Секвенаторы ДНК 2-го поколения NGS Выбраны параметры: Cygnus Biosciences

Система для секвенирования P1000 — высокопроизводительный секвенатор от Cygnus Biosciences с производительностью до 2 ТБ данных в сутки. Благодаря технологии LumoSeq, которая является инновационным методом связывания флуоресцентной метки, обеспечивает получение длинных ридов без «молекулярных шрамов» после отщепления нуклеотидов, что повышает точность данных. При помощи технологии AttoSeal Microfluidics реализует секвенирование в ультрамалых объемах, где реагенты доставляются в ячейку через инертную масляную фазу, что снижает их расход и повышает рентабельность. В сочетании с высокоточная полимеразой и интегрированной химической реакции, при которой синтез и считывание происходят в одном процессе, улучшается детекция сигналов и обеспечивается высокая скорость работы, что гарантирует высочайшую надежность результатов.

Основные применения системы секвенирования P1000:

• полногеномное секвенирование (WGS);
• секвенирование экзомов (WES);
• РНК- секвенирование единичных клеток (scRNA-seq);
• пространственное секвенирование транскриптома;
• секвенирование метилома;
• таргетное секвенирование (TB-tNGS).

Характеристики системы секвенирования P1000

• Количество рабочих ячеек секвенатора, шт. — 2;
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана — наличие;
• количество типов нуклеотидов, одновременно подаваемых в реакционный модуль в каждом цикле секвенирования, нуклеотида — 4;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, ГБ — 2000;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов — 150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
• максимальное время, необходимое для полного цикла работы прибора (включая генерацию кластеров, секвенирование ДНК и первичный анализ данных), ч — 8;
• поддержка библиотек TruSeq и Nextera;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q40) — 90% оснований с точностью прочтения 99,9%;
• требования к сети — 220 В; 50/60 Гц;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм —980×1750×940;
• вес, кг — 680.

Комплектация системы секвенирования P1000:

• секвенатор;
• стартовый набор для инсталляции и обучения;
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК;
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

S100 — это настольный секвенатор, отличающийся компактным размером, интуитивно понятным управлением, высокой точностью секвенирования, гибкостью адаптации к различным сценариям и широким спектром выполняемых задач. Единственный прибор для массового параллельного секвенирования, в котором внедрен алгоритм коррекции ошибок (Error Correction Code), что позволяет повысить точность секвенирования в 10 раз.

Генерации кластеров ДНК и секвенирование осуществляются в одном приборе, без выполнения ручных операций. Два режима секвенирования: сверхбыстрый (BitSeq), подходящий для определения количественной структуры цепи (делеции, дупликации, небольшие CNV) и сверхточный (ECC), подходящий и для детекции низкочастотных вариантов.

Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.

Основные применения секвенатора S100

• Таргетное секвенирование (ампликоны, панели генов);
• секвенирование транскриптомов;
• метагеномное секвенирование;
• детекция низкочастотных вариантов;
• анализ степени метилирования ДНК;
• анализ ДНК-белковых взаимодействий;
• секвенирование свободно-циркулирующей ДНК;
• НИПТ, ПГТ-А;
• секвенирование экзома;
• полноэкзомное секвенирование.

Характеристики секвенатора S100

• Количество рабочих ячеек секвенатора, шт. — 1;
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку, млн — 200;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, Гб — 30;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов —150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
• совместимость с библиотеками для секвенирования на платформах Illumina, Ion Torrent;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q40) больше 80% оснований с точностью прочтения 99,99%;
• требования к сети — 220 В; 50 Гц;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 550×650×650;
• вес инструмента, кг ≤ 80.

Комплектация:

• секвенатор;
• стартовый набор для инсталляции и обучения;
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК (Операционная система — Windows 10 Pro, CPU：2,4 GHz*2. Память: 128 GB; Hard Disk 1 TB;
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).