНК с помощью вторичного пульса, который позволяет поймать молекулу матрицей геля.
Комплект поставки:
главный автоматический модуль;
электрофоретическая камера;
охлаждающий модуль;
насос с регулируемой скоростью;
заливочный столик;
гребенка с 15 зубцами по 1,5 мм;
шланг из материала Tygon (12’’);
стандарт ДНК (S. Cerevisiae);
5 г агарозы для пульс-электрофореза;
5 г агарозы для крупных молекул ДНК;
диск с ПО.
Аксессуары и опции: агароза для крупных молекул, стандарты молекулярного веса, маркеры молекулярного веса, буферы (цены по запросу), гребенки, охлаждающий модуль.
Пульс-электрофорез — метод фракционирования высокомолекулярных фрагментов ДНК от 10 000 п.н. до 10 млн п.н. с помощью электрофореза в агарозном геле в условиях периодически меняющегося по направлению (пульсирующего) электрического поля. Пульсирующее электрическое поле вынуждает молекулы менять свое направление движения в агарозном геле. При этом крупные молекулы дольше переориентируются и, соответственно, медленнее движутся. На гелях хромосомы бактерий или дрожжей выявляются в виде отдельных полос, что позволяет определять хромосомные перестройки. В отличие от пульс-электрофореза, методом обычного горизонтального электрофореза можно разделять только низкомолекулярные ДНК ввиду однонаправленного электрического поля.
Пульс-электрофорез применяется для кариотипирования низших эукариот, геномного картирования бактерий, грибов, хромосом высших эукариот, анализа геномных библиотек и в таксономических исследованиях. Используется в молекулярной биологии для типирования возбудителей инфекционных заболеваний. На основании исследований с помощью пульс-электрофореза осуществляется установление степени родства, определение эпидемиологических взаимосвязей и изучение эволюционной истории патогенов.
Подвижность молекул и эффективность их разделения в пульсирующем поле зависят от целого ряда взаимосвязанных параметров, наиболее важными из которых являются время пульса и режим его возрастания. Система пульс-электрофореза с настраиваемым углом пульса от 0 до 360° обладает всем диапазоном возможностей. Система с фиксированным углом пульса 120° разработана для выполнения рутинных задач.
