На главную / Новости / Системы капиллярного электрофореза Qsep. Фрагментный анализ ДНК и РНК
Системы капиллярного электрофореза Qsep. Фрагментный анализ ДНК и РНК
Автоматические системы капиллярного электрофореза Qsep, BiOptic сконструированы для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов — в одном приборе в одну стадию!
- Скрининг ПЦР-продуктов;
-
генотипирование;
-
количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
-
анализ фрагментированности геномной ДНК;
-
анализ внеклеточной ДНК;
-
анализ олигонуклеотидов;
-
анализ продуктов рестриктазного расщепления;
-
оценка целостности РНК (RNA Quality Number).
Электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer (в комплекте поставки).
- Автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
-
несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
-
время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
-
разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
-
чувствительность — от 100 пг/мкл;
-
объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
-
визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО;
-
низкая себестоимость анализа (по сравнению с аналогичным оборудованием).
|
|
Qsep1
|
Qsep100
|
Qsep400
|
|
Тип прибора
|
портативный
|
стационарный
|
|
Детекция
|
флуоресцентная
|
|
Связь с ПК
|
wi-fi
|
USB
|
|
Ток разделения
|
1-8 КВ
|
1-15 КВ
|
|
Картридж
|
1-капиллярный
|
4-капиллярный
|
|
Автосэмплер
|
1-12 образцов
|
1-96 образцов
|
|
|
|
|
Картриджи для капиллярного электрофореза Qsep
Электрофорез биомолекул в системах Qsep происходит в специальных картриджах разных типов, предназначенных для разделения ДНК, РНК и белков.
Картридж рассчитан на анализ 100-1200 образцов (100-300 форезов, зависит от типа прибора). В комплект поставки, кроме картриджа, входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.
|
|
|
Standard (S2)
|
High Resolution (S1)
|
Kilobase (S3)
|
Fast (F3)
|
High Sensitivity (N1)
|
RNA (R1)
|
|
Диапазон длин разделяемых фрагментов
|
10 - 15000 п.н.
|
10 - 15000 п.н.
|
10 - 23000 п.н.
|
10 - 5000 п.н.
|
10 - 5000 п.н.
|
-
|
|
Чувствительность
|
0,1 нг/мкл
|
0,1 нг/мкл
|
0,1 нг/мкл
|
0,1 нг/мкл
|
5 пг/мкл
|
5 пг/мкл
|
|
Макс. разрешение
|
4 - 10 п.н.
|
1 - 4 п.н.
|
10 - 50 п.н.
|
≥ 50 п.н.
|
≥ 10 п.н.
|
-
|
|
Область применения
|
|
Скрининг продуктов ПЦР
|
+
|
+
|
|
+
|
|
|
|
RFLP
|
+
|
+
|
|
+
|
|
|
|
SNP
|
|
+
|
|
|
|
|
|
Плазмидный анализ
|
|
|
+
|
|
|
|
|
Анализ библиотек для секвенирования
|
+
|
+
|
|
|
|
|
|
Анализ геномной ДНК
|
+
|
|
+
|
|
|
|
|
Анализ внеклеточной ДНК
|
|
|
|
|
+
|
|
|
Анализ РНК
|
|
|
|
|
|
+
|
|
Анализ и контроль CRISPR
|
+
|
+
|
|
|
|
+
|
Анализ результатов электрофореза:
- отслеживание разделения фрагментов в режиме реального времени;
-
визуализация фрагментов после разделения в виде геля с окрашенными фрагментами или в виде электрофореграммы;
-
проведение качественного и количественного анализа фрагментов ДНК;
-
проведение оценки качества РНК;
-
получение результатов анализа в виде файлов различных форматов (pdf, Excel, текстовый формат и т.д.).
Цена
в валюте производителя /
в рублях
|
|
С100100
|
|
|
|
|
1 590 398,=
24 286,= USD
|
|
|
|
Система капиллярного электрофореза Qsep — это автоматическая платформа для быстрого фрагментного анализа нуклеиновых кислот. Все этапы электрофореза — заливка геля, нанесение образцов, разделение фрагментов, визуализация и анализ результатов, делаются в одном приборе в одну стадию.
Принцип работы: электрофорез происходит в картридже, внутри которого находится капилляр, заполненный гелем с флуорофором для детекции биомолекул. Процесс разделения фрагментов отражается в реальном времени. Анализ результатов производится с помощью ПО Q-Analyzer.
Особенности системы Qsep100:
- автоматическая подача образцов (от 1 до 96);
- несколько типов картриджей для разных молекул (фрагментированная ДНК, геномная ДНК, РНК, белки), рассчитанных на анализ 100-300 образцов;
- время анализа одного образца — от 2 до 7 минут;
- разрешение — 1-4 нуклеотида (в диапазоне длин от 100 до 500 нуклеотидов);
- чувствительность — от 100 пг/мкл;
- объём образца — 1 или 20 мкл, из которых в капилляр вводится 1 пл;
- визуализация, количественный и качественный фрагментный анализ с помощью ПО.
Технические характеристики системы Qsep100:
- габариты, Г × В × Ш, см: 38 х 40 х 30;
- питание: от сети 220 В через адаптер постоянного тока 24 В;
- связь с ПК: USB;
- источник возбуждения флуоресценции: светодиодный, 525 нм (зелёный);
- детекция флуоресценции: 590 нм;
- количество капилляров в картридже: 1;
- ток разделения: 1-15 кВ.
Области применения Qsep:
- скрининг ПЦР-продуктов;
- генотипирование;
- количественный и качественный анализ библиотек для NGS и нанопорового секвенирования;
- анализ фрагментированности геномной ДНК;
- анализ внеклеточной ДНК;
- анализ продуктов рестриктазного расщепления;
- анализ олигонуклеотидов;
- оценка целостности РНК (RNA Quality Number);
- электрофорез белков (необходимо мечение Chromeo-P503).
Комплект поставки: Qsep100: ПО Q-Analyzer Basic, воздушный насос Qairbox, набор 1-канальных картриджей S1 и S2, выравнивающий маркер 20-1000, выравнивающий маркер 20-5000, маркер длин 15-622, маркер длин 50-3000.
Картриджи для системы капиллярного электрофореза Qsep 100:
электрофорез в Qsep происходит в картриджах разных типов для разделения ДНК, РНК и белков. Картридж рассчитан на анализ 100-300 образцов. В комплект поставки входят все необходимые расходные материалы для электрофореза — буфер для разделения, буфер для разведения образцов, пробирки в стрипах, ванночки и пипетки для буфера, выравнивающий маркер.
|
|
Standard (S2)
|
High Resolution (S1)
|
Kilobase (S3)
|
Fast (F3)
|
High Sensitivity (N1)
|
RNA (R1)
|
|
Тип анализируемой молекулы
|
ДНК
|
ДНК
|
ДНК
|
ДНК
|
ДНК
|
РНК
|
|
Диапазон длин разделяемых фрагментов
|
10-15000 п.н.
|
10-15000 п.н.
|
10-23000 п.н.
|
10-5000 п.н.
|
10-5000 п.н.
|
-
|
|
Чувствительность
|
0,1 нг/мкл
|
0,1 нг/мкл
|
0,1 нг/мкл
|
0,1 нг/мкл
|
5 пг/мкл
|
5 пг/мкл
|
|
Макс. разрешение
|
4-10 п.н.
|
1-4 п.н.
|
10-50 п.н.
|
≥ 50 п.н.
|
≥ 10 п.н.
|
-
|
Время анализа одного образца |
2-3 мин
|
3-5 мин
|
5-9 мин
|
1-2 мин
|
3-5 мин
|
5-10 мин
|
Количество образцов (на 1 картридж) |
200
|
200
|
200
|
300
|
100
|
100
|
|
Область применения
|
|
Скрининг продуктов ПЦР
|
+
|
+
|
|
+
|
|
|
|
RFLP
|
+
|
+
|
|
+
|
|
|
|
SNP
|
|
+
|
|
|
|
|
|
Плазмидный анализ
|
|
|
+
|
|
|
|
|
Анализ библиотек для секвенирования
|
+
|
+
|
|
|
|
|
|
Анализ геномной ДНК
|
+
|
|
+
|
|
|
|
|
Анализ внеклеточной ДНК
|
|
|
|
|
+
|
|
|
Анализ РНК
|
|
|
|
|
|
+
|
|
Анализ и контроль CRISPR
|
+
|
+
|
|
|
|
+
|
|
|
___________________________________________________________________________________________________________________________________________
Примеры анализа результатов электрофореза с помощью Q-Analyzer
Количественный и качественный анализ фрагментов ДНК
Анализ ДНК с помощью картриджа S1 (High Resolution) — разделение ПЦР-продуктов с разрешением 2-5 п.н.
Возможна визуализация фрагментов одинаковой длины, но разного нуклеотидного состава в виде раздельных пиков.
Разделение продуктов расщепления плазмиды pBR322 рестриктазой MspI
-
Высокая чувствительность — идентификация коротких фрагментов в низкой концентрации (15 п.н. — 0,056 нг/мкл; 26 п.н. — 0,194 нг/мкл; 34 п.н. — 0,253 п.н.)
- Высокое разрешение — разделение фрагментов с разницей по длине 4 п.н. (238 и 242 п.н.)
-
Высокое разрешение — разделение фрагментов одинаковой длины (147/147 п.н. и 160/160 п.н.), но разного нуклеотидного состава.
|
|
Анализ ДНК в низких концентрациях
Выявление внеклеточной ДНК с помощью картриджа N1 (High Sensitivity).
Точность измерения сопоставима с таковой на флуориметре Qubit, Thermo Fisher Scientific. Возможна детекция внеклеточной ДНК (фетальной или опухолевой) в плазме крови в концентрации 3-4 нг/мкл.
|
|
Оценка степени деградации геномной ДНК и идентификация различных форм плазмидной ДНК
|
|
|
Анализ целостности РНК
Критерием целостности РНК является показатель RQN (RNA Quality Number), являющийся аналогом RIN (RNA Integrity Number).
Корреляция между RQN и RIN.
|
|
|
Анализ качества NGS-библиотек
С помощью ПО Q-Analyzer можно оценить не только концентрацию отдельных фрагментов ДНК, но и суммарную концентрацию ДНК в определённом диапазоне длин, а также распределение длин фрагментов ДНК.
|
|
Электрофорез белков в системах Qsep
Кроме фрагментного анализа нуклеиновых кислот системы Qsep100 и Qsep400 могут использоваться для электрофореза белков. Белки в образце должны быть предварительно помечены флуоресцентным красителем Chromeo P503 (в случае Qsep100 Advanced возможно также мечение FITC) и денатурированы.
Построение белкового профиля c помощью Qsep.
С помощью Qsep100 Advanced возможно также разделение пептидов и аминокислот, меченых FITC.
|
|
|
