Системы капиллярного электрофореза Qsep. Фрагментный анализ ДНК и РНК

Автоматические системы капиллярного электрофореза Qsep, BiOptic сконструированы для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов — в одном приборе в одну стадию!
qsep 1.jpg qsep 2.jpg qsep 3.png qsep 4.jpg
  • Скрининг ПЦР-продуктов;
  • генотипирование;
  • количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
  • анализ фрагментированности геномной ДНК;
  • анализ внеклеточной ДНК;
  • анализ олигонуклеотидов;
  • анализ продуктов рестриктазного расщепления;
  • оценка целостности РНК (RNA Quality Number).

Электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer (в комплекте поставки).

  • Автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
  • несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
  • время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
  • разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
  • чувствительность — от 100 пг/мкл;
  • объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
  • визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО;
  • низкая себестоимость анализа (по сравнению с аналогичным оборудованием).

Qsep1

Qsep100

Qsep400

Тип прибора

портативный

стационарный

Детекция

флуоресцентная

Связь с ПК

wi-fi

USB

Ток разделения

1-8 КВ

1-15 КВ

Картридж

1-капиллярный

4-капиллярный

Автосэмплер

1-12 образцов

1-96 образцов

С100100 2.png qsep 6.png
Картриджи для капиллярного электрофореза Qsep

Электрофорез биомолекул в системах Qsep происходит в специальных картриджах разных типов, предназначенных для разделения ДНК, РНК и белков.

Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов, зависит от типа прибора). В комплект поставки, кроме картриджа, входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.

Standard (S2)

High Resolution (S1)

Kilobase (S3)

Fast (F3)

High Sensitivity (N1)

RNA (R1)

Диапазон длин разделяемых фрагментов

10 - 15000 п.н.

10 - 15000 п.н.

10 - 23000 п.н.

10 - 5000 п.н.

10 - 5000 п.н.

-

Чувствительность

0,1 нг/мкл

0,1 нг/мкл

0,1 нг/мкл

0,1 нг/мкл

5 пг/мкл

5 пг/мкл

Макс. разрешение

4 - 10 п.н.

1 - 4 п.н.

10 - 50 п.н.

≥ 50 п.н.

≥ 10 п.н.

-

Область применения

Скрининг продуктов ПЦР

+

+

+

RFLP

+

+

+

SNP

+

Плазмидный анализ

+

Анализ библиотек для секвенирования

+

+

Анализ геномной ДНК

+

+

Анализ внеклеточной ДНК

+

Анализ РНК

+

Анализ и контроль CRISPR

+

+

+


Анализ результатов электрофореза:
  • отслеживание разделения фрагментов в режиме реального времени;
  • визуализация фрагментов после разделения в виде геля с окрашенными фрагментами или в виде электрофореграммы;
  • проведение качественного и количественного анализа фрагментов ДНК;
  • проведение оценки качества РНК;
  • получение результатов анализа в виде файлов различных форматов (pdf, Excel, текстовый формат и т.д.).

Развернуть описание # С100100
BiOptic
23 228,57 доллар
___________________________________________________________________________________________________________________________________________
Примеры анализа результатов электрофореза с помощью Q-Analyzer


Количественный и качественный анализ фрагментов ДНК

Анализ ДНК с помощью картриджа S1 (High Resolution) — разделение ПЦР-продуктов с разрешением 2-5 п.н.

Возможна визуализация фрагментов одинаковой длины, но разного нуклеотидного состава в виде раздельных пиков.


Разделение продуктов расщепления плазмиды pBR322 рестриктазой MspI

  1. Высокая чувствительность — идентификация коротких фрагментов в низкой концентрации (15 п.н. — 0,056 нг/мкл; 26 п.н. — 0,194 нг/мкл; 34 п.н. — 0,253 п.н.)

  2. Высокое разрешение — разделение фрагментов с разницей по длине 4 п.н. (238 и 242 п.н.)
  3. Высокое разрешение — разделение фрагментов одинаковой длины (147/147 п.н. и 160/160 п.н.), но разного нуклеотидного состава.

анализ 1.png
анализ 2.png

Анализ ДНК в низких концентрациях

Выявление внеклеточной ДНК с помощью картриджа N1 (High Sensitivity).

Точность измерения сопоставима с таковой на флуориметре Qubit, Thermo Fisher Scientific. Возможна детекция внеклеточной ДНК (фетальной или опухолевой) в плазме крови в концентрации 3-4 нг/мкл.
анализ 3.png

Оценка степени деградации геномной ДНК и идентификация различных форм плазмидной ДНК

анализ 4.png
Анализ целостности РНК

Критерием целостности РНК является показатель RQN (RNA Quality Number), являющийся аналогом RIN (RNA Integrity Number).

Корреляция между RQN и RIN.

анализ 5.1.png
анализ 5.png

Анализ качества NGS-библиотек

С помощью ПО Q-Analyzer можно оценить не только концентрацию отдельных фрагментов ДНК, но и суммарную концентрацию ДНК в определённом диапазоне длин, а также распределение длин фрагментов ДНК.

анализ 6.png

Электрофорез белков в системах Qsep

Кроме фрагментного анализа нуклеиновых кислот системы Qsep100 и Qsep400 могут использоваться для электрофореза белков. Белки в образце должны быть предварительно помечены флуоресцентным красителем Chromeo P503 (в случае Qsep100 Advanced возможно также мечение FITC) и денатурированы.

Построение белкового профиля c помощью Qsep.


С помощью Qsep100 Advanced возможно также разделение пептидов и аминокислот, меченых FITC.анализ 7.2.png
анализ 7.png
анализ 7.1.png
Укажите кат. номер, наименование/фасовку и производителя той продукции, которая вам необходима:

Раскрыть анкету для отправки заказа

Другое лабораторное оборудование и принадлежности: амплификаторы для пцр, анализатор зерна, вытяжной шкаф, дозатор механический одноканальный.