Секвенирование транскриптома – решения Ion Torrent, Thermo Fisher Scientific


3.png f401756505505354af0b6a6a0d5cf80f.jpg











4.jpg Подходит для работы с FFPE-образцами

Выявление распространенных и редких транскриптов в FFPE-образцах с использованием всего лишь 10 нг исходной РНК с помощью процедуры анализа транскриптома Ion AmpliSeq.
5.png Быстрый рабочий процесс

От РНК до количественных данных менее чем за 2 дня без лишнего ожидания большого количества образцов.
6.jpg Простой анализ

Используйте Torrent Suite и соответствующие плагины или существующие алгоритмы анализа данных высокопроизводительного секвенирования или ДНК-микрочипов для удобного автоматизированного анализа дифференциальной экспрессии генов.
7.jpg Улучшенные технические характеристики

Чувствительность, превосходящая ДНК-микрочипы, для обнаружения дифференциально экспрессируемых генов с высокой корреляцией с MAQC-данными, полученными на микрочипах и с помощью кПЦР.
8.jpg Гибкость

Исследуйте профили дифференциальной экспрессии генов и открывайте новые биомаркеры с помощью единой мощной платформы для секвенирования.

Выбор панелей AmpliSeq >>>
Решения для секвенирования транскриптома, Thermo Fisher Scientific, брошюра, русск. яз., 12 стр.
Информация для заказа:
Пока нет данных. Перейти в каталог
Цена в валюте производителя / в рублях
A27212
По запросу
По запросу

Простой рабочий процесс для анализа панелей генов, микробных геномов, экзомов и транскриптомов.
  • Принцип работы — полупроводниковое секвенирование — встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;
  • не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;
  • точность анализа, % — 99,9;
  • полученные результаты обсчитываются серверной станцией;
  • длина рида, п.н. — 200 или 400;
  • длительность запуска — 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);
  • количество прочтений, млн.:
Ion 520 — 3-5;
Ion 530 — 15-18;
Ion 540 — 60-80.
  • гибкая система чипов разной производительности, п.н.:
Ion 520 — 0,6-1 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 1,2-2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);
Ion 530 — 3-3,5 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 6-7,2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);
Ion 540 — 10-15 млрд. (при длине рида 200 п.н.).
  • длительность анализа:
Ion 520 — 5 ч (при длине рида 200 п.н.), 8 ч (при длине рида 400 п.н.);
Ion 530 — 8 ч (при длине рида 200 п.н.), 17,5 ч (при длине рида 400 п.н.);
Ion 540 — 16,5 ч (при длине рида 200 п.н.).
  • габариты, ШхГхВ, мм — 542×806×509;
  • вес нетто/ брутто, кг — 63,5/90,7.
Особенности:
  • менее 15 минут ручного труда для запуска секвенатора, менее 45 минут ручного труда для процедуры таргетного секвенирования от ДНК до результатов;
  • запуск секвенатора длится от 2,5 до 4 часов, от ДНК до результатов всего 24 часа;
  • небольшое количество стартового материала: 10 нг HK или РНК невысокого качества достаточно для получения полного списка мутаций или профиля экспрессии генов;
  • масштабируемость: один секвенатор для разнообразных экспериментальных задач, несколько форматов чипов для соответствия изменяющимся требованиям научных исследований.
Основные применения:
  • исследования рака: обнаружение химерных транскриптов в образцах тканей, исследование однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), инсерций и делеций, изменения числа копий генов (CNV), уровней экспрессии генов, используя 10 нг FFPE ДНК или РНК.
  • исследования наследственных заболеваний: изучение мутаций, связанных с метаболизмом лекарст, секвенирование больших и малых панелей генов, обнаружение SNP, инсерции и делеции, а также CNV, связанных с редкими или неизвестными болезнями, с помощью полноэкзомного секвенирования;
  • исследования инфекционных заболеваний: идентификация и генотипирование микроорганизмов с помощью полногеномного секвенирования, определение мутаций, ответственные за устойчивость к антибиотикам;
  • исследование анеуплоидий: высокопроизводительное определение анеуплоидий и числа копий генов.
Аксессуары и опции: панели AmliSeq, наборы реагентов, чипы для секвенирования Ion 520, Ion 530 и Ion 540.

Вспомогательное оборудование: станция пробоподготовки Ion Chef, станция пробоподготовки OneTouch 2, термоциклеры; микроцентрифуга для чипов, микроцентрифуги, центрифуги-вортексы, вортекс, флуориметр Qubit 3.0; гомогенизатор, системы препаративного электрофореза, магнитные штативы, источник бесперебойного питания, твердотельные термостаты, мембранный насос, пипетки, штативы.

Комплект поставки, чипы, наборы. реагенты и расходные материалы — по запросу.

Выбрать панели AmliSeq >>>

Видео:

Технология Ion Torrent



Секвенаторы Ion S5 и S5XL, рабочий процесс



Секвенаторы Ion S5 и S5XL, сновные преимущества



A27214
По запросу
По запросу

Простой и быстрый рабочий процесс для анализа панелей генов, микробных геномов, экзомов и транскриптомов.
  • Принцип работы — полупроводниковое секвенирование — встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;
  • не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;
  • точность анализа, % — 99,9;
  • полученные результаты обсчитываются серверной станцией;
  • длина рида, п.н. — 200 или 400;
  • длительность запуска — 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);
  • количество прочтений, млн.:
Ion 520 — 3-5;
Ion 530 — 15-18;
Ion 540 — 60-80.
  • гибкая система чипов разной производительности, п.н.:
Ion 520 — 0,6-1 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 1,2-2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);
Ion 530 — 3-3,5 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 6-7,2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);
Ion 540 — 10-15 млрд. (при длине рида 200 п.н.).
  • длительность анализа:
Ion 520 — 1 ч (при длине рида 200 п.н.), 2 ч (при длине рида 400 п.н.);
Ion 530 — 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);
Ion 540 — 5 ч (при длине рида 200 п.н.).
  • габариты, ШхГхВ, мм — 542×806×509;
  • вес нетто/ брутто, кг — 63,5/90,7.
Характеристики сервера:
  • конфигурация — отдельный стационарный компьютер в корпусе «tower», который поставляется вместе с системой Ion S5 XL;
  • ПО Torrent Suite со всеми необходимыми компонентами для обработки сигналов, определения последовательности оснований, выравнивания прочтений и определения мутаций;
  • процессор — E5-2680 v3 или лучше;
  • оперативная память — не менее 128 GB;
  • процессор GPU — NVIDIA K40;
  • хранение данных (приблизительтно) — доступно 28 TB;
  • операционная система — Система Ubuntu;
  • формат данных — стандартные форматы выходных данных FASTQ, SFF, BAM и VCF;
  • габариты, ШхГхВ, мм — 216×566×566;
  • вес, кг — 45.
Особенности:
  • менее 15 минут ручного труда для запуска секвенатора, менее 45 минут ручного труда для процедуры таргетного секвенирования от ДНК до результатов;
  • запуск секвенатора длится от 2,5 до 4 часов, от ДНК до результатов всего 24 часа;
  • небольшое количество стартового материала: 10 нг HK или РНК невысокого качества достаточно для получения полного списка мутаций или профиля экспрессии генов;
  • масштабируемость: один секвенатор для разнообразных экспериментальных задач, несколько форматов чипов для соответствия изменяющимся требованиям научных исследований.
Основные применения:
  • исследования рака: обнаружение химерных транскриптов в образцах тканей, исследование однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), инсерций и делеций, изменения числа копий генов (CNV), уровней экспрессии генов, используя 10 нг FFPE ДНК или РНК.
  • исследования наследственных заболеваний: изучение мутаций, связанных с метаболизмом лекарст, секвенирование больших и малых панелей генов, обнаружение SNP, инсерции и делеции, а также CNV, связанных с редкими или неизвестными болезнями, с помощью полноэкзомного секвенирования;
  • исследования инфекционных заболеваний: идентификация и генотипирование микроорганизмов с помощью полногеномного секвенирования, определение мутаций, ответственные за устойчивость к антибиотикам;
  • исследование анеуплоидий: высокопроизводительное определение анеуплоидий и числа копий генов.
Аксессуары и опции: панели AmliSeq, наборы реагентов, чипы для секвенирования Ion 520, Ion 530 и Ion 540.

Вспомогательное оборудование: станция пробоподготовки Ion Chef, станция пробоподготовки OneTouch 2, термоциклеры; микроцентрифуга для чипов, микроцентрифуги, центрифуги-вортексы, вортекс, флуориметр Qubit 3.0; гомогенизатор, системы препаративного электрофореза, магнитные штативы, источник бесперебойного питания, твердотельные термостаты, мембранный насос, пипетки, штативы.


Комплект поставки, чипы, наборы. реагенты и расходные материалы — по запросу.

Выбрать панели AmliSeq >>>

Скачать материалы pdf:

Секвенаторы Ion S5 и S5XL, Thermo Fisher Scientific, брошюра, русск, 12 стр. >>>
Секвенаторы Ion S5 и S5XL, Thermo Fisher Scientific, листовка, русск, 2 стр. >>>
Секвенаторы Ion S5 и S5XL, Thermo Fisher Scientific, спецификация, русск, 2 стр. >>>
Система Ion Chef, Thermo Fisher Scientific, листовка, русск, 2 стр. >>>
Система One Touch 2, Thermo Fisher Scientific, листовка, англ, 2 стр. >>>
Компьютерная система Ion Reporter Server, Thermo Fisher Scientific, листовка, англ, 2 стр. >>>

Видео:

Технология Ion Torrent




Секвенаторы Ion S5 и S5XL, рабочий процесс



Секвенаторы Ion S5 и S5XL, сновные преимущества


IonTorrent PGM
По запросу
По запросу

Настольный “персональный” NGS-секвенатор:

  • ключевая особенность данного прибора – это встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;
  • не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;
  • точность анализа, % — 99,9;
  • полученные результаты обсчитываются серверной станцией;
  • гибкая система чипов разной производительности, п.н.:
  • Ion 314 - до 40х106;
    Ion 316 - до 400х106;
    Ion 318 - до 2х109;
  • производительность до 200 последовательностей за 2 часа;
  • длина чтения, п.н. — до 400;
  • производительность за запуск, п.н. — 1 х 109;
  • общее время запуска — менее 2 часов;
  • габариты, ШхГхВ, мм — 610 х 510 х 530;
  • вес нетто/ брутто, кг — 30/39.

Основные применения:

  • секвенирование de novo;
  • референсное картирование геномов микроорганизмов;
  • идентификация видов при shotgun-секвенировании;
  • типирование бактерий и вирусов;
  • идентификация мутаций;
  • исследования таксономической принадлежности по 16S РНК;
  • метагеномные исследования;
  • общее время запуска — менее 2 ч.

Аксессуары и опции: серверная станция Torrent Server, набор реагентов, чипы для секвенирования Ion 314, Ion 316 и Ion 318, станция автоматической пробоподготовки Ion OneTouch 2 (позволяет подготовить образцы для секвенирования за 5 - 7 часов); станция автоматической пробоподготовки Ion Chef Avalanche (конец 2013, ожидается, что позволит сократить время пробоподготовки до 2 часов).


Вспомогательное оборудование: термоциклеры; проточный цитофлуориметры; гомогенизатор универсальный Ultra - Turrax Tube Drive для пробирок 2—50 мл, IKA; станция пробоподготовки OneTouch, станция пробоподготовки Ion Chef.


Комплект поставки, реагенты и расходные материалы — по запросу.




IonTorrent IonProton
По запросу
По запросу

Настольный высокопроизводительный секвенатор полупроводникового секвенирования.


  • Ключевая особенность данного прибора – это встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;
  • не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;
  • точность анализа, % — 99,9;
  • полученные результаты обсчитываются серверной станцией;
  • имеет чипы разной производительности, п.н.:
  • Ion Proton I - до 10х109;
    Ion Proton II - до 100х109 (ожидается в 2013 году);
    Ion Proton III - до 250х109 (ожидается в 2014 году);
  • производительность до 200 последовательностей за 2 часа;
  • длина чтения, п.н.- до 200;
  • производительность за запуск, п.н. — 1 х 109;
  • общее время запуска — менее 2 часов.



Аксессуары и опции: серверная станция Torrent Server, набор реагентов, чипы для секвенирования Ion 314, Ion 316 и Ion 318, станция автоматической пробоподготовки Ion OneTouch 2 (позволяет подготовить образцы для секвенирования за 5 - 7 часов); станция автоматической пробоподготовки Ion Chef Avalanche (конец 2013, ожидается, что позволит сократить время пробоподготовки до 2 часов).


Вспомогательное оборудование: термоциклеры; проточный цитофлуориметры; гомогенизатор универсальный Ultra - Turrax Tube Drive для пробирок 2—50 мл, IKA.


Комплект поставки, реагенты и расходные материалы — по запросу.




4484177
По запросу
По запросу

  • упрощает и автоматизирует процесс подготовки матрицы и загрузки чипов;
  • помогает снизить вариабельность получаемых результатов для пользователей любого уровня;
  • помогает экономить время и силы — на ручную подготовку запуска уходит всего 15 минут, за один запуск система загружает один или два полупроводниковых чипа Ion для секвенирования;
  • совместимость с секвенаторами — Ion S5, Ion S5 XL, Ion Proton и Ion PGM;
  • совместимость с чипами — все полупроводниковые чипы Ion;
  • совместимость с библиотеками — подходит для подготовки матриц для широкого спектра ДНК- и РНК-библиотек, в том числе библиотек Ion AmpliSeq;
  • габариты, ШхГхВ, мм — 711×548×706;
  • вес, кг — 80.
5.jpg

Скачать материалы pdf:

Система Ion Chef, Thermo Fisher Scientific, листовка, русск, 2 стр. >>>

Видео:

Система Ion Chef предоставляет свободу, рабочий процесс


Раскрыть анкету для отправки заказа

Ваш заказ будет обработан
в ближайшее время.
Мы пришлем уведомление, как только все будет готово. Спасибо!