Наборы реагентов для систем секвенирования NextSeq 2000 представляют собой высокопроизводительную реагентную систему нового поколения, разработанную для максимальной эффективности на платформе средней производительности Illumina. Комплектация включает три готовых к установке автономных картриджа: реагентный картридж, содержащий модифицированные нуклеотиды с обратимыми терминаторами и высокопроцессивную ДНК-полимеразу с корректурной активностью; проточную ячейку с оптимизированной поверхностной химией, обеспечивающей высокую плотность посадки кластеров и равномерное покрытие; и буферный картридж.
Благодаря увеличенной пропускной способности и усовершенствованной химии набора, данный продукт находит применение в широчайшем спектре исследовательских задач, демонстрируя высокие показатели производительности в различных типах экспериментов:
- полноэкзомное секвенирование (WES): при стандартной глубине покрытия 90× и выходе 8 Гб данных на образец, набор позволяет обрабатывать до 30 образцов за единичный запуск, что делает его оптимальным инструментом для клинических исследований и скрининга наследственных заболеваний;
- профилирование транскриптома (RNA-Seq): при стандартной глубине 50 млн парных ридов на образец, производительность достигает 24 образцов за запуск, обеспечивая высокую чувствительность детекции низкоэкспрессируемых транскриптов и изоформных вариантов;
- секвенирование мРНК (mRNA-Seq): при 25 млн парных ридов на образец, набор позволяет обрабатывать до 48 образцов за запуск, что существенно снижает стоимость полнотранскриптомного анализа в масштабных экспериментах и обеспечивает статистически значимую мощность. дифференциальной экспрессии.
Таким образом, единая реагентная схема обеспечивает универсальность применения — от количественного анализа экспрессии генов и детекции альтернативного сплайсинга до выявления редких клинически значимых вариантов в экзоме и идентификации соматических мутаций в онкогенных панелях.
Характеристики
- Качество секвенирования — ≥ 90% оснований имеют качество выше Q30;
- время запуска, ч — 31;
- количество данных на одну проточную ячейку за запуск, Гб — 240.
Срок годности и температура хранения компонентов набора:
- картридж — от -25 °C до -15 °C, 6 месяцев;
- ячейка — 2-8 °C, 6 месяцев;
- RSB (картридж с буферами) с Tween 20 — 2-8 °C, 6 месяцев.
