Top.Mail.Ru
info@dia-m.ru 8 (800) 23-40-508
+7 (495) 745-05-08
Ваш регион Москва?

Применение проточной цитометрии в океанографии

05.05.2023

Океанография – это наука, которая изучает физические, химические, геологические и биологические аспекты океанов, морей и других водных систем нашей планеты. Одним из аспектов изучения океана является его биологическая характеристика, а именно изучение разнообразия живых организмов в океане, их экологических взаимодействий и роли в пищевой цепочке. Это позволяет понять роль океана в глобальной экосистеме, его влияние на изменение климата, биологическое разнообразие, а также экономическую и социальную значимость для человечества. Одним из важных методов исследований, который помогает ответить на эти вопросы является проточная цитометрия.

Проточная цитометрия используется для изучения популяций морских микроорганизмов, таких как фитопланктон, вирусы и гетеротрофные бактерии; морские водоросли и т. д. Помимо изучения морских микроорганизмов, этот метод применяют для изучения клеток крупных морских организмов, например ламинарий (род морских водорослей), губок, устриц, перистых моллюсков, морских рыб и даже морских млекопитающих.

Проточный цитометр является мощным инструментом для понимания внутренней динамики пищевой цепи морских популяций. С помощью проточной цитометрии можно различить популяции по размеру, флуоресценции и, таким образом, определить, экологическую нишу микроорганизмов, фито- и зоопланктона.

Применение проточного цитометра в полевых условиях является неотъемлемой частью океанографических исследований. Проточный цитометр для полевых измерений должен отвечать определенным требованиям, чтобы обеспечить надежную работу в условиях исследовательского судна. Он должен быть надежным, легким, компактным, точным и простым в использовании, при этом иметь возможность работать от автономного источника питания и быстро обрабатывать данные при различной температуре.

В портфолио у компании Диаэм имеются проточные цитометры, удовлетворяющие вышеобозначенным требованиям, которые могут использоваться на исследовательском судне для быстрого получения результатов.

Простой, удобный в работе проточный цитофлуориметр 7S, от китайской компании BioSino, способен обеспечить до 95% потребностей клеточной лаборатории в области клеточного анализа. Проточный цитометр SinoCyte от BioSino представляет собой высокопроизводительную, компактную и удобную в использовании систему с поддержкой до трех каналов и 18 параметров флуоресценции.
Проточный цитофлуориметр, 1 лазер, до 5 флуоресцентных каналов, 7S, BioSino, Китай Проточный цитофлуориметр, до 3 лазеров, до 18 флуоресцентных параметров, SinoCyt, BioSino, Китай

Примеры использования проточных цитометров в океанографии

Ниже приведены примеры использования проточного цитометра для анализа биологического разнообразия морских биосистем.

Анализ морского фитопланктона с помощи проточной цитометрии

В работе был использован трех лазерный проточный цитометр (405, 488 и 640 нм лазер), который позволил различить популяции фототрофных (Synechococcus spp., Prochlorococcus spp.) и гетеротрофных эукариот.

Анализ планктона с помощью проточного цитометра (анализ проводился Scripps Institute of Oceanography).

Рисунок. 1. Анализ планктона с помощью проточного цитометра (анализ проводился Scripps Institute of Oceanography).

A-G) Графики плотности со стратегией гейтирования. Идентифицировано шесть фотосинтетических групп, три эукариотических (C) и 3 вида цианобактерий (Е, F, G). Synechococcus PE+ доминируют в группе (B, G). D) Бактерии отличали от вирусных популяций с помощью SYBER green. Х) График прямого и бокового рассеяния, определяющий группы фитопланктона по цвету.


Цитометрический анализ распределения фитопланктона западной и центральной части пролива Ла-Манш в летне-осенний период

Цитометрический анализ распределения фитопланктона западной и центральной части пролива Ла-Манш в летне-осенний период

Рисунок. 2. Графики плотоности (dual-density-plots), позволяющие охарактеризовать различные группы фитопланктона.

А) Общая флуоресценция в красном диапазоне (TFLO – Total Red Fluorescence) по сравнению с общим боковым рассеянием (SWS – sideward scater). (Б) Общая флуоресценция в красном диапазоне (TFLR) в сравнении с полным прямым рассеянием (FWS- Total Forward Scatter). (Ц) Отношение общей флуоресценции в желтом диапазоне к общей флуоресценции в красном и оранжевом диапазоне (TFLY/TFLR)/(TFLO/TFLR). (Д) Общая оранжевая флуоресценция (TFLO- Total Orange Fluorescence) по сравнению с общей желтой флуоресценцией (TFLY- Total Yellow Fluorescence).

Заключение

Изучение популяций микроорганизмов является важным аспектом океанографических исследований, а проточная цитометрия является мощным инструментом для их анализа. Использование недорогих и надежных цитометров для изучения динамики популяций микроорганизмов в полевых условиях может помочь в изучении широкого спектра микроорганизмов и понять их роль в морских экосистемах.

Список использованной литературы:

1. Franzè, G. (2021, May 26). Flow cytometry gets a read on ocean health, A conversation with Gayantonia Franzè, postdoctoral research associate in the lab of Susanne Menden-Deuer, University of Rhode Island, Graduate School of Research Oceanography. [Interview]. Phys.org. https://phys.org/news/2021-05-cytometry-ocean-health.html

2. Dave, R. (2018). Applications of Flow Cytometry in Oceanography. Reviewed by Emily Henderson. News Medical Life Sciences. https://www.news-medical.net/life-sciences/Applications-of-Flow-Cytometry-in-Oceanography.aspx

3. Haynes, M., Seegers, B., & Saluk, A. (2018). Advanced analysis of marine plankton using flow cytometry. BioTechniques, 64(4), 149-157. https://doi.org/10.2144/000114418

4. Ferrari, G. M. C., Gianelli, P., Tornambé, A., & Conversano, F. (2020). Phytoplankton distribution from Western to Central English Channel, revealed by automated flow cytometry during the summer-fall transition. Continental Shelf Research, 207, 104056. https://doi.org/10.1016/j.csr.2020.104056



Информация для заказа:

Пока нет данных. Перейти в каталог
ZS-AE7S
5 484 770, руб.
426 930 CNY

Простой, удобный в работе проточный цитофлуориметр 7S, от китайской компании BioSino, способен обеспечить до 95% потребностей клеточной лаборатории в области клеточного анализа. Прибор имеет один синий лазер (488 нм), но, несмотря на это, обеспечивает до 7 каналов флуоресцентной детекции и обладает высокой чувствительностью детекции и простым ПО, что делает получение результатов быстрым и максимально комфортным.

7S позволяет реализовать все базовые методы цитометрии в лаборатории: анализ клеточного апоптоза и аутофагии, оценка эффективности трансфекции и уровня экспрессии, изучить фенотипы и субпопуляции лимфоцитов, провести HLA-типирование или анализ индекса фрагментации ДНК спермы человека, а также изучить плоидность растений.

Цитофлуориметр 7S оснащен синим аргоновым лазером 488 нм (50 мВт) и системой детекции из 7 сверхчувствительных светодиодных детекторов, которые регистрируют 5 флуоресцентных сигналов, а также прямое (FSC*) и боковое светорассеяния (SSC**).

Система детекции позволяет работать как с самыми популярными красителями (FITC, Alexa 488, PE, PI), так и тандемными красителями (PE-Texas Red, PE-Cy5, PE-Cy5.5, PE-Cy7), что позволяет реализовать простые мультиплексные эксперименты.

Демонстрация прибора

Прибор имеется на складе, есть возможность запросить демонстрацию на рабочем месте заказчика. Форма заказа доступна по кнопке «Заказать демо».


Технические характеристики цитофлуориметра 7S

  • Автоматический забор проб с функцией автоматического промешивания;
  • ПО на английском языке;
  • сбор данных / компенсация флуоресценции в 1 клик;
  • метод определения концентрации клеток – прямой подсчет;
  • источник возбуждения – синий лазер 488 нм;
  • каналы детекции:
    • FL1 – 525/50 нм (FITC/Alexa 488);
    • FL2 – 585/40 нм (PE);
    • FL3 – 630/30 нм (PE-Texas Red/ECD/PI);
    • FL4 – 697/60 нм (PerCP /PE-Cy5 / PE-Cy5.5);
    • FL5 – 780/60 нм (PE-Cy7);
  • FSC* чувствительность, мкм – менее 1;
  • минимальный объем образца, мкл – 90;
  • чувствительность, MESF*** – не более 150 (по FITC) и не более 50 (по PE);
  • коэффициенты вариации (CV) для всех каналов, % – менее 2;
  • размер клеток/частиц, мкм – от 0,5 до 50;
  • габариты, Ш × Г × В, см — 500 х 605 х 305;
  • вес, кг – 35.
-------------------------------

* FSC (Forward Scatter) – прямое светорассеивание.
** SSC (Side Scatter) – боковое светорассеивание.
***MESF (Molecules of Equivalent Soluble Fluorochrome) – число молекул указанного эквивалентного растворимого флуорохрома.


См. также:

Проточный цитофлуориметр, до 5 лазеров, до 27 флуоресцентных каналов, ZE5, Bio-Rad

Сортер клеток, до 3 лазеров, до 4 флуоресцентных параметров, S3e, Bio-Rad

Антитела

Центрифуги

Диссоциатор клеточный DSC-400, RWD, Китай

  • Проточный цитофлуориметр, 1 лазер, до 5 флуоресцентных каналов, 7S
SinoCyte
По запросу
По запросу

Проточный цитометр SinoCyte от BioSino представляет собой высокопроизводительную, компактную и удобную в использовании систему с поддержкой до трех каналов и 15 параметров флуоресценции. Благодаря широкому спектру применения проточный цитометр SinoCyt является мощным инструментом для исследователей в различных областях, включая онкологию, иммунологию, исследования стволовых клеток, клеточную биологию, океанографию, мониторинг окружающей среды и клиническую диагностику.

Области применения

  • Онкология и гематология: анализ клеток крови, обнаружение дендритных клеток, цитотоксических Т-клеток, Т-клеточных рецепторов и Р-селектина.
  • Иммунология: обнаружение пролиферирующих Т-клеток, изотипов иммуноглобулинов, NK-клеток и регуляторных Т-клеток.
  • Стволовые клетки: анализ гемопоэтических стволовых клеток, обнаружение CAR-T-клеток и анализ мезенхимальных стромальных клеток
  • Клеточная биология: клеточная пролиферация, клеточный цикл и анализ апоптоза.
  • Океанография: обнаружение морских микроорганизмов, количественный анализ ДНК и определение содержания липосом в морских водорослях.
  • Мониторинг окружающей среды: обнаружение живых и мертвых бактерий, абсолютное количественное определение вирусов, бактерий и микроводорослей, выявление бактериальной плоидности и классификация микроводорослей.
  • Клиническая диагностика: анализ субпопуляций лимфоцитов, нейтрофилов регуляторных Т-клеток, активация Т-клеток, определение блокирующих антител, определение цитокинов, подсчет гемопоэтических стволовых клеток, иммунофенотипирование лимфом, анализ клеточного цикла и полиплоидии, выявление очагов лейкемии.

Технические характеристики

  • Лазеры — до 3х одновременно из 3 доступных: 405 нм (100 мВт), 488 нм (60 мВт), 637 нм (80 мВт);
  • каналы детекции:
    • 488 лазер: FSC, SSC, 525 нм, 575 нм, 620 нм, 697 нм, 780 нм (7 параметров);
    • 638 лазер: 670 нм, 720 нм, 780 нм (3 параметра);
    • 405 лазер: 425 нм, 460 нм, 525 нм, 605 нм, 660 нм, 720 нм, 780 нм, VSC 8 параметров), VSC (Violet side scater);
  • чувствительность, MESF¹ — FITC <50; PE <30; APC <30;
  • формат загрузки — пробирки размерами от 17 x 100 мм до 8,5 x 45 мм (включая стандартные пробирки на 1,5, 2 и 5 мл), опциональный автозагрузчик для 40- и 96-луночных планшетов;
  • размер частиц от 0,2 до 50 мкм;
  • скорость сбора данных, события / с — до 50000;
  • скорость потока, мкл / сек — 15-120;
  • метод определения концентрации клеток — прямой подсчет;
  • габариты, Ш × Г × В — 760 × 450 × 470 мм;
  • вес, кг — 40.
¹MESF, molecules of equivalent soluble fluorochrome — число молекул эквивалентного растворимого флуорохрома.

Таблица. Конфигурации прибора

Лазер

Канали детекции

Фильтры

Красители

3 лазера.
Макс. 15 цветов

2 лазера.
Макс. 8 цветов

1 лазер.
Макс. 5 цветов

488 нм

BL1

525/40

FITC, EGFP, BB515

Alexa Fluor 488


BL2

575/30

PE, DsRed


BL3

620/30

PE-Texas Red, ECD, PE-CF594, PI, 7-AAD


BL4

697/60

PerCP, PE-Cy5, PE-Cy5.5, BB700, PerCP-eFlour710


BL5

780/60

PE-Cy7, PE-Alexa Fluor 750

638 нм

RL1

670/20

APC, Cy5, Alexa Fluor 647

RL2

720/40

APC-R700, Alexa Fluor 680, Alexa Fluor 700

RL3

780/60

APC-Cy7, APC-eFluor 780, APC-H7

VL1

425/20

BV421


VL2

460/40

Pcific Blue, V450, BV480

405 нм

VL3

525/40

BV510, V500

VL4

605/40

BV605

VL5

660/40

BV650

VL6

720/40

BV711

VL7

780/60

BV768, BV750

См. также:

Иммунофенотипирование клеток крови

Проточный цитофлуориметр 7S (ZS-AE7S) для рутинных задач

Проточная цитометрия в биотехнологическом производстве

Определение плоидности клеток растений методом проточной цитометрии



Ниже вы можете задать вопрос или оставить запрос в свободной форме:

Раскрыть анкету для отправки запроса

Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!