Вернуться назад

Набор для прямого секвенирования РНК, Direct RNA Sequencing Kit

Артикул Цена Наличие Количество
SQK-RNA002 862,= USD 54 932 Под заказ

Набор предназначен для прямого секвенирования РНК без стадии обратной транскрипции. С помощью набора Direct RNA Sequencing Kit можно:
  • изучать модифицированные нуклеотиды и другие характеристики нативной РНК;
  • секвенировать молекулы РНК, которые плохо подвергаются обратной транскрипции.

Особенности набора

время пробоподготовки

от 115 минут

требуемое количество ДНК

500 нг поли-А+ РНК

необходимость ПЦР

нет

обратная транскрипция

опциональная

длина рида

зависит от длины исходных фрагментов

производительность

до 1 гигабазы за 6 часов, 1-4 гигабазы за 48 часов

совместимые протоколы

Direct RNA Sequencing;
Sequence-specific direct RNA sequencing*

мультиплексирование

на стадии разработки

количество библиотек

6

совместимость с проточными ячейками

FLO-MIN106D; FLO-MIN107

* Полные протоколы доступны на сайте www.nanoporetech.com для зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Набор предназначен для работы с молекулами РНК, обладающими 3’-концевыми полиА –структурами — эукариотическими мРНК, полиаденилированными вирусными РНК или РНК, обработанными наборами для полиаденилирования. Для РНК без полиА-концов можно синтезировать пользовательские адаптеры, комплементарные 3’-концам (например, для тРНК или 16S-РНК).

В отличие от протоколов секвенирования кДНК, в случае использования набора Direct RNA Sequencing Kit происходит секвенирование нативных молекул РНК; только они проходят через поры проточной ячейки.

Стадия обратной транскрипции при пробоподготовке опциональна, но настоятельно рекомендуется — это повышает производительность секвенирования.

Набор Direct RNA Sequencing Kit незаменим в случае анализа модифицированных нуклеотидов. Если задача выявления таких нуклеотидов не ставится, рекомендуются наборы для секвенирования кДНК, так как они обеспечивают более высокую производительность.

Дополнительные расходные материалы и реактивы:
  • магнитные частицы Agencourt RNAClean XP (Beckman Coulter);
  • обратная транскриптаза SuperScript III (Thermo Fisher Scientific, 18080044);
  • ДНК-лигаза T4 в концентрации 2000 ед/мкл (New England Biolabs М0202);
  • лигазный буфер NEBNext Quick Ligation Reaction Buffer (New England Biolabs B6058);
  • 10 мМ раствор dNTP (Thermo Fisher Scientific R0192);
  • 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 0030108051);
  • 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Axygen PCR-02-C);
  • вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher Scientific R0581);
  • свежеприготовленный 70% этанол.
Дополнительное оборудование:
  • настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
  • вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
  • магнитный штатив (Диаэм 3336);
  • ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
  • амплификатор (например, Thermo Fisher Scientific A37834);
  • набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
  • наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
  • термоконтейнер со льдом;
  • таймер (например, TR118OS);
  • флуориметр Qubit 4.0 (Thermo Q33227).

Опционально:

  • система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
  • наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).

  • Набор для прямого секвенирования РНК, Direct RNA Sequencing Kit
Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!